CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp1 : CodonNum = 88

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp188L88LL88LsynctGctT1248374530.597052527-529
ORF1ab/nsp188L88LL88LsynCtgTtg1248340530.324682527-529
ORF1ab/nsp188L88LL88LsynctGctA124839570.0766643527-529
ORF1ab/nsp188L88LL88LsynctGctC12483190.00152207527-529
ORF1ab/nsp188L88LL88LsynCtGTtA1248310.0000801089527-529
ORF1ab/nsp188L88delL88deldelCTG---2392391527-529
ORF1ab/nsp188L88PL88PnonsyncTgcCg52510.980769527-529
ORF1ab/nsp188L88PL88PnonsyncTGcCA5210.0192308527-529
ORF1ab/nsp188L88ML88MnonsynCtgAtg36361527-529
ORF1ab/nsp188L88RL88RnonsyncTgcGg22221527-529
ORF1ab/nsp188L88VL88VnonsynCtgGtg15151527-529
ORF1ab/nsp188L88QL88QnonsyncTgcAg14141527-529
ORF1ab/nsp188L88del1L88del1delctGct-12110.916667527-529
ORF1ab/nsp188L88del1L88del1delCtg-tg1210.0833333527-529
ORF1ab/nsp188L88del2L88del2delcTGc--210.5527-529
ORF1ab/nsp188L88del2L88del2delCTg--g210.5527-529
ORF1ab/nsp188L88FL88FnonsynCtGTtT111527-529
ORF1ab/nsp188L88SL88SnonsynCTgTCg111527-529
ORF1ab/nsp188L88HL88HnonsyncTGcAC111527-529
ORF1ab/nsp188L88TL88TnonsynCTgACg111527-529

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp188L88LctGctT745312483All0.001425
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg405312483All0.000775
ORF1ab/nsp188L88LctGctA95712483All0.000183
ORF1ab/nsp188L88LctGctC1912483All0.000004
ORF1ab/nsp188L88LCtGTtA112483All0
ORF1ab/nsp188L88LctGctT22402554B.1.1.70.002005
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg2592554B.1.1.70.000232
ORF1ab/nsp188L88LctGctA532554B.1.1.70.000047
ORF1ab/nsp188L88LctGctC12554B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp188L88LCtGTtA12554B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp188L88LctGctT23722376R.10.213501
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg22376R.10.00018
ORF1ab/nsp188L88LctGctA22376R.10.00018
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg396681AY.40.000616
ORF1ab/nsp188L88LctGctT199681AY.40.00031
ORF1ab/nsp188L88LctGctA82681AY.40.000128
ORF1ab/nsp188L88LctGctC4681AY.40.000006
ORF1ab/nsp188L88LctGctT238595B.1.617.20.000896
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg232595B.1.617.20.000874
ORF1ab/nsp188L88LctGctA124595B.1.617.20.000467
ORF1ab/nsp188L88LctGctC1595B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg550550B.1.5610.218341
ORF1ab/nsp188L88LctGctT301311AY.610.031538
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg5311AY.610.000524
ORF1ab/nsp188L88LctGctC4311AY.610.000419
ORF1ab/nsp188L88LctGctA1311AY.610.000105
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg229297B.1.20.002016
ORF1ab/nsp188L88LctGctT62297B.1.20.000546
ORF1ab/nsp188L88LctGctA6297B.1.20.000053
ORF1ab/nsp188L88LctGctA275283AY.1190.00971
ORF1ab/nsp188L88LctGctT6283AY.1190.000212
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg2283AY.1190.000071
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg265265B.1.36.10.302166
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg123242B.10.001127
ORF1ab/nsp188L88LctGctT112242B.10.001026
ORF1ab/nsp188L88LctGctA5242B.10.000046
ORF1ab/nsp188L88LctGctC2242B.10.000018
ORF1ab/nsp188L88delCTG---239239All0.000046
ORF1ab/nsp188L88LctGctT232238AY.50.004791
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg5238AY.50.000103
ORF1ab/nsp188L88LctGctA1238AY.50.000021
ORF1ab/nsp188L88LctGctT148176B.1.1770.001949
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg23176B.1.1770.000303
ORF1ab/nsp188L88LctGctA5176B.1.1770.000066
ORF1ab/nsp188L88LctGctA153153B.1.258.110.060642
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg136138B.1.5250.01539
ORF1ab/nsp188L88LctGctA1138B.1.5250.000113
ORF1ab/nsp188L88LctGctT1138B.1.5250.000113
ORF1ab/nsp188L88LctGctT108132AY.250.00065
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg22132AY.250.000132
ORF1ab/nsp188L88LctGctA2132AY.250.000012
ORF1ab/nsp188L88LctGctT75125AY.440.000457
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg35125AY.440.000213
ORF1ab/nsp188L88LctGctA12125AY.440.000073
ORF1ab/nsp188L88LctGctC3125AY.440.000018
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg121121B.1.258.210.937984
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg101115B.1.5260.002374
ORF1ab/nsp188L88LctGctT14115B.1.5260.000329
ORF1ab/nsp188L88LctGctT50109AY.1030.00031
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg49109AY.1030.000304
ORF1ab/nsp188L88LctGctA10109AY.1030.000062
