CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp1 : CodonNum = 85 & Codon = -tg

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp185M85del1M85del1delAtg-tg110610580.9566518-520

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg10581106All0.000202
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg189189AY.440.00115
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg182184AY.1030.00113
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg134135AY.250.000806
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg126131B.1.617.20.000474
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg7577AY.30.000746
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg5152AY.260.001444
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg2828AY.200.001088
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg2727AY.750.001513
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg2323AY.470.000715
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg2121AY.1190.000741
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg1920AY.140.001672
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg1920AY.390.00047
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg1819B.1.1.70.000016
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg416AY.40.000006
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg1212AY.1180.000752
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg912AY.430.00004
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg1111AY.1170.00093
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg99AY.116.10.002803
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg88AY.3.10.000682
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg67AY.130.000966
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg67AY.39.10.000238
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg66AY.1130.000854
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg56AY.50.000103
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg56B.1.20.000044
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg55B.1.4290.000118
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg44AY.1070.001864
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg44AY.20.001425
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg44AY.340.000388
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg23AY.350.000466
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg33AY.480.001395
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg13B.10.000009
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg22AY.10.000791
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg22AY.1000.000092
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg22AY.1140.000462
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg12AY.330.000067
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg22AY.770.002255
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg22B.1.1470.001512
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg22B.1.3510.000059
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg22B.1.6230.001073
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg11A.2.50.000499
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg11AY.1060.000335
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg11AY.1160.000287
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg11AY.34.10.00051
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg11AY.360.000148
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg11AY.46.40.000165
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg11AY.46.60.000072
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg11AY.520.000814
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg11AY.560.001605
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg11AY.620.000436
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg11AY.640.000595
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg11AY.700.000209
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg11AY.860.00083
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg11AY.9.10.000084
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg11AY.950.000761
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg11B.1.1.1760.000439
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg11B.1.1.3180.000302
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg11B.1.1050.009615
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg11B.1.1600.000031
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg11B.1.177.830.001481
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg11B.1.4270.00005
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg11B.1.5800.004065
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg11C.370.000116
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg11P.1.100.000269
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg11P.1.120.000484
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg11P.1.170.000162
ORF1ab/nsp185M85del1Atg-tg11R.10.00009