CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp1 : Mut = M85del1

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp185M85del1M85del1delAtg-tg110610580.9566518-520
ORF1ab/nsp185M85del1M85del1delATG-NN1106240.0216998518-520
ORF1ab/nsp185M85del1M85del1delAtG-tN1106110.00994575518-520
ORF1ab/nsp185M85del1M85del1delatGat-110670.00632911518-520
ORF1ab/nsp185M85del1M85del1delAtG-tT110620.00180832518-520
ORF1ab/nsp185M85del1M85del1delaTGa-N110620.00180832518-520
ORF1ab/nsp185M85del1M85del1delATg-Ng110610.000904159518-520
ORF1ab/nsp185M85del1M85del1delaTga-g110610.000904159518-520

Details of the mutation M85del1 within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg10581106All0.000202
ORF1ab/nsp185M85del1ATG-NN241106All0.000005
ORF1ab/nsp185M85del1AtG-tN111106All0.000002
ORF1ab/nsp185M85del1atGat-71106All0.000001
ORF1ab/nsp185M85del1AtG-tT21106All0
ORF1ab/nsp185M85del1aTGa-N21106All0
ORF1ab/nsp185M85del1aTga-g11106All0
ORF1ab/nsp185M85del1ATg-Ng11106All0
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg189189AY.440.00115
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg182184AY.1030.00113
ORF1ab/nsp185M85del1ATG-NN1184AY.1030.000006
ORF1ab/nsp185M85del1AtG-tN1184AY.1030.000006
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg134135AY.250.000806
ORF1ab/nsp185M85del1atGat-1135AY.250.000006
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg126131B.1.617.20.000474
ORF1ab/nsp185M85del1AtG-tN2131B.1.617.20.000008
ORF1ab/nsp185M85del1ATG-NN2131B.1.617.20.000008
ORF1ab/nsp185M85del1atGat-1131B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg7577AY.30.000746
ORF1ab/nsp185M85del1ATG-NN177AY.30.00001
ORF1ab/nsp185M85del1AtG-tN177AY.30.00001
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg5152AY.260.001444
ORF1ab/nsp185M85del1AtG-tN152AY.260.000028
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg2828AY.200.001088
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg2727AY.750.001513
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg2323AY.470.000715
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg2121AY.1190.000741
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg1920AY.140.001672
ORF1ab/nsp185M85del1AtG-tN120AY.140.000088
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg1920AY.390.00047
ORF1ab/nsp185M85del1ATG-NN120AY.390.000025
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg1819B.1.1.70.000016
ORF1ab/nsp185M85del1ATG-NN119B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp185M85del1ATG-NN616AY.40.000009
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg416AY.40.000006
ORF1ab/nsp185M85del1AtG-tN316AY.40.000005
ORF1ab/nsp185M85del1atGat-116AY.40.000002
ORF1ab/nsp185M85del1ATg-Ng116AY.40.000002
ORF1ab/nsp185M85del1AtG-tT116AY.40.000002
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg1212AY.1180.000752
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg912AY.430.00004
ORF1ab/nsp185M85del1ATG-NN312AY.430.000013
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg1111AY.1170.00093
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg99AY.116.10.002803
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg88AY.3.10.000682
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg67AY.130.000966
ORF1ab/nsp185M85del1AtG-tN17AY.130.000161
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg67AY.39.10.000238
ORF1ab/nsp185M85del1ATG-NN17AY.39.10.00004
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg66AY.1130.000854
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg56AY.50.000103
ORF1ab/nsp185M85del1ATG-NN16AY.50.000021
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg56B.1.20.000044
ORF1ab/nsp185M85del1aTga-g16B.1.20.000009
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg55B.1.4290.000118
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg44AY.1070.001864
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg44AY.20.001425
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg44AY.340.000388
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg23AY.350.000466
ORF1ab/nsp185M85del1AtG-tN13AY.350.000233
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg33AY.480.001395
ORF1ab/nsp185M85del1atGat-13B.10.000009
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg13B.10.000009
ORF1ab/nsp185M85del1ATG-NN13B.10.000009
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg22AY.10.000791
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg22AY.1000.000092
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg22AY.1140.000462
ORF1ab/nsp185M85del1ATG-NN12AY.330.000067
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg12AY.330.000067
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg22AY.770.002255
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg22B.1.1470.001512
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg22B.1.3510.000059
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg22B.1.6230.001073
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg11A.2.50.000499
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg11AY.1060.000335
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg11AY.1160.000287
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg11AY.34.10.00051
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg11AY.360.000148
ORF1ab/nsp185M85del1ATG-NN11AY.4.2.10.000149
ORF1ab/nsp185M85del1aTGa-N11AY.420.00004
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg11AY.46.40.000165
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg11AY.46.60.000072
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg11AY.520.000814
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg11AY.560.001605
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg11AY.620.000436
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg11AY.640.000595
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg11AY.700.000209
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg11AY.860.00083
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg11AY.9.10.000084
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg11AY.950.000761
ORF1ab/nsp185M85del1ATG-NN11AY.980.000079
ORF1ab/nsp185M85del1ATG-NN11B0.000128
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg11B.1.1.1760.000439
ORF1ab/nsp185M85del1ATG-NN11B.1.1.1980.001468
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg11B.1.1.3180.000302
ORF1ab/nsp185M85del1atGat-11B.1.1.5190.00004
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg11B.1.1050.009615
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg11B.1.1600.000031
ORF1ab/nsp185M85del1aTGa-N11B.1.177.160.000664
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg11B.1.177.830.001481
ORF1ab/nsp185M85del1atGat-11B.1.2340.000132
ORF1ab/nsp185M85del1ATG-NN11B.1.2400.000216
ORF1ab/nsp185M85del1atGat-11B.1.3690.000285
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg11B.1.4270.00005
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg11B.1.5800.004065
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg11C.370.000116
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg11P.1.100.000269
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg11P.1.120.000484
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg11P.1.170.000162
ORF1ab/nsp185M85del1AtG-tT11Q.10.000126
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg11R.10.00009