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg9798AD.20.021239
ORF1ab/nsp188L88LctGctT198AD.20.000219
ORF1ab/nsp188L88LctGctT6795B.1.10.001215
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg2795B.1.10.00049
ORF1ab/nsp188L88LctGctA195B.1.10.000018
ORF1ab/nsp188L88LctGctT5893AY.430.000257
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg3393AY.430.000146
ORF1ab/nsp188L88LctGctA293AY.430.000009
ORF1ab/nsp188L88LctGctT9191B.1.1.2200.169145
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg7885AY.1210.010555
ORF1ab/nsp188L88LctGctT485AY.1210.000541
ORF1ab/nsp188L88LctGctA385AY.1210.000406
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg7981P.1.150.018355
ORF1ab/nsp188L88LctGctT281P.1.150.000465
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg7878B.1.1.2800.240741
ORF1ab/nsp188L88LctGctT4277AY.1020.001114
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg3177AY.1020.000822
ORF1ab/nsp188L88LctGctA477AY.1020.000106
ORF1ab/nsp188L88LctGctT3272AY.30.000318
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg2672AY.30.000259
ORF1ab/nsp188L88LctGctA1472AY.30.000139
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg6371B.1.2580.004192
ORF1ab/nsp188L88LctGctT671B.1.2580.000399
ORF1ab/nsp188L88LctGctA271B.1.2580.000133
ORF1ab/nsp188L88LctGctT6868B.1.110.30.048851
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg3567P.10.000551
ORF1ab/nsp188L88LctGctT2267P.10.000347
ORF1ab/nsp188L88LctGctA1067P.10.000158
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg6264B.1.2400.013365
ORF1ab/nsp188L88LctGctT264B.1.2400.000431
ORF1ab/nsp188L88delCTG---6161B0.007797
ORF1ab/nsp188L88LctGctT5460AY.46.60.003899
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg560AY.46.60.000361
ORF1ab/nsp188L88LctGctA160AY.46.60.000072
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg5859AY.340.005624
ORF1ab/nsp188L88LctGctT159AY.340.000097
ORF1ab/nsp188L88LctGctA5658AY.640.033333
ORF1ab/nsp188L88LctGctT258AY.640.00119
ORF1ab/nsp188L88LctGctT3256AY.200.001244
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg1656AY.200.000622
ORF1ab/nsp188L88LctGctA856AY.200.000311
ORF1ab/nsp188L88LctGctT2556B.1.1.5190.000993
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg1756B.1.1.5190.000675
ORF1ab/nsp188L88LctGctA1356B.1.1.5190.000516
ORF1ab/nsp188L88LctGctC156B.1.1.5190.00004
ORF1ab/nsp188L88LctGctT5656Q.80.009235
ORF1ab/nsp188L88PcTgcCg5152All0.00001
ORF1ab/nsp188L88PcTGcCA152All0
ORF1ab/nsp188L88LctGctT4552AY.390.001112
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg652AY.390.000148
ORF1ab/nsp188L88LctGctA152AY.390.000025
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg4347B.1.4270.002171
ORF1ab/nsp188L88LctGctT447B.1.4270.000202
ORF1ab/nsp188L88LctGctT3346AY.260.000934
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg1346AY.260.000368
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg3645B.1.1600.001123
ORF1ab/nsp188L88LctGctT945B.1.1600.000281
ORF1ab/nsp188L88LctGctT4343B.1.1.3530.895833
ORF1ab/nsp188L88LctGctA1942AY.1200.000706
ORF1ab/nsp188L88LctGctT1242AY.1200.000446
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg1142AY.1200.000409
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg3842AY.620.016558
ORF1ab/nsp188L88LctGctT342AY.620.001307
ORF1ab/nsp188L88LctGctA142AY.620.000436
ORF1ab/nsp188L88LctGctT1842B.1.3510.000535
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg1742B.1.3510.000505
ORF1ab/nsp188L88LctGctA642B.1.3510.000178
ORF1ab/nsp188L88LctGctC142B.1.3510.00003
ORF1ab/nsp188L88MCtgAtg3636All0.000007
ORF1ab/nsp188L88LctGctT2835B.1.5960.00244
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg735B.1.5960.00061
ORF1ab/nsp188L88LctGctT3133AY.1080.034179
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg233AY.1080.002205
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg3233AY.540.003051
ORF1ab/nsp188L88LctGctA133AY.540.000095
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg2633B.1.2430.001809
ORF1ab/nsp188L88LctGctT733B.1.2430.000487
ORF1ab/nsp188L88delCTG---3232AY.40.00005
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg3030B.1.1.1201
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg2230B.1.360.00321
ORF1ab/nsp188L88LctGctT730B.1.360.001021
ORF1ab/nsp188L88LctGctA130B.1.360.000146
ORF1ab/nsp188L88LctGctT1529B.1.4290.000353
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg1329B.1.4290.000306
ORF1ab/nsp188L88LctGctA129B.1.4290.000024
