CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF10 : Mut = C19C

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1019C19CsyntgCtgT2771027710129612-29614

Details of the mutation C19C within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1019C19CtgCtgT2771027710All0.0053
ORF1019C19CtgCtgT86278627B.1.1.70.007723
ORF1019C19CtgCtgT16771677AY.40.00261
ORF1019C19CtgCtgT14121412AY.30.014044
ORF1019C19CtgCtgT13561356B.1.1.2140.0752
ORF1019C19CtgCtgT11431143B.1.617.20.004304
ORF1019C19CtgCtgT977977B.1.20.008603
ORF1019C19CtgCtgT922922AY.440.005612
ORF1019C19CtgCtgT720720AY.1030.004471
ORF1019C19CtgCtgT564564AY.250.003392
ORF1019C19CtgCtgT564564AY.430.002499
ORF1019C19CtgCtgT440440B.10.00403
ORF1019C19CtgCtgT428428B.1.3510.012723
ORF1019C19CtgCtgT414414AY.390.010231
ORF1019C19CtgCtgT404404B.1.575.10.985366
ORF1019C19CtgCtgT294294B.1.4270.014846
ORF1019C19CtgCtgT268268AY.740.030993
ORF1019C19CtgCtgT266266B.1.4290.006259
ORF1019C19CtgCtgT248248P.10.003907
ORF1019C19CtgCtgT240240B.1.10.004354
ORF1019C19CtgCtgT239239AY.3.10.020377
ORF1019C19CtgCtgT228228AY.50.004708
ORF1019C19CtgCtgT225225B.1.1.3180.067894
ORF1019C19CtgCtgT186186AY.1200.006915
ORF1019C19CtgCtgT172172B.1.3060.982857
ORF1019C19CtgCtgT171171AY.1020.004534
ORF1019C19CtgCtgT148148AY.1140.034204
ORF1019C19CtgCtgT139139B.1.177.650.092482
ORF1019C19CtgCtgT138138B.1.1600.004304
ORF1019C19CtgCtgT130130AY.260.00368
ORF1019C19CtgCtgT125125AY.4.20.002711
ORF1019C19CtgCtgT124124AY.470.003857
ORF1019C19CtgCtgT123123AY.9.10.010298
ORF1019C19CtgCtgT118118B.1.1110.13866
ORF1019C19CtgCtgT107107B.1.438.10.011477
ORF1019C19CtgCtgT101101B.1.36.190.935185
ORF1019C19CtgCtgT9696B.1.2580.006389
ORF1019C19CtgCtgT9494B.1.5911
ORF1019C19CtgCtgT9292B.1.4990.096639
ORF1019C19CtgCtgT7979AY.360.011709
ORF1019C19CtgCtgT7777B.1.2210.00547
ORF1019C19CtgCtgT7373AY.1190.002578
ORF1019C19CtgCtgT7272B.1.5260.001692
ORF1019C19CtgCtgT7171AY.140.006249
ORF1019C19CtgCtgT7171B.1.6370.005188
ORF1019C19CtgCtgT6969AY.1000.003174
ORF1019C19CtgCtgT6868AY.200.002643
ORF1019C19CtgCtgT6666AY.420.002655
ORF1019C19CtgCtgT6565B.1.1.5190.002581
ORF1019C19CtgCtgT6262B.1.1.370.011958
ORF1019C19CtgCtgT6060B.1.1.2660.731707
ORF1019C19CtgCtgT6060B.1.1881
ORF1019C19CtgCtgT5858B.1.1770.000764
ORF1019C19CtgCtgT5757B.280.186885
