CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp1 : CodonNum = 85 & Codon = a--

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp185M85del2M85del2delaTGa--59490.830508518-520

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp185M85del2aTGa--4959All0.000009
ORF1ab/nsp185M85del2aTGa--1010AY.40.000016
ORF1ab/nsp185M85del2aTGa--16AY.260.000028
ORF1ab/nsp185M85del2aTGa--56B.1.1.70.000004
ORF1ab/nsp185M85del2aTGa--24AY.30.00002
ORF1ab/nsp185M85del2aTGa--33AY.4.20.000065
ORF1ab/nsp185M85del2aTGa--33AY.440.000018
ORF1ab/nsp185M85del2aTGa--33D.20.000225
ORF1ab/nsp185M85del2aTGa--22B.1.5960.000174
ORF1ab/nsp185M85del2aTGa--11AY.230.00007
ORF1ab/nsp185M85del2aTGa--11AY.250.000006
ORF1ab/nsp185M85del2aTGa--11AY.360.000148
ORF1ab/nsp185M85del2aTGa--11AY.390.000025
ORF1ab/nsp185M85del2aTGa--11AY.39.10.00004
ORF1ab/nsp185M85del2aTGa--11AY.470.000031
ORF1ab/nsp185M85del2aTGa--11AY.740.000116
ORF1ab/nsp185M85del2aTGa--11B.1.1.2080.012195
ORF1ab/nsp185M85del2aTGa--11B.1.1.4200.001006
ORF1ab/nsp185M85del2aTGa--11B.1.1600.000031
ORF1ab/nsp185M85del2aTGa--11B.1.160.160.000929
ORF1ab/nsp185M85del2aTGa--11B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp185M85del2aTGa--11B.1.177.40.000211
ORF1ab/nsp185M85del2aTGa--11B.1.177.440.000519
ORF1ab/nsp185M85del2aTGa--11B.1.177.730.000566
ORF1ab/nsp185M85del2aTGa--11B.1.20.000009
ORF1ab/nsp185M85del2aTGa--11B.1.3510.00003
ORF1ab/nsp185M85del2aTGa--11B.1.3990.001934
ORF1ab/nsp185M85del2aTGa--11B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp185M85del2aTGa--11P.10.000016