CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp1 : Mut = V84del

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp184V84delV84deldelGTT---53437534371515-517

Details of the mutation V84del within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp184V84delGTT---5343753437All0.01022
ORF1ab/nsp184V84delGTT---1151511515B.1.617.20.043359
ORF1ab/nsp184V84delGTT---72847284AY.40.011337
ORF1ab/nsp184V84delGTT---42054205B.1.1.70.003764
ORF1ab/nsp184V84delGTT---31523152AY.250.018959
ORF1ab/nsp184V84delGTT---26322632AY.260.074512
ORF1ab/nsp184V84delGTT---18041804AY.430.007993
ORF1ab/nsp184V84delGTT---18011801AY.30.017913
ORF1ab/nsp184V84delGTT---13321332AY.440.008108
ORF1ab/nsp184V84delGTT---944944AY.1030.005861
ORF1ab/nsp184V84delGTT---703703B.1.6210.062229
ORF1ab/nsp184V84delGTT---634634AY.750.035518
ORF1ab/nsp184V84delGTT---631631AY.4.20.013686
ORF1ab/nsp184V84delGTT---611611AY.200.023747
ORF1ab/nsp184V84delGTT---597597B.1.4290.014047
ORF1ab/nsp184V84delGTT---574574AY.1200.021341
ORF1ab/nsp184V84delGTT---539539AY.390.013319
ORF1ab/nsp184V84delGTT---519519AY.470.016144
ORF1ab/nsp184V84delGTT---453453B.1.20.003989
ORF1ab/nsp184V84delGTT---402402AY.50.008301
ORF1ab/nsp184V84delGTT---389389AY.140.034237
ORF1ab/nsp184V84delGTT---369369B.10.00338
ORF1ab/nsp184V84delGTT---330330B.1.5260.007756
ORF1ab/nsp184V84delGTT---315315P.10.004963
ORF1ab/nsp184V84delGTT---310310AY.1180.019421
ORF1ab/nsp184V84delGTT---298298B.1.4270.015048
ORF1ab/nsp184V84delGTT---282282AY.1020.007477
ORF1ab/nsp184V84delGTT---275275AY.46.60.019857
ORF1ab/nsp184V84delGTT---265265AY.190.302166
ORF1ab/nsp184V84delGTT---264264B.1.1.5190.010484
ORF1ab/nsp184V84delGTT---246246B.1.10.004463
ORF1ab/nsp184V84delGTT---206206AY.39.10.00816
ORF1ab/nsp184V84delGTT---201201AY.80.121818
ORF1ab/nsp184V84delGTT---197197AY.3.10.016796
ORF1ab/nsp184V84delGTT---192192AY.60.007897
ORF1ab/nsp184V84delGTT---191191AY.116.10.059483
ORF1ab/nsp184V84delGTT---187187AY.420.007523
ORF1ab/nsp184V84delGTT---184184AY.1170.015551
ORF1ab/nsp184V84delGTT---180180AY.1190.006355
ORF1ab/nsp184V84delGTT---175175AY.20.062322
ORF1ab/nsp184V84delGTT---175175AY.270.011326
ORF1ab/nsp184V84delGTT---166166AY.46.50.032937
ORF1ab/nsp184V84delGTT---158158B.1.1770.00208
ORF1ab/nsp184V84delGTT---152152AY.290.002398
ORF1ab/nsp184V84delGTT---148148AY.130.023825
ORF1ab/nsp184V84delGTT---147147AY.9.20.005399
ORF1ab/nsp184V84delGTT---137137AY.340.013284
ORF1ab/nsp184V84delGTT---132132AY.460.013739
ORF1ab/nsp184V84delGTT---131131AY.350.030529
ORF1ab/nsp184V84delGTT---131131B.1.6370.009573
ORF1ab/nsp184V84delGTT---130130AY.330.008681