ORF1019C19CtgCtgT5555AY.46.40.009048
ORF1019C19CtgCtgT5454B.1.5770.037113
ORF1019C19CtgCtgT5353B.1.5960.004618
ORF1019C19CtgCtgT5050B.1.2430.003479
ORF1019C19CtgCtgT4949AY.290.000773
ORF1019C19CtgCtgT4848P.20.008959
ORF1019C19CtgCtgT4646AY.90.003109
ORF1019C19CtgCtgT4545AY.330.003005
ORF1019C19CtgCtgT4545B.1.6280.015856
ORF1019C19CtgCtgT4545P.1.140.002151
ORF1019C19CtgCtgT4444AY.46.60.003177
ORF1019C19CtgCtgT4343B.1.1.2220.008772
ORF1019C19CtgCtgT4141B.1.6210.003629
ORF1019C19CtgCtgT4040AY.980.00316
ORF1019C19CtgCtgT4040B.1.5750.012136
ORF1019C19CtgCtgT3838AY.1170.003212
ORF1019C19CtgCtgT3838AY.710.018052
ORF1019C19CtgCtgT3838B.1.1.1570.034703
ORF1019C19CtgCtgT3737AY.1180.002318
ORF1019C19CtgCtgT3737B.1.2060.030179
ORF1019C19CtgCtgT3636AY.46.30.033613
ORF1019C19CtgCtgT3636B.1.6190.031359
ORF1019C19CtgCtgT3535AY.750.001961
ORF1019C19CtgCtgT3535B.1.360.005107
ORF1019C19CtgCtgT3434AY.460.003539
ORF1019C19CtgCtgT3030AY.230.002092
ORF1019C19CtgCtgT3030AY.320.015974
ORF1019C19CtgCtgT3030D.20.002251
ORF1019C19CtgCtgT2929P.1.70.009259
ORF1019C19CtgCtgT2828A.210.077562
ORF1019C19CtgCtgT2828AY.5.30.009447
ORF1019C19CtgCtgT2828B.1.220.036891
ORF1019C19CtgCtgT2727AY.98.10.001308
ORF1019C19CtgCtgT2727B.1.258.170.002807
ORF1019C19CtgCtgT2727B.1.5850.75
ORF1019C19CtgCtgT2626B.1.36.360.015653
ORF1019C19CtgCtgT2525AY.46.20.015883
ORF1019C19CtgCtgT2424AY.610.002515
ORF1019C19CtgCtgT2424C.370.002786
ORF1019C19CtgCtgT2222AY.29.10.004851
ORF1019C19CtgCtgT2222AY.99.20.002027
ORF1019C19CtgCtgT2222P.1.150.005112
ORF1019C19CtgCtgT2121AY.60.000864
ORF1019C19CtgCtgT2121B.1.177.210.001606
ORF1019C19CtgCtgT2020AY.10.007915
ORF1019C19CtgCtgT2020AY.4.50.00215
ORF1019C19CtgCtgT2020B.1.1.280.006225
ORF1019C19CtgCtgT1919AY.450.002312
ORF1019C19CtgCtgT1818A0.006966
ORF1019C19CtgCtgT1818B.1.1.3370.064748
ORF1019C19CtgCtgT1818B.1.2340.002375
ORF1019C19CtgCtgT1818B.1.6360.120805
ORF1019C19CtgCtgT1717AY.9.20.000624
ORF1019C19CtgCtgT1717B.1.177.770.012346
ORF1019C19CtgCtgT1616Q.80.002639
ORF1019C19CtgCtgT1515AY.1210.00203
ORF1019C19CtgCtgT1515AY.340.001454
ORF1019C19CtgCtgT1515B.1.1.630.005787
ORF1019C19CtgCtgT1515B.1.5510.019355
ORF1019C19CtgCtgT1515B.1.617.10.001934
ORF1019C19CtgCtgT1414AY.100.007419
ORF1019C19CtgCtgT1414AY.16.10.006579
