CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp1 : CodonNum = 86 & Codon = Att

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp186V86IV86InonsynGttAtt6996991521-523

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp186V86IGttAtt699699All0.000134
ORF1ab/nsp186V86IGttAtt187187AY.730.124418
ORF1ab/nsp186V86IGttAtt131131B.1.617.20.000493
ORF1ab/nsp186V86IGttAtt4747B.1.1.70.000042
ORF1ab/nsp186V86IGttAtt4040B.1.20.000352
ORF1ab/nsp186V86IGttAtt3535AY.40.000054
ORF1ab/nsp186V86IGttAtt3030AY.1030.000186
ORF1ab/nsp186V86IGttAtt2727AY.440.000164
ORF1ab/nsp186V86IGttAtt1515B.1.10.000272
ORF1ab/nsp186V86IGttAtt1414B.1.2340.001847
ORF1ab/nsp186V86IGttAtt1212AY.30.000119
ORF1ab/nsp186V86IGttAtt1212AY.430.000053
ORF1ab/nsp186V86IGttAtt1111B.1.258.170.001144
ORF1ab/nsp186V86IGttAtt1010AY.120.003161
ORF1ab/nsp186V86IGttAtt88AY.1000.000368
ORF1ab/nsp186V86IGttAtt88AY.1190.000282
ORF1ab/nsp186V86IGttAtt88AY.250.000048
ORF1ab/nsp186V86IGttAtt88AY.4.20.000174
ORF1ab/nsp186V86IGttAtt88B.1.5260.000188
ORF1ab/nsp186V86IGttAtt77B.1.5030.017413
ORF1ab/nsp186V86IGttAtt55AY.230.000349
ORF1ab/nsp186V86IGttAtt55B.1.1.3180.001509
ORF1ab/nsp186V86IGttAtt44AY.1200.000149
ORF1ab/nsp186V86IGttAtt44B.10.000037
ORF1ab/nsp186V86IGttAtt33AY.23.10.001252
ORF1ab/nsp186V86IGttAtt33AY.420.000121
ORF1ab/nsp186V86IGttAtt33B.1.1.2840.000322
ORF1ab/nsp186V86IGttAtt33B.1.6210.000266
ORF1ab/nsp186V86IGttAtt22AY.10.000791
ORF1ab/nsp186V86IGttAtt22AY.350.000466
ORF1ab/nsp186V86IGttAtt22B.1.1.1530.002191
ORF1ab/nsp186V86IGttAtt22B.1.1.500.001358
ORF1ab/nsp186V86IGttAtt22B.1.2980.004228
ORF1ab/nsp186V86IGttAtt22P.10.000032
ORF1ab/nsp186V86IGttAtt22P.1.160.000748
ORF1ab/nsp186V86IGttAtt11AD.20.000219
ORF1ab/nsp186V86IGttAtt11AY.1020.000027
ORF1ab/nsp186V86IGttAtt11AY.1160.000287
ORF1ab/nsp186V86IGttAtt11AY.1170.000085
ORF1ab/nsp186V86IGttAtt11AY.1180.000063
ORF1ab/nsp186V86IGttAtt11AY.16.10.00047
ORF1ab/nsp186V86IGttAtt11AY.270.000065
ORF1ab/nsp186V86IGttAtt11AY.290.000016
ORF1ab/nsp186V86IGttAtt11AY.330.000067
ORF1ab/nsp186V86IGttAtt11AY.390.000025
ORF1ab/nsp186V86IGttAtt11AY.400.000964
ORF1ab/nsp186V86IGttAtt11AY.460.000104
ORF1ab/nsp186V86IGttAtt11AY.46.40.000165
ORF1ab/nsp186V86IGttAtt11AY.470.000031
ORF1ab/nsp186V86IGttAtt11AY.50.000021
ORF1ab/nsp186V86IGttAtt11AY.560.001605
ORF1ab/nsp186V86IGttAtt11AY.650.000533
ORF1ab/nsp186V86IGttAtt11AY.740.000116
ORF1ab/nsp186V86IGttAtt11AY.75.10.00018
ORF1ab/nsp186V86IGttAtt11AY.880.000884
ORF1ab/nsp186V86IGttAtt11AY.90.000068
ORF1ab/nsp186V86IGttAtt11AY.980.000079
ORF1ab/nsp186V86IGttAtt11AY.99.20.000092
ORF1ab/nsp186V86IGttAtt11B.1.1.2070.001182
ORF1ab/nsp186V86IGttAtt11B.1.1.2170.003636
ORF1ab/nsp186V86IGttAtt11B.1.1.3030.002762
ORF1ab/nsp186V86IGttAtt11B.1.1.3060.000438
ORF1ab/nsp186V86IGttAtt11B.1.1.3480.000796
ORF1ab/nsp186V86IGttAtt11B.1.1.4090.002833
ORF1ab/nsp186V86IGttAtt11B.1.1.5190.00004
ORF1ab/nsp186V86IGttAtt11B.1.1.700.000341
ORF1ab/nsp186V86IGttAtt11B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp186V86IGttAtt11B.1.2100.002132
ORF1ab/nsp186V86IGttAtt11B.1.5960.000087
ORF1ab/nsp186V86IGttAtt11D.20.000075
ORF1ab/nsp186V86IGttAtt11P.1.20.001156
ORF1ab/nsp186V86IGttAtt11Q.10.000126