CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp1 : CodonNum = 82

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp182G82delG82deldelGGT---23009230091509-511
ORF1ab/nsp182G82SG82SnonsynGgtAgt6376350.99686509-511
ORF1ab/nsp182G82SG82SnonsynGgTAgC63710.00156986509-511
ORF1ab/nsp182G82SG82SnonsynGGtTCt63710.00156986509-511
ORF1ab/nsp182G82GG82GsynggTggC3703350.905405509-511
ORF1ab/nsp182G82GG82GsynggTggA370200.0540541509-511
ORF1ab/nsp182G82GG82GsynggTggG370150.0405405509-511
ORF1ab/nsp182G82DG82DnonsyngGtgAt3383370.997041509-511
ORF1ab/nsp182G82DG82DnonsyngGTgAC33810.00295858509-511
ORF1ab/nsp182G82del2G82del2delgGTg--2822790.989362509-511
ORF1ab/nsp182G82del2G82del2delGGT--N28210.0035461509-511
ORF1ab/nsp182G82del2G82del2delGGTA--28210.0035461509-511
ORF1ab/nsp182G82del2G82del2delGGt--t28210.0035461509-511
ORF1ab/nsp182G82VG82VnonsyngGtgTt1451410.972414509-511
ORF1ab/nsp182G82VG82VnonsyngGTgTG14520.0137931509-511
ORF1ab/nsp182G82VG82VnonsyngGTgTA14520.0137931509-511
ORF1ab/nsp182G82del1G82del1delGgT-gN89510.573034509-511
ORF1ab/nsp182G82del1G82del1delggTgg-89200.224719509-511
ORF1ab/nsp182G82del1G82del1delGGT-NN89110.123596509-511
ORF1ab/nsp182G82del1G82del1delGgt-gt8950.0561798509-511
ORF1ab/nsp182G82del1G82del1delGGt-Nt8910.011236509-511
ORF1ab/nsp182G82del1G82del1delgGTgA-8910.011236509-511
ORF1ab/nsp182G82CG82CnonsynGgtTgt67671509-511
ORF1ab/nsp182G82AG82AnonsyngGtgCt17150.882353509-511
ORF1ab/nsp182G82AG82AnonsyngGTgCA1710.0588235509-511
ORF1ab/nsp182G82AG82AnonsyngGTgCG1710.0588235509-511
ORF1ab/nsp182G82EG82EnonsyngGTgAG16150.9375509-511
ORF1ab/nsp182G82EG82EnonsyngGTgAA1610.0625509-511
ORF1ab/nsp182G82RG82RnonsynGgtCgt551509-511
ORF1ab/nsp182G82NG82NnonsynGGTAAC210.5509-511
ORF1ab/nsp182G82NG82NnonsynGGtAAt210.5509-511
ORF1ab/nsp182G82LG82LnonsynGGTCTA111509-511
ORF1ab/nsp182G82KG82KnonsynGGTAAA111509-511
ORF1ab/nsp182G82XG82XnonsynGgTTgA111509-511
ORF1ab/nsp182G82WG82WnonsynGgTTgG111509-511
ORF1ab/nsp182G82FG82FnonsynGGTTTC111509-511
ORF1ab/nsp182G82TG82TnonsynGGtACt111509-511
ORF1ab/nsp182G82IG82InonsynGGTATC111509-511

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp182G82delGGT---2300923009All0.004401
ORF1ab/nsp182G82delGGT---49304930AY.40.007673
ORF1ab/nsp182G82delGGT---18651865B.1.1.70.00167
ORF1ab/nsp182G82delGGT---16291629AY.260.046117
ORF1ab/nsp182G82delGGT---14781478B.1.617.20.005565
ORF1ab/nsp182G82delGGT---13801380AY.4.20.02993
ORF1ab/nsp182G82delGGT---11901190AY.430.005272
ORF1ab/nsp182G82delGGT---760760AY.440.004626
ORF1ab/nsp182G82delGGT---648648AY.250.003898
ORF1ab/nsp182G82SGgtAgt635637All0.000121
ORF1ab/nsp182G82SGGtTCt1637All0
ORF1ab/nsp182G82SGgTAgC1637All0
ORF1ab/nsp182G82delGGT---503503AY.1200.018701