ORF1ab/nsp188L88LctGctT2325AY.230.001604
ORF1ab/nsp188L88LctGctA125AY.230.00007
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg125AY.230.00007
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg2525C.36.30.01418
ORF1ab/nsp188L88delCTG---2424B.1.1.70.000021
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg1323AY.470.000404
ORF1ab/nsp188L88LctGctT923AY.470.00028
ORF1ab/nsp188L88LctGctA123AY.470.000031
ORF1ab/nsp188L88LctGctT1223AY.9.20.000441
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg923AY.9.20.000331
ORF1ab/nsp188L88LctGctA223AY.9.20.000073
ORF1ab/nsp188L88LctGctA2222A.23.10.015493
ORF1ab/nsp188L88RcTgcGg2222All0.000004
ORF1ab/nsp188L88LctGctT2121B.1.177.610.913043
ORF1ab/nsp188L88LctGctT1820AY.60.00074
ORF1ab/nsp188L88LctGctA220AY.60.000082
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg1820B.1.6370.001315
ORF1ab/nsp188L88LctGctT220B.1.6370.000146
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg1618A.2.50.007984
ORF1ab/nsp188L88LctGctT218A.2.50.000998
ORF1ab/nsp188L88LctGctT1616AY.710.007601
ORF1ab/nsp188L88LctGctT1416AY.980.001106
ORF1ab/nsp188L88LctGctA116AY.980.000079
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg116AY.980.000079
ORF1ab/nsp188L88VCtgGtg1515All0.000003
ORF1ab/nsp188L88LctGctT1315AY.1170.001099
ORF1ab/nsp188L88LctGctA115AY.1170.000085
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg115AY.1170.000085
ORF1ab/nsp188L88PcTgcCg1515AY.40.000023
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg1015AY.4.20.000217
ORF1ab/nsp188L88LctGctT515AY.4.20.000108
ORF1ab/nsp188L88LctGctT1215C.370.001393
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg315C.370.000348
ORF1ab/nsp188L88QcTgcAg1414All0.000003
ORF1ab/nsp188L88LctGctT714AY.130.001127
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg714AY.130.001127
ORF1ab/nsp188L88LctGctT1414B.1.36.180.005882
ORF1ab/nsp188L88LctGctT813AY.290.000126
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg413AY.290.000063
ORF1ab/nsp188L88LctGctA113AY.290.000016
ORF1ab/nsp188L88LctGctT1113AY.420.000443
ORF1ab/nsp188L88LctGctA113AY.420.00004
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg113AY.420.00004
ORF1ab/nsp188L88LctGctT1113AY.75.10.001983
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg213AY.75.10.000361
ORF1ab/nsp188L88LctGctT1012A.210.027701
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg212A.210.00554
ORF1ab/nsp188L88del1ctGct-1112All0.000002
ORF1ab/nsp188L88del1Ctg-tg112All0
ORF1ab/nsp188L88MCtgAtg1212AY.1030.000075
ORF1ab/nsp188L88LctGctT1012AY.140.00088
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg112AY.140.000088
ORF1ab/nsp188L88LctGctA112AY.140.000088
ORF1ab/nsp188L88LctGctA1212B.1.1.4510.461538
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg1112B.1.258.170.001144
ORF1ab/nsp188L88LctGctT112B.1.258.170.000104
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg811AY.550.007339
ORF1ab/nsp188L88LctGctT311AY.550.002752
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg811B.1.5760.007253
ORF1ab/nsp188L88LctGctT211B.1.5760.001813
ORF1ab/nsp188L88LctGctC111B.1.5760.000907
ORF1ab/nsp188L88LctGctT910AY.16.10.004229
ORF1ab/nsp188L88LctGctA110AY.16.10.00047
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg1010B.1.177.440.005189
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg1010B.1.2210.00071
ORF1ab/nsp188L88LctGctT1010P.60.031447
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg59AY.1000.00023
ORF1ab/nsp188L88LctGctT39AY.1000.000138
ORF1ab/nsp188L88LctGctA19AY.1000.000046
ORF1ab/nsp188L88LctGctT89AY.1060.002679
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg19AY.1060.000335
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg69AY.39.10.000238
ORF1ab/nsp188L88LctGctT29AY.39.10.000079
ORF1ab/nsp188L88LctGctA19AY.39.10.00004
ORF1ab/nsp188L88RcTgcGg99AY.4.50.000967
ORF1ab/nsp188L88delCTG---99AY.440.000055
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg69AY.460.000624
ORF1ab/nsp188L88LctGctT39AY.460.000312
ORF1ab/nsp188L88LctGctT59AY.750.00028
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg49AY.750.000224
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg59AY.99.20.000461
ORF1ab/nsp188L88LctGctT49AY.99.20.000369
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg79B.1.1.280.002179
ORF1ab/nsp188L88LctGctT29B.1.1.280.000622
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg79B.1.5820.003435
ORF1ab/nsp188L88LctGctT19B.1.5820.000491
ORF1ab/nsp188L88LctGctA19B.1.5820.000491
