CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp1 : CodonNum = 84 & Codon = gtC

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp184V84VV84VsyngtTgtC47874820.100689515-517

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC4824787All0.000092
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC6687AY.40.000009
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC41391B.1.617.20.000154
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC46327B.1.1.70.000041
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC69215AY.430.000306
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC20140AY.440.000122
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC15120AY.250.00009
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC786AY.1030.000043
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC7980B.1.6280.027837
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC264AY.4.20.000043
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC1251B.10.00011
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC948AY.390.000222
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC438AY.1190.000141
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC932B.1.1770.000119
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC130AY.1020.000027
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC330AY.50.000062
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC830B.1.20.00007
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC1530B.1.5260.000353
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC2027B.1.10.000363
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC923B.1.6210.000797
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC419P.10.000063
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC218AY.470.000062
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC1618B.1.1.4340.005577
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC115AY.1000.000046
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC415B.1.2210.000284
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC614B.1.258.170.000624
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC312AY.330.0002
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC211AY.230.000139
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC311B.1.4290.000071
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC110AY.60.000041
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC1010B.1.177.520.017575
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC19AY.460.000104
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC69AY.7.10.000676
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC99B.1.1.700.00307
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC17AY.4.50.000107
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC27B.1.2580.000133
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC27R.10.00018
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC66B.1.1.3220.052632
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC16B.1.177.210.000076
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC15AY.9.10.000084
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC34AY.34.10.00153
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC44B.1.5610.001588
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC14Q.10.000126
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC23AY.5.40.000553
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC13AY.910.00073
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC23B.1.1.500.001358
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC23B.1.1.630.000772
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC12AY.920.000287
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC12B.1.4270.00005
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC12Q.80.000165
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC11B.1.1.150.013514
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC11B.1.1.3760.005952
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC11B.1.160.230.004831
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC11B.1.177.230.003236
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC11B.1.177.320.00135
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC11B.1.177.60.000977
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC11B.1.177.730.000566
ORF1ab/nsp184V84VgtTgtC11B.1.36.290.000517