ORF1ab/nsp182G82delGGT---464464AY.1030.002881
ORF1ab/nsp182G82delGGT---444444AY.30.004416
ORF1ab/nsp182G82GggTggC335370All0.000064
ORF1ab/nsp182G82GggTggA20370All0.000004
ORF1ab/nsp182G82GggTggG15370All0.000003
ORF1ab/nsp182G82DgGtgAt337338All0.000064
ORF1ab/nsp182G82DgGTgAC1338All0
ORF1ab/nsp182G82delGGT---326326B.1.6210.028857
ORF1ab/nsp182G82del2gGTg--279282All0.000053
ORF1ab/nsp182G82del2GGt--t1282All0
ORF1ab/nsp182G82del2GGT--N1282All0
ORF1ab/nsp182G82del2GGTA--1282All0
ORF1ab/nsp182G82delGGT---260260AY.190.296465
ORF1ab/nsp182G82delGGT---245245AY.50.005059
ORF1ab/nsp182G82delGGT---244244AY.390.00603
ORF1ab/nsp182G82delGGT---209209AY.1020.005541
ORF1ab/nsp182G82delGGT---203203B.10.001859
ORF1ab/nsp182G82delGGT---200200AY.80.121212
ORF1ab/nsp182G82delGGT---195195AY.750.010924
ORF1ab/nsp182G82SGgtAgt163163AY.60.006704
ORF1ab/nsp182G82delGGT---160160AY.270.010355
ORF1ab/nsp182G82delGGT---160160B.1.20.001409
ORF1ab/nsp182G82VgGtgTt141145All0.000027
ORF1ab/nsp182G82VgGTgTA2145All0
ORF1ab/nsp182G82VgGTgTG2145All0
ORF1ab/nsp182G82delGGT---143143AY.46.50.028373
ORF1ab/nsp182G82delGGT---129129AY.470.004013
ORF1ab/nsp182G82delGGT---127127AY.420.005109
ORF1ab/nsp182G82delGGT---124124B.1.1770.001633
ORF1ab/nsp182G82delGGT---122122AY.39.10.004833
ORF1ab/nsp182G82delGGT---113113B.1.1.2140.006267
ORF1ab/nsp182G82SGgtAgt107107B.1.1.70.000096
ORF1ab/nsp182G82delGGT---106106AY.9.20.003893
ORF1ab/nsp182G82delGGT---100100AY.460.010408
ORF1ab/nsp182G82delGGT---9898AY.60.004031
ORF1ab/nsp182G82DgGtgAt9595AY.40.000148
ORF1ab/nsp182G82GggTggC9294B.1.1.70.000082
ORF1ab/nsp182G82GggTggG294B.1.1.70.000002
ORF1ab/nsp182G82delGGT---9292AY.290.001451
ORF1ab/nsp182G82delGGT---9191AY.46.60.006571
ORF1ab/nsp182G82delGGT---9090AY.740.010408
ORF1ab/nsp182G82delGGT---9090B.1.5260.002115
ORF1ab/nsp182G82del1GgT-gN5189All0.00001
ORF1ab/nsp182G82del1ggTgg-2089All0.000004
ORF1ab/nsp182G82del1GGT-NN1189All0.000002
ORF1ab/nsp182G82del1Ggt-gt589All0.000001
ORF1ab/nsp182G82del1GGt-Nt189All0
ORF1ab/nsp182G82del1gGTgA-189All0
ORF1ab/nsp182G82delGGT---8989AY.330.005943
ORF1ab/nsp182G82delGGT---8888AY.1190.003107
ORF1ab/nsp182G82delGGT---8383B.1.10.001506
ORF1ab/nsp182G82delGGT---8282P.10.001292
ORF1ab/nsp182G82delGGT---7777AY.540.007342
ORF1ab/nsp182G82delGGT---7575B.1.177.210.005735
ORF1ab/nsp182G82delGGT---7373AY.46.40.012009
ORF1ab/nsp182G82delGGT---7373B0.00933
ORF1ab/nsp182G82delGGT---7070AY.200.002721
ORF1ab/nsp182G82delGGT---6969AY.99.20.006359
ORF1ab/nsp182G82CGgtTgt6767All0.000013
ORF1ab/nsp182G82del2gGTg--6666AY.40.000103
ORF1ab/nsp182G82delGGT---6161AY.1170.005156
ORF1ab/nsp182G82SGgtAgt6161AY.40.000095
ORF1ab/nsp182G82GggTggC6061B.1.1770.00079