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg79B.1.617.10.000903
ORF1ab/nsp188L88LctGctT29B.1.617.10.000258
ORF1ab/nsp188L88LctGctT69P.1.140.000287
ORF1ab/nsp188L88LctGctA29P.1.140.000096
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg19P.1.140.000048
ORF1ab/nsp188L88LctGctT69Q.10.000758
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg39Q.10.000379
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg58AY.450.000608
ORF1ab/nsp188L88LctGctT38AY.450.000365
ORF1ab/nsp188L88LctGctT68AY.7.10.000676
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg18AY.7.10.000113
ORF1ab/nsp188L88LctGctA18AY.7.10.000113
ORF1ab/nsp188L88LctGctT78B.1.177.210.000535
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg18B.1.177.210.000076
ORF1ab/nsp188L88LctGctT58B.1.5950.001305
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg28B.1.5950.000522
ORF1ab/nsp188L88LctGctA18B.1.5950.000261
ORF1ab/nsp188L88delCTG---88B.1.617.20.00003
ORF1ab/nsp188L88LctGctT58B.1.6210.000443
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg38B.1.6210.000266
ORF1ab/nsp188L88LctGctT68P.1.170.000971
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg28P.1.170.000324
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg88P.30.012759
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg37AY.1180.000188
ORF1ab/nsp188L88LctGctT37AY.1180.000188
ORF1ab/nsp188L88LctGctA17AY.1180.000063
ORF1ab/nsp188L88delCTG---77AY.250.000042
ORF1ab/nsp188L88VCtgGtg77AY.440.000043
ORF1ab/nsp188L88LctGctT57B.1.1.2220.00102
ORF1ab/nsp188L88LctGctA17B.1.1.2220.000204
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg17B.1.1.2220.000204
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg77B.1.1.2840.000752
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg67B.1.1.500.004073
ORF1ab/nsp188L88LctGctT17B.1.1.500.000679
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg77B.1.2320.003761
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg77B.1.3690.001997
ORF1ab/nsp188L88LctGctT47B.1.5510.005161
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg37B.1.5510.003871
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg77C.360.006375
ORF1ab/nsp188L88delCTG---66AY.30.00006
ORF1ab/nsp188L88delCTG---66AY.46.50.00119
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg56AY.9.10.000419
ORF1ab/nsp188L88LctGctT16AY.9.10.000084
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg66B.1.1.4160.00543
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg66B.1.177.100.005268
ORF1ab/nsp188L88PcTgcCg66B.1.617.20.000023
ORF1ab/nsp188L88LctGctT46D.20.0003
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg26D.20.00015
ORF1ab/nsp188L88PcTgcCg55AY.1010.002452
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg35AY.330.0002
ORF1ab/nsp188L88LctGctT25AY.330.000134
ORF1ab/nsp188L88QcTgcAg55AY.430.000022
ORF1ab/nsp188L88delCTG---55AY.50.000103
ORF1ab/nsp188L88LctGctA35AY.740.000347
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg25AY.740.000231
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg35B0.000383
ORF1ab/nsp188L88LctGctT25B0.000256
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg55B.1.1.3480.003981
ORF1ab/nsp188L88LctGctT55B.1.1.890.030303
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg55B.1.177.820.002387
ORF1ab/nsp188L88LctGctT35B.1.36.290.001552
ORF1ab/nsp188L88LctGctA15B.1.36.290.000517
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg15B.1.36.290.000517
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg55B.1.5170.002135
ORF1ab/nsp188L88MCtgAtg55B.1.617.20.000019
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg55C.160.005302
ORF1ab/nsp188L88LctGctT45P.20.000747
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg15P.20.000187
ORF1ab/nsp188L88delCTG---44AY.1010.001962
ORF1ab/nsp188L88LctGctT34AY.1160.00086
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg14AY.1160.000287
ORF1ab/nsp188L88LctGctT44AY.160.001519
ORF1ab/nsp188L88LctGctT24AY.240.000862
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg24AY.240.000862
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg34AY.360.000445
ORF1ab/nsp188L88LctGctT14AY.360.000148
ORF1ab/nsp188L88RcTgcGg44AY.40.000006
ORF1ab/nsp188L88delCTG---44AY.430.000018
ORF1ab/nsp188L88PcTgcCg44AY.430.000018
ORF1ab/nsp188L88LctGctT34AY.46.20.001906
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg14AY.46.20.000635
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg44AY.700.000834
