CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp1 : Mut = V84V

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp184V84VV84VsyngtTgtG478742560.889075515-517
ORF1ab/nsp184V84VV84VsyngtTgtC47874820.100689515-517
ORF1ab/nsp184V84VV84VsyngtTgtA4787490.0102361515-517

Details of the mutation V84V within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG42564787All0.000814
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC4824787All0.000092
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtA494787All0.000009
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG935935B.1.1.2980.806034
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG681687AY.40.00106
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC6687AY.40.000009
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG350391B.1.617.20.001318
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC41391B.1.617.20.000154
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG277327B.1.1.70.000248
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC46327B.1.1.70.000041
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtA4327B.1.1.70.000004
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG146215AY.430.000647
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC69215AY.430.000306
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG93140AY.440.000566
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtA27140AY.440.000164
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC20140AY.440.000122
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG123124AY.260.003482
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtA1124AY.260.000028
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG105120AY.250.000632
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC15120AY.250.00009
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG107107AY.1200.003978
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG102102AY.30.001015
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG7786AY.1030.000478
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC786AY.1030.000043
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtA286AY.1030.000012
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG8383AY.980.006557
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC7980B.1.6280.027837
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG180B.1.6280.000352
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG6264AY.4.20.001345
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC264AY.4.20.000043
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG5858AY.750.003249
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG3251B.10.000293
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC1251B.10.00011
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtA751B.10.000064
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG5050AY.560.080257
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG3948AY.390.000964
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC948AY.390.000222
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG3438AY.1190.0012
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC438AY.1190.000141
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG3636AY.98.10.001744
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG2332B.1.1770.000303
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC932B.1.1770.000119
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG2930AY.1020.000769
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC130AY.1020.000027
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG2730AY.50.000558
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC330AY.50.000062
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG2230B.1.20.000194
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC830B.1.20.00007
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC1530B.1.5260.000353
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG1330B.1.5260.000306
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtA230B.1.5260.000047
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG2828AY.710.013302
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC2027B.1.10.000363
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG727B.1.10.000127
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG2424B.1.1.5190.000953
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG2323AY.46.60.001661
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG2223AY.610.002305
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtA123AY.610.000105
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG1323B.1.6210.001151
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC923B.1.6210.000797
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtA123B.1.6210.000089
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG2222AY.9.20.000808
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG2121AY.200.000816
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG1919AY.1180.00119
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG1519P.10.000236
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC419P.10.000063
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG1618AY.470.000498
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC218AY.470.000062
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC1618B.1.1.4340.005577
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG218B.1.1.4340.000697
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG1415AY.1000.000644
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC115AY.1000.000046
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG1115B.1.2210.000781
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC415B.1.2210.000284
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG1414AY.240.006034
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG1414AY.290.000221
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG1414B.1.2430.000974
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG814B.1.258.170.000832
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC614B.1.258.170.000624
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG1313AY.39.10.000515
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG1313AY.70.002548
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG912AY.330.000601
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC312AY.330.0002
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG911AY.230.000628
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC211AY.230.000139
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG811B.1.4290.000188
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC311B.1.4290.000071
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG1111D.20.000825
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG1010AY.46.50.001984
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG910AY.60.00037
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC110AY.60.000041
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG1010AY.600.009381
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC1010B.1.177.520.017575
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG99AY.1210.001218
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG89AY.460.000833
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC19AY.460.000104
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC69AY.7.10.000676
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG39AY.7.10.000338
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC99B.1.1.700.00307
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG99P.1.10.002859
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG88AY.120.002528
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG88AY.420.000322
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG77AY.1130.000997
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG77AY.140.000616
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG67AY.4.50.000645
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC17AY.4.50.000107
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG37B.1.2580.0002
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC27B.1.2580.000133
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtA27B.1.2580.000133
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG57R.10.00045
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC27R.10.00018
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG66AY.130.000966
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG66AY.270.000388
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG66AY.450.00073
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG66AY.90.000406
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC66B.1.1.3220.052632
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG66B.1.1040.02214
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG56B.1.177.210.000382
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC16B.1.177.210.000076
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG66B.1.3770.027397
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG66P.1.170.000971
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG55AY.1170.000423
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG55AY.340.000485
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG55AY.700.001043
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG55AY.870.004163
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG45AY.9.10.000335
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC15AY.9.10.000084
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG55B.1.2400.001078
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG44AY.1110.000733
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG44AY.20.001425
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG44AY.3.10.000341
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC34AY.34.10.00153
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG14AY.34.10.00051
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG44AY.350.000932
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG44AY.46.40.000658
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG44AY.740.000463
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG44B0.000511
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG44B.1.1.390.002039