ORF1ab/nsp182G82GggTggA161B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp182G82delGGT---5959AY.1180.003696
ORF1ab/nsp182G82delGGT---5959AY.90.003988
ORF1ab/nsp182G82delGGT---5757B.1.1.5190.002264
ORF1ab/nsp182G82delGGT---5757B.1.3510.001694
ORF1ab/nsp182G82delGGT---5555B.1.4290.001294
ORF1ab/nsp182G82DgGtgAt5354B.1.1.70.000047
ORF1ab/nsp182G82DgGTgAC154B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp182G82delGGT---5353AY.9.10.004437
ORF1ab/nsp182G82delGGT---5252P.1.140.002486
ORF1ab/nsp182G82delGGT---5151AY.650.027186
ORF1ab/nsp182G82delGGT---5151AY.7.10.005748
ORF1ab/nsp182G82delGGT---5050B.1.2580.003327
ORF1ab/nsp182G82delGGT---4949AY.1000.002254
ORF1ab/nsp182G82SGgtAgt4748B.10.00043
ORF1ab/nsp182G82SGGtTCt148B.10.000009
ORF1ab/nsp182G82delGGT---4747AY.140.004137
ORF1ab/nsp182G82delGGT---4747AY.3.10.004007
ORF1ab/nsp182G82delGGT---4747AY.340.004557
ORF1ab/nsp182G82delGGT---4545B.1.1600.001403
ORF1ab/nsp182G82delGGT---4343AY.70.008428
ORF1ab/nsp182G82SGgtAgt4040B.1.2580.002662
ORF1ab/nsp182G82delGGT---3838AY.120.10.012199
ORF1ab/nsp182G82delGGT---3838AY.230.00265
ORF1ab/nsp182G82delGGT---3838AY.4.50.004085
ORF1ab/nsp182G82delGGT---3838AY.75.10.006852
ORF1ab/nsp182G82delGGT---3737AY.160.014047
ORF1ab/nsp182G82delGGT---3737AY.4.2.10.005513
ORF1ab/nsp182G82delGGT---3737B.1.258.170.003847
ORF1ab/nsp182G82delGGT---3636AY.130.005795
ORF1ab/nsp182G82delGGT---3434AY.110.045515
ORF1ab/nsp182G82delGGT---3434AY.120.010746
ORF1ab/nsp182G82delGGT---3434B.1.4270.001717
ORF1ab/nsp182G82delGGT---3333AY.530.009488
ORF1ab/nsp182G82GggTggC3232B.1.2580.00213
ORF1ab/nsp182G82delGGT---3131AY.46.20.019695
ORF1ab/nsp182G82delGGT---3131AY.980.002449
ORF1ab/nsp182G82delGGT---3030AY.1110.005495
ORF1ab/nsp182G82del2gGTg--2929B.1.1.70.000026
ORF1ab/nsp182G82delGGT---2828AY.360.00415
ORF1ab/nsp182G82DgGtgAt2727AY.1030.000168
ORF1ab/nsp182G82delGGT---2727AY.350.006292
ORF1ab/nsp182G82delGGT---2727AY.450.003285
ORF1ab/nsp182G82DgGtgAt2626B.1.617.20.000098
ORF1ab/nsp182G82delGGT---2525B.1.2340.003299
ORF1ab/nsp182G82del1GgT-gN1524AY.40.000023
ORF1ab/nsp182G82del1GGT-NN624AY.40.000009
ORF1ab/nsp182G82del1ggTgg-324AY.40.000005
ORF1ab/nsp182G82delGGT---2323B.1.1.3180.00694
ORF1ab/nsp182G82delGGT---2323B.1.2430.0016
ORF1ab/nsp182G82VgGtgTt2323B.1.36.260.065714
ORF1ab/nsp182G82delGGT---2222AY.1210.002977
ORF1ab/nsp182G82delGGT---2222AY.370.006953
ORF1ab/nsp182G82delGGT---2222B.1.6370.001608
ORF1ab/nsp182G82delGGT---2121AY.10.00831
ORF1ab/nsp182G82VgGtgTt2121AY.40.000033
ORF1ab/nsp182G82delGGT---2121AY.700.004379
ORF1ab/nsp182G82SGgtAgt2121B.1.617.20.000079
ORF1ab/nsp182G82delGGT---2020AY.930.005461
ORF1ab/nsp182G82delGGT---2020P.1.160.007482