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg34AY.90.000203
ORF1ab/nsp188L88LctGctA14AY.90.000068
ORF1ab/nsp188L88LctGctT44B.1.1.1740.013514
ORF1ab/nsp188L88delCTG---44B.1.1.330.001684
ORF1ab/nsp188L88delCTG---44B.1.1.3480.003185
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg44B.1.1.370.000771
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg44B.1.1.4340.001394
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg44B.1.214.20.002398
ORF1ab/nsp188L88LctGctT44B.1.3990.007737
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg44B.1.4080.01476
ORF1ab/nsp188L88LctGctT34B.1.6090.001438
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg14B.1.6090.000479
ORF1ab/nsp188L88LctGctA23A0.000774
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg13A0.000387
ORF1ab/nsp188L88LctGctA23A.10.000564
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg13A.10.000282
ORF1ab/nsp188L88delCTG---33AY.1200.000112
ORF1ab/nsp188L88LctGctT23AY.120.20.002571
ORF1ab/nsp188L88LctGctA13AY.120.20.001285
ORF1ab/nsp188L88PcTgcCg33AY.200.000117
ORF1ab/nsp188L88MCtgAtg33AY.250.000018
ORF1ab/nsp188L88LctGctT33AY.46.40.000494
ORF1ab/nsp188L88LctGctT23AY.800.002257
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg13AY.800.001129
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg33AY.810.005976
ORF1ab/nsp188L88LctGctT33AY.840.001312
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg13AY.920.000287
ORF1ab/nsp188L88LctGctA13AY.920.000287
ORF1ab/nsp188L88LctGctT13AY.920.000287
ORF1ab/nsp188L88delCTG---33AY.980.000237
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg23AY.98.10.000097
ORF1ab/nsp188L88LctGctT13AY.98.10.000048
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg33B.1.1.1920.006928
ORF1ab/nsp188L88LctGctT33B.1.1.5260.010638
ORF1ab/nsp188L88MCtgAtg33B.1.1.70.000003
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg23B.1.1.700.000682
ORF1ab/nsp188L88LctGctT13B.1.1.700.000341
ORF1ab/nsp188L88delCTG---33B.1.1260.003827
ORF1ab/nsp188L88LctGctA23B.1.177.40.000422
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg13B.1.177.40.000211
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg33B.1.177.810.000568
ORF1ab/nsp188L88del1ctGct-33B.1.20.000026
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg33B.1.36.170.001482
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg33B.1.3960.002117
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg33B.1.466.20.001174
ORF1ab/nsp188L88LctGctT23B.1.4990.002101
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg13B.1.4990.00105
ORF1ab/nsp188L88LctGctT33B.1.621.10.001517
ORF1ab/nsp188L88VCtgGtg33P.10.000047
ORF1ab/nsp188L88delCTG---33P.20.00056
ORF1ab/nsp188L88del2CTg--g12All0
ORF1ab/nsp188L88del2cTGc--12All0
ORF1ab/nsp188L88LctGctT12AY.1130.000142
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg12AY.1130.000142
ORF1ab/nsp188L88PcTgcCg22AY.260.000057
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg12AY.270.000065
ORF1ab/nsp188L88LctGctT12AY.270.000065
ORF1ab/nsp188L88PcTgcCg22AY.30.00002
ORF1ab/nsp188L88delCTG---22AY.3.10.000171
ORF1ab/nsp188L88LctGctT22AY.320.001065
ORF1ab/nsp188L88LctGctT22AY.350.000466
ORF1ab/nsp188L88delCTG---22AY.360.000296
ORF1ab/nsp188L88delCTG---22AY.390.000049
ORF1ab/nsp188L88QcTgcAg22AY.40.000003
ORF1ab/nsp188L88MCtgAtg22AY.40.000003
ORF1ab/nsp188L88delCTG---22AY.4.50.000215
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg12AY.4.50.000107
ORF1ab/nsp188L88LctGctT12AY.4.50.000107
ORF1ab/nsp188L88LctGctT22AY.400.001929
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg22AY.46.50.000397
ORF1ab/nsp188L88PcTgcCg22AY.50.000041
ORF1ab/nsp188L88LctGctT22AY.600.001876
ORF1ab/nsp188L88LctGctT22AY.650.001066
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg12AY.70.000196
ORF1ab/nsp188L88LctGctT12AY.70.000196
ORF1ab/nsp188L88RcTgcGg22AY.730.001331
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg22AY.890.009804
ORF1ab/nsp188L88delCTG---22B.10.000018
ORF1ab/nsp188L88LctGctT22B.1.1.1590.009346
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg22B.1.1.2070.002364
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg22B.1.1.2410.004141
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg22B.1.1.3060.000877
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg22B.1.1.3120.003824
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg22B.1.1.3160.00185
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg12B.1.1.330.000421
