CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF10 : Mut = T12M

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1012T12MnonsynaCgaTg16151615129591-29593

Details of the mutation T12M within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1012T12MaCgaTg16151615All0.000309
ORF1012T12MaCgaTg874874AY.40.00136
ORF1012T12MaCgaTg224224B.1.1.70.000201
ORF1012T12MaCgaTg169169B.1.177.810.031995
ORF1012T12MaCgaTg4444B.1.1.3430.916667
ORF1012T12MaCgaTg3030AY.30.000298
ORF1012T12MaCgaTg2929B.1.617.20.000109
ORF1012T12MaCgaTg2020B.1.10.000363
ORF1012T12MaCgaTg1111AY.430.000049
ORF1012T12MaCgaTg1111AY.9.20.000404
ORF1012T12MaCgaTg1111B.1.1.2790.012332
ORF1012T12MaCgaTg99B.10.000082
ORF1012T12MaCgaTg88AY.390.000198
ORF1012T12MaCgaTg88AY.4.20.000174
ORF1012T12MaCgaTg88AY.50.000165
ORF1012T12MaCgaTg77AY.200.000272
ORF1012T12MaCgaTg77AY.440.000043
ORF1012T12MaCgaTg77B.1.5960.00061
ORF1012T12MaCgaTg66AY.3.10.000512
ORF1012T12MaCgaTg66B.1.20.000053
ORF1012T12MaCgaTg55AY.290.000079
ORF1012T12MaCgaTg55B.1.4290.000118
ORF1012T12MaCgaTg44AY.250.000024
ORF1012T12MaCgaTg44AY.270.000259
ORF1012T12MaCgaTg44AY.710.0019
ORF1012T12MaCgaTg44B.1.1.3720.002755
ORF1012T12MaCgaTg44B.1.1.700.001364
ORF1012T12MaCgaTg44B.1.617.10.000516
ORF1012T12MaCgaTg44P.10.000063
ORF1012T12MaCgaTg44P.1.150.000929
ORF1012T12MaCgaTg33AY.420.000121
ORF1012T12MaCgaTg33AY.450.000365
ORF1012T12MaCgaTg33AY.99.20.000276
ORF1012T12MaCgaTg33B0.000383
ORF1012T12MaCgaTg33B.1.1.2860.008696
ORF1012T12MaCgaTg33B.1.1600.000094
ORF1012T12MaCgaTg33B.1.1770.00004
ORF1012T12MaCgaTg33B.1.2340.000396
ORF1012T12MaCgaTg22AY.230.000139
ORF1012T12MaCgaTg22AY.260.000057
ORF1012T12MaCgaTg22AY.330.000134
ORF1012T12MaCgaTg22AY.360.000296
ORF1012T12MaCgaTg22AY.60.000082
ORF1012T12MaCgaTg22AY.7.20.001119
ORF1012T12MaCgaTg22AY.75.10.000361
ORF1012T12MaCgaTg22B.1.1.250.001137
ORF1012T12MaCgaTg22B.1.1.5190.000079
ORF1012T12MaCgaTg22B.1.4970.00063
ORF1012T12MaCgaTg22B.1.5170.000854
ORF1012T12MaCgaTg22B.1.6210.000177
ORF1012T12MaCgaTg22R.10.00018
ORF1012T12MaCgaTg110.055556
ORF1012T12MaCgaTg11AE.80.000489
ORF1012T12MaCgaTg11AY.1000.000046
ORF1012T12MaCgaTg11AY.1020.000027
ORF1012T12MaCgaTg11AY.1030.000006
ORF1012T12MaCgaTg11AY.1190.000035
ORF1012T12MaCgaTg11AY.220.002092
ORF1012T12MaCgaTg11AY.240.000431
ORF1012T12MaCgaTg11AY.4.50.000107
ORF1012T12MaCgaTg11AY.46.60.000072
ORF1012T12MaCgaTg11AY.470.000031
ORF1012T12MaCgaTg11AY.590.00053
ORF1012T12MaCgaTg11AY.610.000105
ORF1012T12MaCgaTg11AY.740.000116
ORF1012T12MaCgaTg11B.1.1.2970.002237
ORF1012T12MaCgaTg11B.1.1.3180.000302
ORF1012T12MaCgaTg11B.1.1.330.000421
ORF1012T12MaCgaTg11B.1.1.3980.003226
ORF1012T12MaCgaTg11B.1.1.630.000386
ORF1012T12MaCgaTg11B.1.177.430.001477
ORF1012T12MaCgaTg11B.1.177.460.000918
ORF1012T12MaCgaTg11B.1.177.70.000165
ORF1012T12MaCgaTg11B.1.177.860.000183
ORF1012T12MaCgaTg11B.1.3510.00003
ORF1012T12MaCgaTg11B.1.36.10.00114
ORF1012T12MaCgaTg11B.1.36.120.009615
ORF1012T12MaCgaTg11B.1.3690.000285
ORF1012T12MaCgaTg11B.1.6090.000479
ORF1012T12MaCgaTg11B.1.6370.000073
ORF1012T12MaCgaTg11B.3.10.001658
ORF1012T12MaCgaTg11C.20.016129
ORF1012T12MaCgaTg11D.20.000075
ORF1012T12MaCgaTg11P.20.000187
ORF1012T12MaCgaTg11Q.80.000165