CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp1 : CodonNum = 85 & Codon = aCg

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp185M85TM85TnonsynaTgaCg1601550.96875518-520

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp185M85TaTgaCg155160All0.00003
ORF1ab/nsp185M85TaTgaCg3737AY.40.000058
ORF1ab/nsp185M85TaTgaCg2324B.1.1.70.000021
ORF1ab/nsp185M85TaTgaCg1919AY.440.000116
ORF1ab/nsp185M85TaTgaCg1313B.1.617.20.000049
ORF1ab/nsp185M85TaTgaCg1111B.1.20.000097
ORF1ab/nsp185M85TaTgaCg77B.1.4290.000165
ORF1ab/nsp185M85TaTgaCg56B.10.000046
ORF1ab/nsp185M85TaTgaCg55AY.4.20.000108
ORF1ab/nsp185M85TaTgaCg55AY.430.000022
ORF1ab/nsp185M85TaTgaCg44P.1.70.001277
ORF1ab/nsp185M85TaTgaCg33AY.1210.000406
ORF1ab/nsp185M85TaTgaCg33AY.99.20.000276
ORF1ab/nsp185M85TaTgaCg22AY.250.000012
ORF1ab/nsp185M85TaTgaCg22AY.4.2.10.000298
ORF1ab/nsp185M85TaTgaCg22AY.460.000208
ORF1ab/nsp185M85TaTgaCg12AY.540.000095
ORF1ab/nsp185M85TaTgaCg22B.1.1280.001271
ORF1ab/nsp185M85TaTgaCg11AY.1090.00074
ORF1ab/nsp185M85TaTgaCg11AY.200.000039
ORF1ab/nsp185M85TaTgaCg11AY.39.10.00004
ORF1ab/nsp185M85TaTgaCg11AY.39.20.001541
ORF1ab/nsp185M85TaTgaCg11AY.420.00004
ORF1ab/nsp185M85TaTgaCg11AY.930.000273
ORF1ab/nsp185M85TaTgaCg11B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp185M85TaTgaCg11B.1.177.440.000519
ORF1ab/nsp185M85TaTgaCg11B.1.6370.000073
ORF1ab/nsp185M85TaTgaCg11P.1.140.000048
ORF1ab/nsp185M85TaTgaCg11Q.30.000145