ORF1ab/nsp188L88LctGctT12B.1.1.330.000421
ORF1ab/nsp188L88LctGctT22B.1.1.3550.030769
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg22B.1.1.3680.006173
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg12B.1.1.3720.000689
ORF1ab/nsp188L88LctGctT12B.1.1.3720.000689
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg22B.1.1.390.001019
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg12B.1.1.4480.002033
ORF1ab/nsp188L88LctGctT12B.1.1.4480.002033
ORF1ab/nsp188L88LctGctT22B.1.1.510.003436
ORF1ab/nsp188L88delCTG---22B.1.1770.000026
ORF1ab/nsp188L88delCTG---22B.1.177.40.000422
ORF1ab/nsp188L88LctGctT12B.1.177.60.000977
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg12B.1.177.60.000977
ORF1ab/nsp188L88delCTG---22B.1.20.000018
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg22B.1.2340.000264
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg22B.1.2600.006689
ORF1ab/nsp188L88LctGctT12B.1.2790.000514
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg12B.1.2790.000514
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg22B.1.3560.003454
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg22B.1.3710.002245
ORF1ab/nsp188L88delCTG---22B.1.4290.000047
ORF1ab/nsp188L88LctGctT12B.1.4690.00361
ORF1ab/nsp188L88LctGctA12B.1.4690.00361
ORF1ab/nsp188L88MCtgAtg22B.1.5260.000047
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg22B.1.6010.060606
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg22B.1.6100.007092
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg22B.1.9.50.011364
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg22B.30.001661
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg12B.6.60.000889
ORF1ab/nsp188L88LctGctT12B.6.60.000889
ORF1ab/nsp188L88delCTG---22N.40.008511
ORF1ab/nsp188L88delCTG---22N.60.014184
ORF1ab/nsp188L88delCTG---11A0.000387
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg11A.110.058824
ORF1ab/nsp188L88LctGctT11A.190.009434
ORF1ab/nsp188L88PcTgcCg11A.20.000662
ORF1ab/nsp188L88LctGctT11A.230.010526
ORF1ab/nsp188L88LctGctT11A.270.001656
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg11A.40.012821
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg11A.50.001923
ORF1ab/nsp188L88HcTGcAC11All0
ORF1ab/nsp188L88SCTgTCg11All0
ORF1ab/nsp188L88FCtGTtT11All0
ORF1ab/nsp188L88TCTgACg11All0
ORF1ab/nsp188L88RcTgcGg11AT.10.005128
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg11AV.10.005051
ORF1ab/nsp188L88LctGctT11AY.1010.00049
ORF1ab/nsp188L88PcTgcCg11AY.1030.000006
ORF1ab/nsp188L88delCTG---11AY.1030.000006
ORF1ab/nsp188L88LctGctT11AY.1040.001984
ORF1ab/nsp188L88LctGctT11AY.1050.000643
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg11AY.1090.00074
ORF1ab/nsp188L88LctGctT11AY.1100.000113
ORF1ab/nsp188L88delCTG---11AY.1160.000287
ORF1ab/nsp188L88delCTG---11AY.1190.000035
ORF1ab/nsp188L88MCtgAtg11AY.1190.000035
ORF1ab/nsp188L88delCTG---11AY.120.000316
ORF1ab/nsp188L88RcTgcGg11AY.1200.000037
ORF1ab/nsp188L88FCtGTtT11AY.230.00007
ORF1ab/nsp188L88PcTgcCg11AY.250.000006
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg11AY.280.00189
ORF1ab/nsp188L88MCtgAtg11AY.290.000016
ORF1ab/nsp188L88del1ctGct-11AY.30.00001
ORF1ab/nsp188L88QcTgcAg11AY.30.00001
ORF1ab/nsp188L88delCTG---11AY.380.000499
ORF1ab/nsp188L88LctGctT11AY.380.000499
ORF1ab/nsp188L88VCtgGtg11AY.4.20.000022
ORF1ab/nsp188L88LctGctA11AY.4.30.000842
ORF1ab/nsp188L88LctGctT11AY.4.40.000409
ORF1ab/nsp188L88del2cTGc--11AY.4.50.000107
ORF1ab/nsp188L88LctGctA11AY.410.000294
ORF1ab/nsp188L88del1ctGct-11AY.420.00004
ORF1ab/nsp188L88MCtgAtg11AY.440.000006
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg11AY.46.10.001027
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg11AY.480.000465
ORF1ab/nsp188L88RcTgcGg11AY.50.000021
ORF1ab/nsp188L88LctGctT11AY.5.40.000277
ORF1ab/nsp188L88LctGctT11AY.530.000288
ORF1ab/nsp188L88MCtgAtg11AY.530.000288
ORF1ab/nsp188L88delCTG---11AY.540.000095
ORF1ab/nsp188L88delCTG---11AY.550.000917
ORF1ab/nsp188L88LctGctT11AY.560.001605
ORF1ab/nsp188L88LctGctT11AY.570.000656
ORF1ab/nsp188L88QcTgcAg11AY.610.000105
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg11AY.630.000387
ORF1ab/nsp188L88delCTG---11AY.650.000533
ORF1ab/nsp188L88LctGctT11AY.680.000274
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg11AY.690.000187
ORF1ab/nsp188L88LctGctA11AY.730.000665
ORF1ab/nsp188L88delCTG---11AY.750.000056
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg11AY.770.001127