ORF1ab/nsp184V84delGTT---130130AY.46.40.021385
ORF1ab/nsp184V84delGTT---128128B.1.2340.016889
ORF1ab/nsp184V84delGTT---123123AY.120.10.039486
ORF1ab/nsp184V84delGTT---122122AY.90.008247
ORF1ab/nsp184V84delGTT---121121AY.100.064123
ORF1ab/nsp184V84delGTT---120120B.1.1.2140.006655
ORF1ab/nsp184V84delGTT---113113AY.740.013068
ORF1ab/nsp184V84delGTT---106106AY.540.010107
ORF1ab/nsp184V84delGTT---104104P.1.170.016823
ORF1ab/nsp184V84delGTT---102102B.1.3510.003032
ORF1ab/nsp184V84delGTT---8888AY.1130.01253
ORF1ab/nsp184V84delGTT---8888AY.99.20.00811
ORF1ab/nsp184V84delGTT---8787B0.01112
ORF1ab/nsp184V84delGTT---8484AY.1000.003865
ORF1ab/nsp184V84delGTT---8282AY.10.03245
ORF1ab/nsp184V84delGTT---8080AY.9.10.006698
ORF1ab/nsp184V84delGTT---8080P.1.100.021558
ORF1ab/nsp184V84delGTT---7878B.1.177.210.005965
ORF1ab/nsp184V84delGTT---7777AY.7.10.008678
ORF1ab/nsp184V84delGTT---7474AY.70.014504
ORF1ab/nsp184V84delGTT---7373B.1.1600.002277
ORF1ab/nsp184V84delGTT---7272AY.480.033488
ORF1ab/nsp184V84delGTT---6969AY.1140.015946
ORF1ab/nsp184V84delGTT---6868P.1.140.00325
ORF1ab/nsp184V84delGTT---6565AY.650.034648
ORF1ab/nsp184V84delGTT---6464AY.980.005056
ORF1ab/nsp184V84delGTT---6464B.1.2580.004259
ORF1ab/nsp184V84delGTT---6363AY.4.50.006772
ORF1ab/nsp184V84delGTT---6363B.1.1.3180.01901
ORF1ab/nsp184V84delGTT---5858AY.4.2.10.008641
ORF1ab/nsp184V84delGTT---5757B.1.2430.003966
ORF1ab/nsp184V84delGTT---5757B.1.6280.020085
ORF1ab/nsp184V84delGTT---5656AY.230.003906
ORF1ab/nsp184V84delGTT---5656AZ.30.085106
ORF1ab/nsp184V84delGTT---5555AY.160.020881
ORF1ab/nsp184V84delGTT---5555B.1.621.10.02782
ORF1ab/nsp184V84delGTT---5454AY.1110.00989
ORF1ab/nsp184V84delGTT---5252AY.120.016435
ORF1ab/nsp184V84delGTT---5252AY.39.1.10.037681
ORF1ab/nsp184V84delGTT---5050AY.360.007411
ORF1ab/nsp184V84delGTT---4949AY.370.015487
ORF1ab/nsp184V84delGTT---4949C.370.005687
ORF1ab/nsp184V84delGTT---4848AY.1210.006495
ORF1ab/nsp184V84delGTT---4646AY.450.005597
ORF1ab/nsp184V84delGTT---4646AY.75.10.008294
ORF1ab/nsp184V84delGTT---4343AY.530.012363
ORF1ab/nsp184V84delGTT---4343B.1.258.170.004471
ORF1ab/nsp184V84delGTT---4242AY.1100.004733
ORF1ab/nsp184V84delGTT---3939AY.700.008132
ORF1ab/nsp184V84delGTT---3939B.1.5960.003398
ORF1ab/nsp184V84delGTT---3636A.2.50.017964
ORF1ab/nsp184V84delGTT---3636AY.900.024641
ORF1ab/nsp184V84delGTT---3636Q.30.005221
ORF1ab/nsp184V84delGTT---3535AY.1070.016309
ORF1ab/nsp184V84delGTT---3434AY.1050.021865
ORF1ab/nsp184V84delGTT---3434AY.110.045515
ORF1ab/nsp184V84delGTT---3434AY.46.20.021601
ORF1ab/nsp184V84delGTT---3434AY.620.014815
ORF1ab/nsp184V84delGTT---3434B.1.1.500.023082
