CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp1 : Mut = L4del

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp14L4delL4deldelCTT---1821821275-277

Details of the mutation L4del within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp14L4delCTT---182182All0.000035
ORF1ab/nsp14L4delCTT---4949B.1.1.70.000044
ORF1ab/nsp14L4delCTT---1414AY.40.000022
ORF1ab/nsp14L4delCTT---1010AY.230.000697
ORF1ab/nsp14L4delCTT---1010AY.430.000044
ORF1ab/nsp14L4delCTT---77B.1.1770.000092
ORF1ab/nsp14L4delCTT---66AY.4.50.000645
ORF1ab/nsp14L4delCTT---44AY.34.10.00204
ORF1ab/nsp14L4delCTT---44B.1.1.330.001684
ORF1ab/nsp14L4delCTT---44B.1.1.3480.003185
ORF1ab/nsp14L4delCTT---33AY.1200.000112
ORF1ab/nsp14L4delCTT---22AY.120.000632
ORF1ab/nsp14L4delCTT---22AY.330.000134
ORF1ab/nsp14L4delCTT---22AY.4.40.000818
ORF1ab/nsp14L4delCTT---22AY.50.000041
ORF1ab/nsp14L4delCTT---22AY.600.001876
ORF1ab/nsp14L4delCTT---22AY.90.000135
ORF1ab/nsp14L4delCTT---22AY.9.20.000073
ORF1ab/nsp14L4delCTT---22B.10.000018
ORF1ab/nsp14L4delCTT---22B.1.177.40.000422
ORF1ab/nsp14L4delCTT---22B.1.177.570.000562
ORF1ab/nsp14L4delCTT---22B.1.177.580.002663
ORF1ab/nsp14L4delCTT---22B.1.360.000292
ORF1ab/nsp14L4delCTT---22N.40.008511
ORF1ab/nsp14L4delCTT---22N.60.014184
ORF1ab/nsp14L4delCTT---22P.20.000373
ORF1ab/nsp14L4delCTT---11A.10.000282
ORF1ab/nsp14L4delCTT---11AD.20.000219
ORF1ab/nsp14L4delCTT---11AY.1160.000287
ORF1ab/nsp14L4delCTT---11AY.190.00114
ORF1ab/nsp14L4delCTT---11AY.250.000006
ORF1ab/nsp14L4delCTT---11AY.30.00001
ORF1ab/nsp14L4delCTT---11AY.380.000499
ORF1ab/nsp14L4delCTT---11AY.410.000294
ORF1ab/nsp14L4delCTT---11AY.450.000122
ORF1ab/nsp14L4delCTT---11AY.460.000104
ORF1ab/nsp14L4delCTT---11AY.46.20.000635
ORF1ab/nsp14L4delCTT---11AY.60.000041
ORF1ab/nsp14L4delCTT---11AY.680.000274
ORF1ab/nsp14L4delCTT---11AY.75.10.00018
ORF1ab/nsp14L4delCTT---11AY.9.10.000084
ORF1ab/nsp14L4delCTT---11AY.940.000443
ORF1ab/nsp14L4delCTT---11AY.950.000761
ORF1ab/nsp14L4delCTT---11AY.98.10.000048
ORF1ab/nsp14L4delCTT---11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp14L4delCTT---11B.1.1.2320.001815
ORF1ab/nsp14L4delCTT---11B.1.1.3110.000358
ORF1ab/nsp14L4delCTT---11B.1.1.3120.001912
ORF1ab/nsp14L4delCTT---11B.1.1.3220.008772
ORF1ab/nsp14L4delCTT---11B.1.1.370.000193
ORF1ab/nsp14L4delCTT---11B.1.1.390.00051
ORF1ab/nsp14L4delCTT---11B.1.1.4090.002833
ORF1ab/nsp14L4delCTT---11B.1.1600.000031
ORF1ab/nsp14L4delCTT---11B.1.177.170.000821
ORF1ab/nsp14L4delCTT---11B.1.177.180.00116
ORF1ab/nsp14L4delCTT---11B.1.177.560.000668
ORF1ab/nsp14L4delCTT---11B.1.177.630.002703
ORF1ab/nsp14L4delCTT---11B.1.177.870.000728
ORF1ab/nsp14L4delCTT---11B.1.177.90.001332
ORF1ab/nsp14L4delCTT---11B.1.20.000009
ORF1ab/nsp14L4delCTT---11B.1.2580.000067
ORF1ab/nsp14L4delCTT---11B.1.258.30.001675
ORF1ab/nsp14L4delCTT---11B.1.36.180.00042
ORF1ab/nsp14L4delCTT---11B.1.4160.001269
ORF1ab/nsp14L4delCTT---11B.1.4290.000024
ORF1ab/nsp14L4delCTT---11B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp14L4delCTT---11C.350.000774