ORF1ab/nsp188L88LctGctT11AY.870.000833
ORF1ab/nsp188L88LctGctT11AY.880.000884
ORF1ab/nsp188L88del1Ctg-tg11AY.90.000068
ORF1ab/nsp188L88delCTG---11AY.9.10.000084
ORF1ab/nsp188L88MCtgAtg11AY.9.20.000037
ORF1ab/nsp188L88LctGctT11AY.910.00073
ORF1ab/nsp188L88LctGctA11AY.930.000273
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg11AY.940.000443
ORF1ab/nsp188L88delCTG---11AY.950.000761
ORF1ab/nsp188L88LctGctA11AY.950.000761
ORF1ab/nsp188L88VCtgGtg11AY.990.001049
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg11AY.99.10.001553
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg11AZ.20.000821
ORF1ab/nsp188L88PcTgcCg11B0.000128
ORF1ab/nsp188L88PcTgcCg11B.10.000009
ORF1ab/nsp188L88del1ctGct-11B.10.000009
ORF1ab/nsp188L88MCtgAtg11B.10.000009
ORF1ab/nsp188L88RcTgcGg11B.10.000009
ORF1ab/nsp188L88RcTgcGg11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp188L88del1ctGct-11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp188L88PcTgcCg11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg11B.1.1.10.000327
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg11B.1.1.100.001115
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg11B.1.1.1210.002427
ORF1ab/nsp188L88delCTG---11B.1.1.1250.010204
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg11B.1.1.1570.000913
ORF1ab/nsp188L88LctGctA11B.1.1.1610.003534
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg11B.1.1.1760.000439
ORF1ab/nsp188L88LctGctA11B.1.1.1890.001513
ORF1ab/nsp188L88LctGctT11B.1.1.1940.00495
ORF1ab/nsp188L88LctGctT11B.1.1.1980.001468
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg11B.1.1.2140.000055
ORF1ab/nsp188L88LctGctC11B.1.1.2250.007194
ORF1ab/nsp188L88del1ctGct-11B.1.1.2320.001815
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg11B.1.1.250.000569
ORF1ab/nsp188L88LctGctT11B.1.1.2510.007937
ORF1ab/nsp188L88LctGctT11B.1.1.2530.002506
ORF1ab/nsp188L88LctGctT11B.1.1.2630.001558
ORF1ab/nsp188L88LctGctT11B.1.1.2660.012195
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg11B.1.1.2730.006757
ORF1ab/nsp188L88LctGctT11B.1.1.2910.000742
ORF1ab/nsp188L88LctGctT11B.1.1.3010.001179
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg11B.1.1.3030.002762
ORF1ab/nsp188L88PcTGcCA11B.1.1.3060.000438
ORF1ab/nsp188L88del1ctGct-11B.1.1.3060.000438
ORF1ab/nsp188L88LctGctT11B.1.1.3110.000358
ORF1ab/nsp188L88LctGctA11B.1.1.3180.000302
ORF1ab/nsp188L88delCTG---11B.1.1.3220.008772
ORF1ab/nsp188L88LctGctT11B.1.1.3260.001761
ORF1ab/nsp188L88LctGctT11B.1.1.3540.004386
ORF1ab/nsp188L88LctGctT11B.1.1.3690.000446
ORF1ab/nsp188L88PcTgcCg11B.1.1.370.000193
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg11B.1.1.3770.001381
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg11B.1.1.3780.007299
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg11B.1.1.3820.035714
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg11B.1.1.4130.006897
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg11B.1.1.4170.002703
ORF1ab/nsp188L88LctGctA11B.1.1.4640.001473
ORF1ab/nsp188L88QcTgcAg11B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp188L88LctGctT11B.1.1.80.003584
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg11B.1.1040.00369
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg11B.1.1280.000635
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg11B.1.1310.008772
ORF1ab/nsp188L88MCtgAtg11B.1.1600.000031
ORF1ab/nsp188L88delCTG---11B.1.1600.000031
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg11B.1.1620.005025
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg11B.1.177.120.000152
ORF1ab/nsp188L88delCTG---11B.1.177.180.00116
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg11B.1.177.180.00116
ORF1ab/nsp188L88QcTgcAg11B.1.177.210.000076
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg11B.1.177.310.011494
ORF1ab/nsp188L88LctGctA11B.1.177.320.00135
ORF1ab/nsp188L88LctGctA11B.1.177.350.000691
ORF1ab/nsp188L88LctGctA11B.1.177.420.000894
ORF1ab/nsp188L88delCTG---11B.1.177.430.001477
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg11B.1.177.500.004695
ORF1ab/nsp188L88delCTG---11B.1.177.540.000606
ORF1ab/nsp188L88delCTG---11B.1.177.570.000281
ORF1ab/nsp188L88delCTG---11B.1.177.60.000977
ORF1ab/nsp188L88LctGctT11B.1.177.630.002703
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg11B.1.177.70.000165
ORF1ab/nsp188L88LctGctT11B.1.177.730.000566
ORF1ab/nsp188L88MCtgAtg11B.1.177.860.000183
