CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp1 : CodonNum = 85 & Codon = aAg

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp185M85KM85KnonsynaTgaAg178617820.99776518-520

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg17821786All0.000341
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg554554AY.40.000862
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg127130B.1.1.70.000114
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg9090AY.430.000399
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg8383B.1.617.20.000313
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg7474AY.470.002302
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg7171AY.250.000427
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg5858AY.440.000353
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg5353AY.30.000527
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg5151AY.1030.000317
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg4343AY.1200.001599
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg2929B.10.000266
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg2323AY.1020.00061
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg2323AY.120.007269
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg2222AY.50.000454
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg1919AY.390.00047
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg1818AY.260.00051
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg1818AY.4.20.00039
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg1616B.1.20.000141
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg1515AY.750.00084
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg1414AY.9.20.000514
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg1313AY.290.000205
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg1111AY.70.002156
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg1010AY.420.000402
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg99B.1.5260.000212
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg88AY.350.001864
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg77AY.1000.000322
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg77AY.140.000616
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg77AY.340.000679
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg77AY.39.10.000277
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg77AY.990.007345
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg77B.1.1770.000092
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg77B.1.6210.00062
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg66AY.120.10.001926
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg66AY.200.000233
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg66AY.3.10.000512
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg66AY.4.2.10.000894
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg66AY.450.00073
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg66AY.46.60.000433
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg66AY.9.10.000502
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg55AY.1180.000313
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg55AY.1190.000177
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg55AY.7.10.000564
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg55B.1.1.5230.007812
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg55B.1.3510.000149
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg55B.1.4290.000118
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg55P.10.000079
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg44AY.23.10.001669
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg44AY.360.000593
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg44AY.4.50.00043
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg44AY.460.000416
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg44AY.46.40.000658
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg44AY.46.50.000794
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg44AY.60.000165
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg44AY.90.00027
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg44B.1.1.2140.000222
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg44B.1.1600.000125
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg44B.1.2100.008529
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg44B.1.2340.000528
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg44B.1.2430.000278
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg44P.1.140.000191
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg33A.20.001985
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg33AY.330.0002
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg33AY.540.000286
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg33B.1.10.000054
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg33B.1.177.210.000229
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg33B.1.2580.0002
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg33B.1.4000.001287
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg22AY.1100.000225
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg22AY.1140.000462
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg22AY.120.2.10.000997
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg22AY.1210.000271
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg22AY.130.000322
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg22AY.160.000759
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg22AY.270.000129
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg22AY.39.1.10.001449
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg22AY.4.10.001475
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg22AY.5.30.000675
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg22AY.5.40.000553
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg22AY.650.001066
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg22AY.660.002139
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg22AY.7.20.001119
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg22AY.900.001369
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg22AY.99.20.000184
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg22B.1.1.1700.002494
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg22B.1.1.2070.002364
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg22B.1.1.2220.000408
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg22B.1.1.2430.008163
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg22B.1.1.5130.024691
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg22B.1.177.810.000379
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg22B.1.2400.000431
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg22B.1.3110.000549
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg22B.1.3490.00143
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg22B.1.438.10.000215
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg22C.370.000232
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg110.055556
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg11A.2.50.000499
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg11A.23.10.000704
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg11AW.10.003049
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg11AY.100.00053
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg11AY.1060.000335
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg11AY.1080.001103
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg11AY.1090.00074
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg11AY.150.002222
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg11AY.29.10.000221
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg11AY.300.000396
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg11AY.320.000532
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg11AY.4.40.000409
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg11AY.410.000294
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg11AY.520.000814
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg11AY.610.000105
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg11AY.710.000475
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg11AY.740.000116
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg11AY.75.10.00018
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg11AY.790.001211
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg11AY.850.000427
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg11AY.940.000443
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg11AY.980.000079
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg11AY.98.10.000048
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg11AZ.50.003509
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg11B0.000128
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg11B.1.1.10.000327
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg11B.1.1.2180.007692
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg11B.1.1.2840.000107
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg11B.1.1.2940.001266
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg11B.1.1.3690.000446
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg11B.1.1.370.000193
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg11B.1.1.390.00051
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg11B.1.1.4160.000905
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg11B.1.1.4330.001425
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg11B.1.1.460.004367
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg11B.1.1.500.000679
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg11B.1.1.5260.003546
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg11B.1.1050.009615
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg11B.1.1120.005181
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg11B.1.177.170.000821
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg11B.1.177.420.000894
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg11B.1.177.840.006667
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg11B.1.214.20.0006
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg11B.1.2210.000071
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg11B.1.221.40.004167
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg11B.1.2320.000537
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg11B.1.258.170.000104
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg11B.1.2790.000514
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg11B.1.2890.00266
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg11B.1.36.10.00114
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg11B.1.36.160.001425
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg11B.1.3610.001289
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg11B.1.3710.001122
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg11B.1.3800.006623
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg11B.1.3990.001934
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg11B.1.4160.001269
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg11B.1.4270.00005
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg11B.1.5640.000426
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg11B.1.5650.00081
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg11B.1.5750.000303
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg11B.1.5770.000687
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg11B.1.5950.000261
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg11B.1.617.10.000129
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg11B.1.6300.005236
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg11B.1.6370.000073
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg11C.36.30.000567
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg11P.1.10.000318
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg11P.1.100.000269
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg11P.1.170.000162
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg11P.40.003802
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg11Q.10.000126
ORF1ab/nsp185M85KaTgaAg11W.40.001351