CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp1 : Mut = F143del

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp1143F143delF143deldelTTT---32581325811692-694

Details of the mutation F143del within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---3258132581All0.006232
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---41794179AY.40.006504
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---34443444AY.1100.3881
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---29782978AY.700.620934
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---24512451AY.630.948162
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---21672167B.1.617.20.00816
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---17861786B.1.1.70.001599
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---742742AY.260.021006
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---711711AY.720.967347
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---664664AY.250.003994
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---656656B.10.006009
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---623623AY.440.003792
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---597597AY.430.002645
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---596596AY.1200.022159
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---478478AY.1030.002968
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---458458AY.30.004555
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---319319B.1.1600.009949
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---315315AY.50.006505
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---312312AY.4.20.006767
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---304304AY.610.031852
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---260260B.1.160.170.442177
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---258258AY.750.014454
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---242242AY.46.60.017474
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---229229B.1.20.002016
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---213213AY.1020.005647
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---181181AY.16.10.085056
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---169169B.1.5260.003972
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---167167AY.460.017381
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---165165AY.390.004077
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---163163B.1.10.002957
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---147147B.1.1.5190.005838
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---137137AY.470.004261
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---137137P.10.002158
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---133133AY.210.252372
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---133133AY.4.50.014296
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---127127B.1.3510.003775
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---123123B.1.2580.008185
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---117117B.1.1770.001541
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---115115AY.540.010965
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---112112AY.330.007479
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---100100AY.120.10.032103
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---9999AY.420.003983
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---9898B.1.6210.008675
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---9797AY.9.10.008121
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---9797B.1.4290.002282
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---9696D.20.007204
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---9595AY.370.030025
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---9595AY.39.10.003763
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---9494AY.1190.003319
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---9191B.1.3721
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---9090AY.9.20.003306
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---8383B.1.2430.005776
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---7777AY.740.008905
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---6969B.1.1950.346734
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---6565B.1.6370.00475
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---6464AY.960.13278
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---6060B.1.177.210.004588
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---6060B.1.4270.00303
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---5858AY.290.000915
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---5858B.1.1.2140.003217
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---5757AY.70.011172
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---5555AY.1180.003446
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---5555B.1.438.10.005899
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---5353AY.130.008532
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---5353AY.140.004665
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---5353B.1.1.3180.015993
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---5050AY.450.006084
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---4949AY.1000.002254
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---4848AY.200.001866
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---4545AY.3.10.003837
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---4545AY.90.003042
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---4545B.1.1.2220.00918
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---4444AY.350.010254
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---4444AY.910.03214
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---4343AY.1090.031805
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---4343C.350.033282
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---4242AY.230.002929
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---4242AY.75.10.007573
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---3939AY.980.003081
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---3838AY.46.40.006251
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---3838B.1.5960.003311
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---3636AY.98.10.001744
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---3636B.1.2320.019344
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---3535AY.100.018548
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---3535AY.270.002265
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---3434C.36.30.019285
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---3333AY.1170.002789
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---3333AY.99.20.003041
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---3333B.1.258.170.003431
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---3232AY.60.001316
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---3232B.1.1.700.010914
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---3131B0.003962
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---3030B.1.1.370.005786
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---2929AY.5.30.009784
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---2929B.1.2210.00206
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---2828AY.1070.013048
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---2828AY.650.014925
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---2828B.1.1.2840.003007
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---2727AY.1140.00624
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---2727AY.9.2.10.05336
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---2626AY.550.023853
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---2626B.1.1.3740.061758
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---2626B.1.595.10.152047
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---2626B.1.6280.009161
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---2626P.1.140.001243
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---2525AE.10.284091
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---2525AY.690.004667
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---2424A.270.039735
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---2424AY.120.2.10.011958
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---2424B.1.258.220.064
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---2323AY.10.009102
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---2323AY.530.006613
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---2323B.1.2340.003035
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---2222AE.80.010758
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---2222AY.340.002133
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ORF1ab/nsp1143F143delTTT---2222B.1.2400.004742
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---2121B.1.1.1760.009227
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---2020AY.620.008715
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---2020B.1.1.500.013578
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---2020B.1.177.560.013351
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---2020Q.10.002527
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---1919AY.360.002816
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---1919AY.480.008837
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---1919AY.510.017273
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---1919B.1.177.40.00401
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---1818B.1.621.10.009105
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---1818P.1.100.00485
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---1717AY.900.011636
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---1616AY.160.006074
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---1616B.1.2790.008218
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---1616Q.80.002639
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---1515AY.300.005936
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---1515B.1.5170.006405
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---1515C.180.03886
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---1414AY.120.004425
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---1414AY.590.007415
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---1414B.1.177.120.002124
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---1414B.1.2390.017094
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---1414B.1.350.118644
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---1414B.1.360.002043
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---1414B.1.36.180.005882
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---1414B.1.36.360.008429
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---1414P.1.170.002265
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---1313AY.1210.001759
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---1313AY.580.011797
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---1313B.1.1.3720.008953
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---1313C.370.001509
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---1212AY.1130.001709
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---1212AY.1160.003441
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---1212AY.4.2.10.001788
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---1212AY.7.10.001352
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---1212AZ.20.009852
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---1212B.1.1.4340.004183
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---1212P.1.70.003831
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---1111AD.20.002409
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---1111AY.20.003917
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---1111B.1.1.1530.012048
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---1111B.1.1.3650.061453
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---1111B.1.5680.012222
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---1010AY.240.00431
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---1010AY.920.002873
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---1010AY.930.002731
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---1010B.1.1.330.004209
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---1010B.1.1390.007331
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---1010B.1.3200.012453
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---1010B.1.3290.006075
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---1010B.1.4000.00429
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---1010B.1.6230.005365
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---1010B.1.6300.052356
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---99A0.003483
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---99AY.34.10.004589
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---99AY.600.008443
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---99AY.940.003984
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---99B.1.1.4330.012821
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---99B.1.36.210.019438
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---99B.1.4220.007311
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---99B.1.5510.011613
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---99B.1.5820.004416
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---88AY.380.003994
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---88AY.520.006515
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---88AY.570.005249
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---88AY.840.0035
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---88AY.880.007073
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---88B.1.1.3110.002865
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---88B.1.1.3480.006369
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---88B.1.214.20.004796
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---88B.1.3490.005718
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---88B.1.390.03125
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---88B.1.4970.002518
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---88B.1.5250.000905
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---88B.1.5640.003407
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---88P.1.150.001859
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---77AY.190.007982
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---77AY.410.002058
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---77AY.46.50.001389
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---77AY.640.004167
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---77AY.850.00299
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---77B.1.1.10.002287
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---77B.1.1.1410.014085
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---77B.1.1.2040.021277
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---77B.1.1.2770.005311
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---77B.1.1.3060.003069
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---77B.1.1.5230.010937
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---77B.1.1280.004447
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---77B.1.160.240.030973
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---77B.1.177.150.004416
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---77B.1.177.600.001529
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---77B.1.258.30.011725
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---77B.1.36.190.064815
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---77B.1.5880.006369
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---77B.1.617.10.000903
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---77B.310.026119
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---77B.60.006369
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---66A.10.001691
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---66AY.1060.002009
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---66AY.280.011342
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---66AY.39.20.009245
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---66AY.780.009245
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---66B.1.1.1320.089552
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---66B.1.1.3010.007075
ORF1ab/nsp1143F143delTTT---66B.1.1.3770.008287
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