CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp1 : CodonNum = 85 & Codon = atT

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp185M85IM85InonsynatGatT11008280.752727518-520

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp185M85IatGatT8281100All0.000158
ORF1ab/nsp185M85IatGatT117174AY.40.000182
ORF1ab/nsp185M85IatGatT108120B.1.1.70.000097
ORF1ab/nsp185M85IatGatT6378B.1.617.20.000237
ORF1ab/nsp185M85IatGatT7474AY.250.000445
ORF1ab/nsp185M85IatGatT172AY.340.000097
ORF1ab/nsp185M85IatGatT1640AY.430.000071
ORF1ab/nsp185M85IatGatT3034AY.440.000183
ORF1ab/nsp185M85IatGatT3232AY.1010.015694
ORF1ab/nsp185M85IatGatT2728AY.390.000667
ORF1ab/nsp185M85IatGatT2226AY.1030.000137
ORF1ab/nsp185M85IatGatT1324B.10.000119
ORF1ab/nsp185M85IatGatT922B.1.20.000079
ORF1ab/nsp185M85IatGatT2020AY.200.000777
ORF1ab/nsp185M85IatGatT1919AY.140.001672
ORF1ab/nsp185M85IatGatT1818B.1.10.000327
ORF1ab/nsp185M85IatGatT1717AY.4.20.000369
ORF1ab/nsp185M85IatGatT1314AY.1210.001759
ORF1ab/nsp185M85IatGatT1314P.10.000205
ORF1ab/nsp185M85IatGatT1212AY.1020.000318
ORF1ab/nsp185M85IatGatT1212B.1.1.5190.000477
ORF1ab/nsp185M85IatGatT1011AY.30.000099
ORF1ab/nsp185M85IatGatT99AY.780.013867
ORF1ab/nsp185M85IatGatT99B.1.177.350.00622
ORF1ab/nsp185M85IatGatT78AY.330.000467
ORF1ab/nsp185M85IatGatT78AY.470.000218
ORF1ab/nsp185M85IatGatT88B.1.1770.000105
ORF1ab/nsp185M85IatGatT77AY.230.000488
ORF1ab/nsp185M85IatGatT57AY.610.000524
ORF1ab/nsp185M85IatGatT66B.1.4160.007614
ORF1ab/nsp185M85IatGatT45B.1.4290.000094
ORF1ab/nsp185M85IatGatT34AY.1180.000188
ORF1ab/nsp185M85IatGatT34AY.290.000047
ORF1ab/nsp185M85IatGatT44AY.420.000161
ORF1ab/nsp185M85IatGatT33AY.1060.001005
ORF1ab/nsp185M85IatGatT33AY.260.000085
ORF1ab/nsp185M85IatGatT33AY.4.50.000322
ORF1ab/nsp185M85IatGatT33AY.740.000347
ORF1ab/nsp185M85IatGatT33AY.750.000168
ORF1ab/nsp185M85IatGatT13AY.98.10.000048
ORF1ab/nsp185M85IatGatT33B.1.1.2840.000322
ORF1ab/nsp185M85IatGatT33B.1.177.420.002683
ORF1ab/nsp185M85IatGatT33B.1.3510.000089
ORF1ab/nsp185M85IatGatT33B.1.6090.001438
ORF1ab/nsp185M85IatGatT33C.36.30.001702
ORF1ab/nsp185M85IatGatT33D.20.000225
ORF1ab/nsp185M85IatGatT33P.1.170.000485
ORF1ab/nsp185M85IatGatT22AY.1190.000071
ORF1ab/nsp185M85IatGatT12AY.29.10.000221
ORF1ab/nsp185M85IatGatT12AY.3.10.000085
ORF1ab/nsp185M85IatGatT12AY.46.40.000165
ORF1ab/nsp185M85IatGatT12AY.50.000021
ORF1ab/nsp185M85IatGatT12AY.5.40.000277
ORF1ab/nsp185M85IatGatT12AY.840.000437
ORF1ab/nsp185M85IatGatT22AY.90.000135