ORF1019C19CtgCtgT1414B.1.5990.051095
ORF1019C19CtgCtgT1313AY.920.003735
ORF1019C19CtgCtgT1313B.1.1.2670.131313
ORF1019C19CtgCtgT1313B.1.36.200.220339
ORF1019C19CtgCtgT1212A.2.50.005988
ORF1019C19CtgCtgT1212B0.001534
ORF1019C19CtgCtgT1212B.1.36.340.255319
ORF1019C19CtgCtgT1212B.1.5950.003132
ORF1019C19CtgCtgT1212Q.10.001516
ORF1019C19CtgCtgT1111AY.1130.001566
ORF1019C19CtgCtgT1111AY.5.40.003044
ORF1019C19CtgCtgT1111B.1.1.10.003594
ORF1019C19CtgCtgT1111B.1.1.2160.009795
ORF1019C19CtgCtgT1111B.1.3990.021277
ORF1019C19CtgCtgT1111B.1.4090.008594
ORF1019C19CtgCtgT1111B.1.4130.046809
ORF1019C19CtgCtgT1111B.1.4150.157143
ORF1019C19CtgCtgT1111B.1.6090.005273
ORF1019C19CtgCtgT1010AY.4.30.008418
ORF1019C19CtgCtgT1010AY.75.10.001803
ORF1019C19CtgCtgT1010AY.880.008842
ORF1019C19CtgCtgT1010B.1.1.3620.05618
ORF1019C19CtgCtgT1010B.1.1.700.003411
ORF1019C19CtgCtgT1010B.1.466.20.003912
ORF1019C19CtgCtgT1010R.10.0009
ORF1019C19CtgCtgT99AY.130.001449
ORF1019C19CtgCtgT99B.1.3690.002567
ORF1019C19CtgCtgT88AY.1090.005917
ORF1019C19CtgCtgT88AY.39.10.000317
ORF1019C19CtgCtgT88AY.670.003714
ORF1019C19CtgCtgT88B.1.1.3740.019002
ORF1019C19CtgCtgT88B.1.3110.002197
ORF1019C19CtgCtgT88B.1.5610.003176
ORF1019C19CtgCtgT88B.1.6270.016162
ORF1019C19CtgCtgT88P.1.10.10.065041
ORF1019C19CtgCtgT77AY.1080.007718
ORF1019C19CtgCtgT77AY.116.10.00218
ORF1019C19CtgCtgT77AY.270.000453
ORF1019C19CtgCtgT77AY.34.10.00357
ORF1019C19CtgCtgT77AY.350.001631
ORF1019C19CtgCtgT77AY.540.000667
ORF1019C19CtgCtgT77AY.690.001307
ORF1019C19CtgCtgT77B.1.1.2310.021672
ORF1019C19CtgCtgT77B.1.1.3060.003069
ORF1019C19CtgCtgT77B.1.1.3970.015766
ORF1019C19CtgCtgT77B.1.3240.011236
ORF1019C19CtgCtgT77B.1.429.10.084337
ORF1019C19CtgCtgT77C.36.30.003971
ORF1019C19CtgCtgT66A.2.5.20.009434
ORF1019C19CtgCtgT66AY.550.005505
ORF1019C19CtgCtgT66AY.940.002656
ORF1019C19CtgCtgT66B.1.1.2910.004454
ORF1019C19CtgCtgT66B.1.1.3070.01519
ORF1019C19CtgCtgT66B.1.1.330.002525
ORF1019C19CtgCtgT66B.1.177.360.096774
ORF1019C19CtgCtgT66B.1.4250.017964
ORF1019C19CtgCtgT66B.1.4970.001889
ORF1019C19CtgCtgT66B.1.6230.003219
ORF1019C19CtgCtgT66P.1.170.000971
ORF1019C19CtgCtgT55AY.1060.001674
ORF1019C19CtgCtgT55AY.1100.000563
ORF1019C19CtgCtgT55AY.1110.000916
ORF1019C19CtgCtgT55AY.120.20.006427
ORF1019C19CtgCtgT55AY.640.002976
