CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp1 : Mut = D75G

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp175D75GD75GnonsyngAtgGt127312700.997643488-490
ORF1ab/nsp175D75GD75GnonsyngATgGA127320.00157109488-490
ORF1ab/nsp175D75GD75GnonsyngATgGC127310.000785546488-490

Details of the mutation D75G within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp175D75GgAtgGt12701273All0.000243
ORF1ab/nsp175D75GgATgGA21273All0
ORF1ab/nsp175D75GgATgGC11273All0
ORF1ab/nsp175D75GgAtgGt341341AY.40.000531
ORF1ab/nsp175D75GgAtgGt209209B.1.1.70.000187
ORF1ab/nsp175D75GgAtgGt186186AV.10.939394
ORF1ab/nsp175D75GgAtgGt9595B.1.1.3630.568862
ORF1ab/nsp175D75GgAtgGt6666AY.470.002053
ORF1ab/nsp175D75GgAtgGt5454B.1.6370.003946
ORF1ab/nsp175D75GgAtgGt2828AY.30.000278
ORF1ab/nsp175D75GgAtgGt2727AY.440.000164
ORF1ab/nsp175D75GgAtgGt2323AY.260.000651
ORF1ab/nsp175D75GgAtgGt2121B.1.1.5190.000834
ORF1ab/nsp175D75GgAtgGt2020AY.1030.000124
ORF1ab/nsp175D75GgAtgGt1717B.1.4970.005351
ORF1ab/nsp175D75GgAtgGt1717B.1.617.20.000064
ORF1ab/nsp175D75GgAtgGt1515AY.250.00009
ORF1ab/nsp175D75GgAtgGt1313AY.50.000268
ORF1ab/nsp175D75GgAtgGt1010AY.430.000044
ORF1ab/nsp175D75GgAtgGt1010B.10.000092
ORF1ab/nsp175D75GgAtgGt88AZ.20.006568
ORF1ab/nsp175D75GgAtgGt77B.1.1.3760.041667
ORF1ab/nsp175D75GgAtgGt77B.1.20.000062
ORF1ab/nsp175D75GgAtgGt77C.36.30.003971
ORF1ab/nsp175D75GgAtgGt55A.2.50.002495
ORF1ab/nsp175D75GgAtgGt55AY.7.10.000564
ORF1ab/nsp175D75GgAtgGt55B.1.2400.001078
ORF1ab/nsp175D75GgAtgGt55C.370.00058
ORF1ab/nsp175D75GgAtgGt55P.10.000079
ORF1ab/nsp175D75GgAtgGt34B.1.1770.00004
ORF1ab/nsp175D75GgATgGA14B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp175D75GgAtgGt34B.1.3510.000089
ORF1ab/nsp175D75GgATgGA14B.1.3510.00003
ORF1ab/nsp175D75GgAtgGt33AY.290.000047
ORF1ab/nsp175D75GgAtgGt33AY.460.000312
ORF1ab/nsp175D75GgAtgGt33B.1.2580.0002
ORF1ab/nsp175D75GgAtgGt33B.1.5960.000261
ORF1ab/nsp175D75GgAtgGt33D.20.000225
ORF1ab/nsp175D75GgAtgGt22AY.1180.000125
ORF1ab/nsp175D75GgAtgGt22AY.270.000129
ORF1ab/nsp175D75GgAtgGt22AY.390.000049
ORF1ab/nsp175D75GgAtgGt22AY.60.000082
ORF1ab/nsp175D75GgAtgGt22AY.620.000871
ORF1ab/nsp175D75GgAtgGt22B.1.10.000036
ORF1ab/nsp175D75GgAtgGt22B.1.1.3550.030769
ORF1ab/nsp175D75GgAtgGt22B.1.5700.005882
ORF1ab/nsp175D75GgAtgGt22Q.10.000253
ORF1ab/nsp175D75GgAtgGt11AY.1000.000046
ORF1ab/nsp175D75GgAtgGt11AY.1080.001103
ORF1ab/nsp175D75GgAtgGt11AY.140.000088
ORF1ab/nsp175D75GgATgGC11AY.230.00007
ORF1ab/nsp175D75GgAtgGt11AY.320.000532
ORF1ab/nsp175D75GgAtgGt11AY.34.10.00051
ORF1ab/nsp175D75GgAtgGt11AY.39.10.00004
ORF1ab/nsp175D75GgAtgGt11AY.450.000122
ORF1ab/nsp175D75GgAtgGt11AY.750.000056
ORF1ab/nsp175D75GgAtgGt11AY.9.20.000037
ORF1ab/nsp175D75GgAtgGt11AY.980.000079
ORF1ab/nsp175D75GgAtgGt11AY.98.10.000048
ORF1ab/nsp175D75GgAtgGt11B.1.1.290.010309
ORF1ab/nsp175D75GgAtgGt11B.1.1.3160.000925
ORF1ab/nsp175D75GgAtgGt11B.1.1.3180.000302
ORF1ab/nsp175D75GgAtgGt11B.1.1.330.000421
ORF1ab/nsp175D75GgAtgGt11B.1.1.390.00051
ORF1ab/nsp175D75GgAtgGt11B.1.160.150.00495
ORF1ab/nsp175D75GgAtgGt11B.1.177.230.003236
ORF1ab/nsp175D75GgAtgGt11B.1.2210.000071
ORF1ab/nsp175D75GgAtgGt11B.1.3110.000275
ORF1ab/nsp175D75GgAtgGt11B.1.36.170.000494
ORF1ab/nsp175D75GgAtgGt11B.1.4270.00005
ORF1ab/nsp175D75GgAtgGt11B.1.5950.000261
ORF1ab/nsp175D75GgAtgGt11B.1.6050.005952
ORF1ab/nsp175D75GgAtgGt11Q.80.000165