ORF1ab/nsp185M85IatGatT22B.1.1.370.000386
ORF1ab/nsp185M85IatGatT22B.1.1.5180.012658
ORF1ab/nsp185M85IatGatT22B.1.1600.000062
ORF1ab/nsp185M85IatGatT12B.1.2060.000816
ORF1ab/nsp185M85IatGatT12B.1.5260.000024
ORF1ab/nsp185M85IatGatT11AA.10.007246
ORF1ab/nsp185M85IatGatT11AY.1000.000046
ORF1ab/nsp185M85IatGatT11AY.1080.001103
ORF1ab/nsp185M85IatGatT11AY.1090.00074
ORF1ab/nsp185M85IatGatT11AY.1170.000085
ORF1ab/nsp185M85IatGatT11AY.1200.000037
ORF1ab/nsp185M85IatGatT11AY.130.000161
ORF1ab/nsp185M85IatGatT11AY.370.000316
ORF1ab/nsp185M85IatGatT11AY.450.000122
ORF1ab/nsp185M85IatGatT11AY.46.60.000072
ORF1ab/nsp185M85IatGatT11AY.540.000095
ORF1ab/nsp185M85IatGatT11AY.550.000917
ORF1ab/nsp185M85IatGatT11AY.580.000907
ORF1ab/nsp185M85IatGatT11AY.70.000196
ORF1ab/nsp185M85IatGatT11AY.7.10.000113
ORF1ab/nsp185M85IatGatT11AY.75.10.00018
ORF1ab/nsp185M85IatGatT11AY.9.20.000037
ORF1ab/nsp185M85IatGatT11AY.940.000443
ORF1ab/nsp185M85IatGatT11AY.980.000079
ORF1ab/nsp185M85IatGatT11AY.990.001049
ORF1ab/nsp185M85IatGatT11B.1.1.2140.000055
ORF1ab/nsp185M85IatGatT11B.1.1.3170.000412
ORF1ab/nsp185M85IatGatT11B.1.1.3180.000302
ORF1ab/nsp185M85IatGatT11B.1.1.3500.04
ORF1ab/nsp185M85IatGatT11B.1.1.500.000679
ORF1ab/nsp185M85IatGatT11B.1.177.100.000878
ORF1ab/nsp185M85IatGatT11B.1.177.440.000519
ORF1ab/nsp185M85IatGatT11B.1.177.560.000668
ORF1ab/nsp185M85IatGatT11B.1.177.600.000218
ORF1ab/nsp185M85IatGatT11B.1.177.720.00339
ORF1ab/nsp185M85IatGatT11B.1.177.730.000566
ORF1ab/nsp185M85IatGatT11B.1.177.860.000183
ORF1ab/nsp185M85IatGatT11B.1.2140.003663
ORF1ab/nsp185M85IatGatT11B.1.2210.000071
ORF1ab/nsp185M85IatGatT11B.1.2360.002053
ORF1ab/nsp185M85IatGatT11B.1.258.170.000104
ORF1ab/nsp185M85IatGatT11B.1.3060.005714
ORF1ab/nsp185M85IatGatT11B.1.360.000146
ORF1ab/nsp185M85IatGatT11B.1.3910.001127
ORF1ab/nsp185M85IatGatT11B.1.3960.000706
ORF1ab/nsp185M85IatGatT11B.1.4270.00005
ORF1ab/nsp185M85IatGatT11B.1.438.10.000107
ORF1ab/nsp185M85IatGatT11B.1.4430.004673
ORF1ab/nsp185M85IatGatT11B.1.5270.003704
ORF1ab/nsp185M85IatGatT11B.1.5760.000907
ORF1ab/nsp185M85IatGatT11B.1.5770.000687
ORF1ab/nsp185M85IatGatT11B.1.5960.000087
ORF1ab/nsp185M85IatGatT11B.1.6210.000089
ORF1ab/nsp185M85IatGatT11B.1.6230.000536
ORF1ab/nsp185M85IatGatT11B.1.6370.000073
ORF1ab/nsp185M85IatGatT11B.1.930.000934
ORF1ab/nsp185M85IatGatT11B.1.940.027027
ORF1ab/nsp185M85IatGatT11B.560.028571
ORF1ab/nsp185M85IatGatT11P.1.70.000319
ORF1ab/nsp185M85IatGatT11P.40.003802