ORF1ab/nsp184V84delGTT---3232AY.5.30.010796
ORF1ab/nsp184V84delGTT---3232AY.930.008738
ORF1ab/nsp184V84delGTT---3131B.1.1.2220.006324
ORF1ab/nsp184V84delGTT---3030AY.4.10.022124
ORF1ab/nsp184V84delGTT---3030AY.520.02443
ORF1ab/nsp184V84delGTT---3030B.1.6230.016094
ORF1ab/nsp184V84delGTT---2929AY.1060.009712
ORF1ab/nsp184V84delGTT---2828AY.510.025455
ORF1ab/nsp184V84delGTT---2828AY.640.016667
ORF1ab/nsp184V84delGTT---2727AY.920.007756
ORF1ab/nsp184V84delGTT---2626AY.710.012352
ORF1ab/nsp184V84delGTT---2525AY.800.028217
ORF1ab/nsp184V84delGTT---2424AY.380.011982
ORF1ab/nsp184V84delGTT---2424B.1.5250.002716
ORF1ab/nsp184V84delGTT---2323AY.1160.006596
ORF1ab/nsp184V84delGTT---2323B.1.438.10.002467
ORF1ab/nsp184V84delGTT---2323B.400.008379
ORF1ab/nsp184V84delGTT---2222AY.240.009483
ORF1ab/nsp184V84delGTT---2222AY.46.30.020542
ORF1ab/nsp184V84delGTT---2222AY.5.40.006087
ORF1ab/nsp184V84delGTT---2222AY.770.024803
ORF1ab/nsp184V84delGTT---2222R.10.00198
ORF1ab/nsp184V84delGTT---2121AY.610.0022
ORF1ab/nsp184V84delGTT---2121B.1.1.4340.00732
ORF1ab/nsp184V84delGTT---2121B.1.5170.008967
ORF1ab/nsp184V84delGTT---2121D.20.001576
ORF1ab/nsp184V84delGTT---2020AY.1090.014793
ORF1ab/nsp184V84delGTT---2020AY.16.10.009398
ORF1ab/nsp184V84delGTT---2020AY.600.018762
ORF1ab/nsp184V84delGTT---2020AY.940.008853
ORF1ab/nsp184V84delGTT---1818AY.120.2.10.008969
ORF1ab/nsp184V84delGTT---1818AY.4.40.007365
ORF1ab/nsp184V84delGTT---1818B.1.1.700.006139
ORF1ab/nsp184V84delGTT---1717P.20.003173
ORF1ab/nsp184V84delGTT---1616AD.20.003503
ORF1ab/nsp184V84delGTT---1616AU.10.020253
ORF1ab/nsp184V84delGTT---1616AY.7.20.008949
ORF1ab/nsp184V84delGTT---1616B.1.1.2840.001718
ORF1ab/nsp184V84delGTT---1616B.1.1.390.008155
ORF1ab/nsp184V84delGTT---1616B.1.4000.006864
ORF1ab/nsp184V84delGTT---1616P.1.10.005083
ORF1ab/nsp184V84delGTT---1515AY.880.013263
ORF1ab/nsp184V84delGTT---1515B.1.1200.115385
ORF1ab/nsp184V84delGTT---1515P.1.130.013477
ORF1ab/nsp184V84delGTT---1414AY.98.10.000678
ORF1ab/nsp184V84delGTT---1414B.1.4970.004407
ORF1ab/nsp184V84delGTT---1414P.1.160.005238
ORF1ab/nsp184V84delGTT---1313A.150.206349
ORF1ab/nsp184V84delGTT---1313AY.410.003821
ORF1ab/nsp184V84delGTT---1313B.1.1.4160.011765
ORF1ab/nsp184V84delGTT---1313B.1.5750.003944
ORF1ab/nsp184V84delGTT---1313B.1.6090.006232
ORF1ab/nsp184V84delGTT---1212AY.690.00224
ORF1ab/nsp184V84delGTT---1212AY.910.008766
ORF1ab/nsp184V84delGTT---1212B.1.177.540.007277
ORF1ab/nsp184V84delGTT---1212C.36.30.006807
ORF1ab/nsp184V84delGTT---1212P.1.17.10.010499
ORF1ab/nsp184V84delGTT---1111AY.220.023013
ORF1ab/nsp184V84delGTT---1111AY.550.010092