ORF1ab/nsp182G82delGGT---1919AY.380.009486
ORF1ab/nsp182G82GggTggC1719AY.440.000103
ORF1ab/nsp182G82GggTggA219AY.440.000012
ORF1ab/nsp182G82delGGT---1919P.1.100.00512
ORF1ab/nsp182G82delGGT---1818AY.620.007843
ORF1ab/nsp182G82delGGT---1818B.1.438.10.001931
ORF1ab/nsp182G82AgGtgCt1517All0.000003
ORF1ab/nsp182G82AgGTgCA117All0
ORF1ab/nsp182G82AgGTgCG117All0
ORF1ab/nsp182G82delGGT---1717AY.1050.010932
ORF1ab/nsp182G82delGGT---1717AY.1130.002421
ORF1ab/nsp182G82delGGT---1717AY.920.004884
ORF1ab/nsp182G82delGGT---1717AY.940.007525
ORF1ab/nsp182G82EgGTgAG1516All0.000003
ORF1ab/nsp182G82EgGTgAA116All0
ORF1ab/nsp182G82delGGT---1616AU.10.020253
ORF1ab/nsp182G82delGGT---1616AY.1100.001803
ORF1ab/nsp182G82delGGT---1616AY.1160.004588
ORF1ab/nsp182G82SGgtAgt1616AY.470.000498
ORF1ab/nsp182G82delGGT---1616B.1.5170.006832
ORF1ab/nsp182G82GggTggC1216B.1.617.20.000045
ORF1ab/nsp182G82GggTggA316B.1.617.20.000011
ORF1ab/nsp182G82GggTggG116B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp182G82delGGT---1515AY.1060.005023
ORF1ab/nsp182G82SGgtAgt1515AY.250.00009
ORF1ab/nsp182G82delGGT---1515AY.46.30.014006
ORF1ab/nsp182G82delGGT---1515AY.5.30.005061
ORF1ab/nsp182G82del2gGTg--1515B.10.000137
ORF1ab/nsp182G82delGGT---1515B.400.005464
ORF1ab/nsp182G82delGGT---1515C.370.001741
ORF1ab/nsp182G82delGGT---1414AY.1140.003235
ORF1ab/nsp182G82delGGT---1414AY.4.40.005728
ORF1ab/nsp182G82delGGT---1414AY.5.40.003874
ORF1ab/nsp182G82delGGT---1414AY.640.008333
ORF1ab/nsp182G82delGGT---1414B.1.1.390.007136
ORF1ab/nsp182G82delGGT---1414B.1.2400.003018
ORF1ab/nsp182G82delGGT---1414B.1.5250.001584
ORF1ab/nsp182G82del1GgT-gN914B.1.617.20.000034
ORF1ab/nsp182G82del1ggTgg-514B.1.617.20.000019
ORF1ab/nsp182G82delGGT---1414D.20.001051
ORF1ab/nsp182G82delGGT---1414P.1.10.004447
ORF1ab/nsp182G82delGGT---1313AD.20.002847
ORF1ab/nsp182G82delGGT---1313AY.710.006176
ORF1ab/nsp182G82delGGT---1313B.1.1.500.008826
ORF1ab/nsp182G82delGGT---1313B.1.4000.005577
ORF1ab/nsp182G82delGGT---1313B.1.5960.001133
ORF1ab/nsp182G82delGGT---1212AY.120.2.10.005979
ORF1ab/nsp182G82delGGT---1212AY.16.10.005639
ORF1ab/nsp182G82VgGtgTt1212AY.250.000072
ORF1ab/nsp182G82GggTggC1212AY.290.000189
ORF1ab/nsp182G82SGgtAgt1212AY.4.20.00026
ORF1ab/nsp182G82del2gGTg--1112B.1.617.20.000041
ORF1ab/nsp182G82del2GGTA--112B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp182G82DgGtgAt1111AY.250.000066
ORF1ab/nsp182G82GggTggC1011AY.430.000044
ORF1ab/nsp182G82GggTggA111AY.430.000004
ORF1ab/nsp182G82delGGT---1111AY.800.012415
ORF1ab/nsp182G82delGGT---1111B.1.1.4340.003834
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ORF1ab/nsp182G82delGGT---1111B.1.360.001605
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