ORF1ab/nsp188L88delCTG---11B.1.1790.003759
ORF1ab/nsp188L88PcTgcCg11B.1.20.000009
ORF1ab/nsp188L88QcTgcAg11B.1.20.000009
ORF1ab/nsp188L88LctGctT11B.1.2030.0625
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg11B.1.2060.000816
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg11B.1.2100.002132
ORF1ab/nsp188L88del1ctGct-11B.1.214.20.0006
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg11B.1.2180.005155
ORF1ab/nsp188L88PcTgcCg11B.1.2230.002778
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg11B.1.230.006061
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg11B.1.2410.000812
ORF1ab/nsp188L88delCTG---11B.1.2430.00007
ORF1ab/nsp188L88delCTG---11B.1.2580.000067
ORF1ab/nsp188L88del1ctGct-11B.1.258.140.00098
ORF1ab/nsp188L88LctGctT11B.1.3110.000275
ORF1ab/nsp188L88LctGctT11B.1.3240.001605
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg11B.1.3500.002933
ORF1ab/nsp188L88delCTG---11B.1.3510.00003
ORF1ab/nsp188L88LctGctT11B.1.351.20.000303
ORF1ab/nsp188L88delCTG---11B.1.360.000146
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg11B.1.36.100.004785
ORF1ab/nsp188L88LctGctT11B.1.36.160.001425
ORF1ab/nsp188L88LctGctT11B.1.36.220.001208
ORF1ab/nsp188L88LctGctT11B.1.36.240.006173
ORF1ab/nsp188L88LctGctT11B.1.36.270.000763
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg11B.1.36.310.001751
ORF1ab/nsp188L88LctGctT11B.1.36.360.000602
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg11B.1.36.380.001642
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg11B.1.36.80.001
ORF1ab/nsp188L88LctGctT11B.1.36.90.003215
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg11B.1.3660.004878
ORF1ab/nsp188L88QcTgcAg11B.1.3690.000285
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg11B.1.3750.00082
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg11B.1.3770.004566
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg11B.1.3890.001002
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg11B.1.416.10.001563
ORF1ab/nsp188L88delCTG---11B.1.4270.00005
ORF1ab/nsp188L88MCtgAtg11B.1.4290.000024
ORF1ab/nsp188L88VCtgGtg11B.1.4290.000024
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg11B.1.438.10.000107
ORF1ab/nsp188L88LctGctT11B.1.4560.003268
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg11B.1.4800.002488
ORF1ab/nsp188L88VCtgGtg11B.1.4990.00105
ORF1ab/nsp188L88LctGctT11B.1.5070.011236
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg11B.1.5090.000866
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg11B.1.5130.013889
ORF1ab/nsp188L88delCTG---11B.1.5250.000113
ORF1ab/nsp188L88PcTgcCg11B.1.5260.000024
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg11B.1.5270.003704
ORF1ab/nsp188L88TCTgACg11B.1.5380.008065
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg11B.1.5410.004425
ORF1ab/nsp188L88del2CTg--g11B.1.5610.000397
ORF1ab/nsp188L88LctGctT11B.1.5770.000687
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg11B.1.5800.004065
ORF1ab/nsp188L88delCTG---11B.1.5950.000261
ORF1ab/nsp188L88RcTgcGg11B.1.5990.00365
ORF1ab/nsp188L88RcTgcGg11B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp188L88QcTgcAg11B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp188L88SCTgTCg11B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp188L88HcTGcAC11B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg11B.1.6200.000946
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg11B.1.6280.000352
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg11B.1.6300.005236
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg11B.1.6360.006711
ORF1ab/nsp188L88PcTgcCg11B.1.6370.000073
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg11B.290.003509
ORF1ab/nsp188L88delCTG---11B.40.002208
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg11B.400.000364
ORF1ab/nsp188L88LctGctT11B.490.05
ORF1ab/nsp188L88delCTG---11B.550.00295
ORF1ab/nsp188L88LctGctT11B.60.00091
ORF1ab/nsp188L88LctGctT11C.10.002392
ORF1ab/nsp188L88delCTG---11C.350.000774
ORF1ab/nsp188L88LctGctT11C.350.000774
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg11C.390.018868
ORF1ab/nsp188L88PcTgcCg11D.20.000075
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg11N.50.001767
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg11P.1.10.000318
ORF1ab/nsp188L88VCtgGtg11P.1.10.000318
ORF1ab/nsp188L88LCtgTtg11P.1.100.000269
ORF1ab/nsp188L88LctGctT11P.1.120.000484
ORF1ab/nsp188L88LctGctT11P.40.003802
ORF1ab/nsp188L88LctGctT11R.20.014493