ORF1019C19CtgCtgT55B.1.1.3170.002058
ORF1019C19CtgCtgT55B.1.1.3720.003444
ORF1019C19CtgCtgT55B.1.177.570.001405
ORF1019C19CtgCtgT55B.1.177.730.002831
ORF1019C19CtgCtgT55B.1.2320.002687
ORF1019C19CtgCtgT55B.1.2400.001078
ORF1019C19CtgCtgT55B.1.3010.029586
ORF1019C19CtgCtgT55B.1.3490.003574
ORF1019C19CtgCtgT55B.1.36.180.002101
ORF1019C19CtgCtgT55B.1.36.290.002587
ORF1019C19CtgCtgT55B.1.5820.002453
ORF1019C19CtgCtgT55B.1.5880.00455
ORF1019C19CtgCtgT55B.1.5970.023148
ORF1019C19CtgCtgT55B.1.621.10.002529
ORF1019C19CtgCtgT55B.60.00455
ORF1019C19CtgCtgT55Q.30.000725
ORF1019C19CtgCtgT44AY.1010.001962
ORF1019C19CtgCtgT44AY.1070.001864
ORF1019C19CtgCtgT44AY.1160.001147
ORF1019C19CtgCtgT44AY.160.001519
ORF1019C19CtgCtgT44AY.300.001583
ORF1019C19CtgCtgT44AY.4.2.10.000596
ORF1019C19CtgCtgT44AY.410.001176
ORF1019C19CtgCtgT44AY.70.000784
ORF1019C19CtgCtgT44AY.770.00451
ORF1019C19CtgCtgT44AY.850.001709
ORF1019C19CtgCtgT44AY.890.019608
ORF1019C19CtgCtgT44AY.9.2.10.007905
ORF1019C19CtgCtgT44AY.910.002922
ORF1019C19CtgCtgT44AZ.20.003284
ORF1019C19CtgCtgT44B.1.1.250.002274
ORF1019C19CtgCtgT44B.1.1.3490.041237
ORF1019C19CtgCtgT44B.1.1.390.002039
ORF1019C19CtgCtgT44B.1.1.4480.00813
ORF1019C19CtgCtgT44B.1.1.5160.266667
ORF1019C19CtgCtgT44B.1.1620.020101
ORF1019C19CtgCtgT44B.1.1820.028986
ORF1019C19CtgCtgT44B.1.2790.002054
ORF1019C19CtgCtgT44B.1.351.20.00121
ORF1019C19CtgCtgT44B.1.3960.002823
ORF1019C19CtgCtgT44B.1.4160.005076
ORF1019C19CtgCtgT44B.1.466.10.028777
ORF1019C19CtgCtgT44B.1.4690.01444
ORF1019C19CtgCtgT44B.30.003322
ORF1019C19CtgCtgT44C.160.004242
ORF1019C19CtgCtgT33AD.20.000657
ORF1019C19CtgCtgT33AE.80.001467
ORF1019C19CtgCtgT33AY.1050.001929
ORF1019C19CtgCtgT33AY.23.10.001252
ORF1019C19CtgCtgT33AY.280.005671
ORF1019C19CtgCtgT33AY.39.20.004622
ORF1019C19CtgCtgT33AY.500.002398
ORF1019C19CtgCtgT33AY.590.001589
ORF1019C19CtgCtgT33AY.7.10.000338
ORF1019C19CtgCtgT33AY.990.003148
ORF1019C19CtgCtgT33B.1.1.1330.025424
ORF1019C19CtgCtgT33B.1.1.1340.034091
ORF1019C19CtgCtgT33B.1.1.1890.004539
ORF1019C19CtgCtgT33B.1.1.2200.005576
ORF1019C19CtgCtgT33B.1.1.2410.006211
ORF1019C19CtgCtgT33B.1.1.2690.00406
ORF1019C19CtgCtgT33B.1.1.2770.002276
ORF1019C19CtgCtgT33B.1.1.2790.003363
ORF1019C19CtgCtgT33B.1.1.30.026087
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