CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp1 : CodonNum = 48 & Codon = gGt

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp148D48GD48GnonsyngAtgGt159215921407-409

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp148D48GgAtgGt15921592All0.000304
ORF1ab/nsp148D48GgAtgGt12101210B.1.177.170.993432
ORF1ab/nsp148D48GgAtgGt106106B.1.1770.001396
ORF1ab/nsp148D48GgAtgGt6161B.1.3510.001813
ORF1ab/nsp148D48GgAtgGt5858B.1.1.70.000052
ORF1ab/nsp148D48GgAtgGt2222AY.440.000134
ORF1ab/nsp148D48GgAtgGt1717AY.40.000026
ORF1ab/nsp148D48GgAtgGt1515AY.1020.000398
ORF1ab/nsp148D48GgAtgGt1313B.1.617.20.000049
ORF1ab/nsp148D48GgAtgGt1111AY.1030.000068
ORF1ab/nsp148D48GgAtgGt1111B.1.258.140.010784
ORF1ab/nsp148D48GgAtgGt77B.1.36.290.003621
ORF1ab/nsp148D48GgAtgGt66B.10.000055
ORF1ab/nsp148D48GgAtgGt44AY.1130.00057
ORF1ab/nsp148D48GgAtgGt44AY.250.000024
ORF1ab/nsp148D48GgAtgGt44B.1.10.000073
ORF1ab/nsp148D48GgAtgGt33AY.420.000121
ORF1ab/nsp148D48GgAtgGt33AY.430.000013
ORF1ab/nsp148D48GgAtgGt33B.1.2580.0002
ORF1ab/nsp148D48GgAtgGt33C.370.000348
ORF1ab/nsp148D48GgAtgGt22AY.1000.000092
ORF1ab/nsp148D48GgAtgGt22AY.200.000078
ORF1ab/nsp148D48GgAtgGt22AY.260.000057
ORF1ab/nsp148D48GgAtgGt22AY.30.00002
ORF1ab/nsp148D48GgAtgGt22AY.330.000134
ORF1ab/nsp148D48GgAtgGt22AY.4.10.001475
ORF1ab/nsp148D48GgAtgGt22AY.750.000112
ORF1ab/nsp148D48GgAtgGt22C.10.004785
ORF1ab/nsp148D48GgAtgGt11AY.1100.000113
ORF1ab/nsp148D48GgAtgGt11AY.300.000396
ORF1ab/nsp148D48GgAtgGt11AY.390.000025
ORF1ab/nsp148D48GgAtgGt11AY.500.000799
ORF1ab/nsp148D48GgAtgGt11AY.540.000095
ORF1ab/nsp148D48GgAtgGt11AY.600.000938
ORF1ab/nsp148D48GgAtgGt11AY.690.000187
ORF1ab/nsp148D48GgAtgGt11B.1.1.10.000327
ORF1ab/nsp148D48GgAtgGt11B.1.1.280.000311
ORF1ab/nsp148D48GgAtgGt11B.1.1600.000031
ORF1ab/nsp148D48GgAtgGt11B.1.160.330.004425
ORF1ab/nsp148D48GgAtgGt11B.1.177.690.001484
ORF1ab/nsp148D48GgAtgGt11B.1.2290.009709
ORF1ab/nsp148D48GgAtgGt11B.1.5260.000024
ORF1ab/nsp148D48GgAtgGt11P.10.000016