ORF1ab/nsp184V84delGTT---1111B.1.360.001605
ORF1ab/nsp184V84delGTT---1111B.1.5610.004367
ORF1ab/nsp184V84delGTT---1111B.1.5950.002871
ORF1ab/nsp184V84delGTT---1111B.1.617.10.001419
ORF1ab/nsp184V84delGTT---1111P.1.150.002556
ORF1ab/nsp184V84delGTT---1010AY.120.20.012853
ORF1ab/nsp184V84delGTT---1010AY.730.006653
ORF1ab/nsp184V84delGTT---1010B.1.1.3050.03861
ORF1ab/nsp184V84delGTT---1010B.1.1.3690.004462
ORF1ab/nsp184V84delGTT---1010B.1.1.4320.012658
ORF1ab/nsp184V84delGTT---1010B.1.2210.00071
ORF1ab/nsp184V84delGTT---99AY.320.004792
ORF1ab/nsp184V84delGTT---99AY.820.012212
ORF1ab/nsp184V84delGTT---99AY.870.007494
ORF1ab/nsp184V84delGTT---99B.1.1.370.001736
ORF1ab/nsp184V84delGTT---99B.1.160.260.021792
ORF1ab/nsp184V84delGTT---99B.1.2410.007305
ORF1ab/nsp184V84delGTT---99B.1.258.160.01473
ORF1ab/nsp184V84delGTT---99B.1.36.180.003782
ORF1ab/nsp184V84delGTT---99P.1.120.004356
ORF1ab/nsp184V84delGTT---99P.1.70.002874
ORF1ab/nsp184V84delGTT---99Q.10.001137
ORF1ab/nsp184V84delGTT---88AY.1010.003923
ORF1ab/nsp184V84delGTT---88AY.400.007715
ORF1ab/nsp184V84delGTT---88AY.590.004237
ORF1ab/nsp184V84delGTT---88AY.830.013793
ORF1ab/nsp184V84delGTT---88AY.840.0035
ORF1ab/nsp184V84delGTT---88B.1.1.2070.009456
ORF1ab/nsp184V84delGTT---88B.1.1.5230.0125
ORF1ab/nsp184V84delGTT---88B.1.1110.009401
ORF1ab/nsp184V84delGTT---88B.1.177.260.055944
ORF1ab/nsp184V84delGTT---88B.1.177.430.011817
ORF1ab/nsp184V84delGTT---88B.1.177.860.001468
ORF1ab/nsp184V84delGTT---88B.1.214.20.004796
ORF1ab/nsp184V84delGTT---88B.1.3110.002197
ORF1ab/nsp184V84delGTT---88B.1.3490.005718
ORF1ab/nsp184V84delGTT---88B.1.351.50.004796
ORF1ab/nsp184V84delGTT---77A.2.5.20.011006
ORF1ab/nsp184V84delGTT---77A.270.011589
ORF1ab/nsp184V84delGTT---77AY.500.005596
ORF1ab/nsp184V84delGTT---77AY.580.006352
ORF1ab/nsp184V84delGTT---77AY.720.009524
ORF1ab/nsp184V84delGTT---77AY.950.005327
ORF1ab/nsp184V84delGTT---77AY.990.007345
ORF1ab/nsp184V84delGTT---77B.1.1.3040.019663
ORF1ab/nsp184V84delGTT---77B.1.1.3480.005573
ORF1ab/nsp184V84delGTT---77B.1.177.810.001325
ORF1ab/nsp184V84delGTT---77B.1.220.009223
ORF1ab/nsp184V84delGTT---77B.1.2400.001509
ORF1ab/nsp184V84delGTT---77B.1.351.20.002118
ORF1ab/nsp184V84delGTT---77B.1.36.90.022508
ORF1ab/nsp184V84delGTT---77B.1.5510.009032
ORF1ab/nsp184V84delGTT---77B.1.6310.023569
ORF1ab/nsp184V84delGTT---77C.360.006375
ORF1ab/nsp184V84delGTT---66AY.29.10.001323
ORF1ab/nsp184V84delGTT---66AY.34.10.00306
ORF1ab/nsp184V84delGTT---66AY.660.006417
ORF1ab/nsp184V84delGTT---66AY.680.001642
ORF1ab/nsp184V84delGTT---66AY.780.009245
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