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC44B.1.5610.001588
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG34Q.10.000379
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC14Q.10.000126
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG33A.23.10.002113
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG33AY.1010.001471
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG33AY.1140.000693
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG33AY.16.10.00141
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG33AY.320.001597
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG33AY.360.000445
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC23AY.5.40.000553
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG13AY.5.40.000277
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG33AY.540.000286
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG33AY.590.001589
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG33AY.730.001996
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG23AY.910.001461
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC13AY.910.00073
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG33AY.990.003148
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG33AY.99.10.004658
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG33B.1.1.1290.027523
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG33B.1.1.3180.000905
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC23B.1.1.500.001358
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG13B.1.1.500.000679
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC23B.1.1.630.000772
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG13B.1.1.630.000386
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG33B.1.1600.000094
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG23B.1.3510.000059
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtA13B.1.3510.00003
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG33B.1.351.20.000908
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG33B.1.4250.008982
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG33B.1.6200.002838
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG33C.36.30.001702
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG22AY.1100.000225
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG22AY.116.10.000623
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG22AY.120.10.000642
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG22AY.370.000632
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG22AY.4.40.000818
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG22AY.530.000575
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG22AY.680.000547
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG22AY.7.20.001119
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG22AY.80.001212
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG22AY.800.002257
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG22AY.880.001768
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC12AY.920.000287
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG12AY.920.000287
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG22AY.99.20.000184
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG22B.1.1.2840.000215
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG22B.1.177.720.00678
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG22B.1.360.000292
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG22B.1.4000.000858
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC12B.1.4270.00005
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG12B.1.4270.00005
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG22B.1.5090.001732
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG22B.1.6370.000146
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG22B.30.001661
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG22C.370.000232
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG22P.1.160.000748
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG22P.1.40.001953
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG22P.30.00319
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG22Q.20.001227
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG12Q.80.000165
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC12Q.80.000165
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11A0.000387
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11A.10.000282
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11A.20.000662
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11A.2.30.004739
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11A.270.001656
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11AD.20.000219
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11AU.10.001266
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11AY.100.00053
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11AY.1160.000287
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11AY.120.2.10.000498
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11AY.29.10.000221
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11AY.380.000499
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11AY.39.1.10.000725
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11AY.4.2.10.000149
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11AY.480.000465
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11AY.500.000799
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11AY.640.000595
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11AY.650.000533
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11AY.75.10.00018
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11AY.840.000437
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11AY.890.004902
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11AY.960.002075
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11AZ.50.003509
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11B.1.1.1350.004695
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC11B.1.1.150.013514
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11B.1.1.1610.003534
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11B.1.1.1700.001247
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11B.1.1.2220.000204
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11B.1.1.2310.003096
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11B.1.1.3160.000925
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11B.1.1.330.000421
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11B.1.1.3340.016393
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC11B.1.1.3760.005952
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11B.1.1.3840.02381
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11B.1.1.3850.004464
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11B.1.1.4090.002833
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11B.1.1.520.012195
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11B.1.1.670.004566
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11B.1.160.170.001701
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11B.1.160.210.020408
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtA11B.1.160.220.006757
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC11B.1.160.230.004831
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11B.1.177.160.000664
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC11B.1.177.230.003236
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC11B.1.177.320.00135
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11B.1.177.530.002392
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC11B.1.177.60.000977
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11B.1.177.70.000165
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC11B.1.177.730.000566
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11B.1.177.810.000189
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11B.1.1890.004292
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11B.1.1990.004132
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11B.1.214.20.0006
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11B.1.220.001318
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11B.1.2500.014493
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11B.1.2520.006623
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11B.1.3060.005714
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11B.1.3110.000275
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11B.1.3130.006579
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11B.1.3240.001605
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11B.1.3290.000608
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11B.1.3400.004292
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11B.1.350.008475
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11B.1.36.210.00216
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC11B.1.36.290.000517
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11B.1.36.80.001
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11B.1.3960.000706
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11B.1.5250.000113
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11B.1.5450.014493
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11B.1.5710.009709
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11B.1.5990.00365
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11B.1.6050.005952
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11B.1.617.10.000129
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11B.1.621.10.000506
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11B.1.6230.000536
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11B.1.6270.00202
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11B.290.003509
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11B.490.05
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11C.300.001727
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11C.350.000774
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11C.380.008065
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11L.30.003546
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11P.1.100.000269
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtG11P.1.60.001946