CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp1 : Mut = M85L

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp185M85LM85LnonsynAtgCtg4052290.565432518-520
ORF1ab/nsp185M85LM85LnonsynAtgTtg4051730.427161518-520
ORF1ab/nsp185M85LM85LnonsynAtGCtT40530.00740741518-520

Details of the mutation M85L within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp185M85LAtgCtg229405All0.000044
ORF1ab/nsp185M85LAtgTtg173405All0.000033
ORF1ab/nsp185M85LAtGCtT3405All0.000001
ORF1ab/nsp185M85LAtgTtg138138B.1.6280.048626
ORF1ab/nsp185M85LAtgCtg5253AY.40.000081
ORF1ab/nsp185M85LAtgTtg153AY.40.000002
ORF1ab/nsp185M85LAtgCtg1923B.1.617.20.000072
ORF1ab/nsp185M85LAtgTtg423B.1.617.20.000015
ORF1ab/nsp185M85LAtgCtg2022B.1.1.70.000018
ORF1ab/nsp185M85LAtgTtg222B.1.1.70.000002
ORF1ab/nsp185M85LAtgCtg2020AY.260.000566
ORF1ab/nsp185M85LAtgCtg1313AY.9.20.000477
ORF1ab/nsp185M85LAtgCtg611B.10.000055
ORF1ab/nsp185M85LAtgTtg411B.10.000037
ORF1ab/nsp185M85LAtGCtT111B.10.000009
ORF1ab/nsp185M85LAtgCtg1010AY.430.000044
ORF1ab/nsp185M85LAtgCtg89AY.1140.001849
ORF1ab/nsp185M85LAtgTtg19AY.1140.000231
ORF1ab/nsp185M85LAtgCtg89AY.440.000049
ORF1ab/nsp185M85LAtgTtg19AY.440.000006
ORF1ab/nsp185M85LAtgCtg79B.1.20.000062
ORF1ab/nsp185M85LAtgTtg29B.1.20.000018
ORF1ab/nsp185M85LAtgCtg67AY.250.000036
ORF1ab/nsp185M85LAtgTtg17AY.250.000006
ORF1ab/nsp185M85LAtgCtg55AY.230.000349
ORF1ab/nsp185M85LAtgCtg44AY.470.000124
ORF1ab/nsp185M85LAtgCtg23AY.200.000078
ORF1ab/nsp185M85LAtgTtg13AY.200.000039
ORF1ab/nsp185M85LAtgCtg33AY.4.20.000065
ORF1ab/nsp185M85LAtgTtg23B.1.10.000036
ORF1ab/nsp185M85LAtgCtg13B.1.10.000018
ORF1ab/nsp185M85LAtgCtg22AY.1060.00067
ORF1ab/nsp185M85LAtgCtg22AY.1200.000074
ORF1ab/nsp185M85LAtgCtg22AY.30.00002
ORF1ab/nsp185M85LAtgCtg22AY.340.000194
ORF1ab/nsp185M85LAtgCtg22AY.50.000041
ORF1ab/nsp185M85LAtgTtg12AY.750.000056
ORF1ab/nsp185M85LAtgCtg12AY.750.000056
ORF1ab/nsp185M85LAtgTtg12B.1.4290.000024
ORF1ab/nsp185M85LAtgCtg12B.1.4290.000024
ORF1ab/nsp185M85LAtGCtT12B.1.5250.000113
ORF1ab/nsp185M85LAtgTtg12B.1.5250.000113
ORF1ab/nsp185M85LAtgCtg22B.230.005848
ORF1ab/nsp185M85LAtGCtT12P.40.003802
ORF1ab/nsp185M85LAtgCtg12P.40.003802
ORF1ab/nsp185M85LAtgCtg11AY.1020.000027
ORF1ab/nsp185M85LAtgTtg11AY.1030.000006
ORF1ab/nsp185M85LAtgCtg11AY.1160.000287
ORF1ab/nsp185M85LAtgCtg11AY.1180.000063
ORF1ab/nsp185M85LAtgCtg11AY.1190.000035
ORF1ab/nsp185M85LAtgCtg11AY.120.000316
ORF1ab/nsp185M85LAtgTtg11AY.140.000088
ORF1ab/nsp185M85LAtgCtg11AY.290.000016
ORF1ab/nsp185M85LAtgCtg11AY.3.10.000085
ORF1ab/nsp185M85LAtgTtg11AY.330.000067
ORF1ab/nsp185M85LAtgCtg11AY.370.000316
ORF1ab/nsp185M85LAtgCtg11AY.39.10.00004
ORF1ab/nsp185M85LAtgCtg11AY.420.00004
ORF1ab/nsp185M85LAtgCtg11AY.450.000122
ORF1ab/nsp185M85LAtgCtg11AY.46.40.000165
ORF1ab/nsp185M85LAtgCtg11AY.480.000465
ORF1ab/nsp185M85LAtgCtg11AY.540.000095
ORF1ab/nsp185M85LAtgCtg11AY.60.000041
ORF1ab/nsp185M85LAtgCtg11AY.690.000187
ORF1ab/nsp185M85LAtgCtg11AY.730.000665
ORF1ab/nsp185M85LAtgCtg11AY.75.10.00018
ORF1ab/nsp185M85LAtgTtg11AY.770.001127
ORF1ab/nsp185M85LAtgTtg11AY.880.000884
ORF1ab/nsp185M85LAtgCtg11AY.9.10.000084
ORF1ab/nsp185M85LAtgCtg11AY.980.000079
ORF1ab/nsp185M85LAtgCtg11B.1.1.4160.000905
ORF1ab/nsp185M85LAtgCtg11B.1.1.5190.00004
ORF1ab/nsp185M85LAtgCtg11B.1.1600.000031
ORF1ab/nsp185M85LAtgCtg11B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp185M85LAtgTtg11B.1.177.730.000566
ORF1ab/nsp185M85LAtgCtg11B.1.2580.000067
ORF1ab/nsp185M85LAtgTtg11B.1.258.170.000104
ORF1ab/nsp185M85LAtgTtg11B.1.3670.000792
ORF1ab/nsp185M85LAtgTtg11B.1.4270.00005
ORF1ab/nsp185M85LAtgCtg11B.1.4970.000315
ORF1ab/nsp185M85LAtgTtg11B.1.5260.000024
ORF1ab/nsp185M85LAtgTtg11B.1.5640.000426
ORF1ab/nsp185M85LAtgTtg11B.1.5960.000087
ORF1ab/nsp185M85LAtgCtg11B.1.6090.000479
ORF1ab/nsp185M85LAtgCtg11B.1.6210.000089
ORF1ab/nsp185M85LAtgCtg11B.1.6230.000536
ORF1ab/nsp185M85LAtgTtg11P.10.000016
ORF1ab/nsp185M85LAtgCtg11P.30.001595