CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp1 : CodonNum = 147 & Codon = gGc

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp1147D147GD147GnonsyngAcgGc165714700.887145704-706

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc14701657All0.000281
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc684686B.1.3610.881443
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc231297B.10.002116
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc102155B.1.1.70.000091
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc6465B.1.20.000564
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc3445B.1.1770.000448
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc3441B.1.10.000617
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc3030AY.1020.000795
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc1422B.1.2580.000932
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc1920B.1.5260.000447
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc1919B.1.617.20.000072
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc1317B.1.1600.000405
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc1616AY.40.000025
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc1416B.1.177.440.007265
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc1013B.1.2210.00071
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc712B.1.1.3850.03125
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc1012B.1.1.390.005097
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc810B.1.1.700.002729
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc99AY.99.20.000829
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc77AY.390.000173
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc77AY.440.000043
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc66AY.430.000027
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc66B.1.9.40.03681
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc35B.1.6090.001438
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc35B.1.780.025641
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc55C.350.00387
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc45P.10.000063
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc34AY.250.000018
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc44AY.260.000113
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc44AY.9.10.000335
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc44B.1.177.770.002905
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc44B.1.5800.01626
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc13B.1.1.10.000327
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc23B.1.1.1700.002494
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc33B.1.1.2770.002276
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc33B.1.177.810.000568
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc23B.1.177.860.000367
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc13B.1.2220.001692
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc33B.1.258.110.001189
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc13B.1.4370.020833
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc23B.1.5760.001813
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc33B.1.5950.000783
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc33P.1.70.000958
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc22B.1.1.1890.003026
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc22B.1.1.2220.000408
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc12B.1.1.3170.000412
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc22B.1.1.3720.001377
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc22B.1.1460.008475
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc12B.1.177.750.001041
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc22B.1.2320.001075
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc22B.1.3250.013793
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc22B.1.36.170.000988
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc22B.1.5960.000174
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc12B.1.90.006173
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc12C.300.001727
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc22K.10.047619
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc11A.210.00277
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc11AY.1170.000085
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc11AY.23.10.000417
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc11AY.350.000233
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc11AY.450.000122
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc11AY.460.000104
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc11AY.46.40.000165
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc11AY.790.001211
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc11AY.980.000079
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc11B.1.1.1290.009174
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc11B.1.1.1490.016393
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc11B.1.1.1530.001095
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc11B.1.1.1930.111111
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc11B.1.1.2200.001859
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc11B.1.1.3010.001179
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc11B.1.1.3480.000796
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc11B.1.1.3890.006061
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc11B.1.1.4870.005587
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc11B.1.1.5150.02
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc11B.1.1.5190.00004
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc11B.1.1.5210.005348
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc11B.1.1.5280.004808
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc11B.1.1700.00431
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc11B.1.177.330.001645
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc11B.1.177.350.000691
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc11B.1.177.730.000566
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc11B.1.177.830.001481
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc11B.1.1790.003759
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc11B.1.2840.013158
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc11B.1.2930.0125
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc11B.1.3290.000608
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc11B.1.3300.028571
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc11B.1.3370.005587
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc11B.1.360.000146
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc11B.1.36.100.004785
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc11B.1.36.240.006173
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc11B.1.3690.000285
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc11B.1.3960.000706
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc11B.1.5650.00081
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc11B.1.5820.000491
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc11B.1.6210.000089
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc11B.1.6270.00202
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc11B.1.88.10.004808
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc11B.1.9.50.005682
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc11P.1.150.000232
ORF1ab/nsp1147D147GgAcgGc11R.10.00009