CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF10 : CodonNum = 30

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1030V30LnonsynGtaTta1774831771330.99802829645-29647
ORF1030V30LnonsynGtaCta1774833490.0019663929645-29647
ORF1030V30LnonsynGtACtT17748310.0000056343429645-29647
ORF1030V30VsyngtAgtG4803550.73958329645-29647
ORF1030V30VsyngtAgtT4801180.24583329645-29647
ORF1030V30VsyngtAgtC48070.014583329645-29647
ORF1030V30InonsynGtaAta261261129645-29647
ORF1030V30AnonsyngTagCa6868129645-29647
ORF1030V30deldelGTA---4141129645-29647
ORF1030V30GnonsyngTagGa1060.629645-29647
ORF1030V30GnonsyngTAgGC1030.329645-29647
ORF1030V30GnonsyngTAgGG1010.129645-29647
ORF1030V30SnonsynGTaTCa55129645-29647
ORF1030V30CnonsynGTATGC44129645-29647
ORF1030V30FnonsynGtATtC430.7529645-29647
ORF1030V30FnonsynGtATtT410.2529645-29647
ORF1030V30EnonsyngTagAa33129645-29647
ORF1030V30XnonsynGTaTGa33129645-29647
ORF1030V30RnonsynGTaAGa210.529645-29647
ORF1030V30TnonsynGTAACG210.529645-29647
ORF1030V30RnonsynGTAAGG210.529645-29647
ORF1030V30PnonsynGTaCCa210.529645-29647
ORF1030V30PnonsynGTACCT210.529645-29647
ORF1030V30TnonsynGTaACa210.529645-29647
ORF1030V30del2delgTAg--11129645-29647
ORF1030V30QnonsynGTaCAa11129645-29647
ORF1030V30del1delgtAgt-11129645-29647

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1030V30LGtaTta177133177483All0.033879
ORF1030V30LGtaCta349177483All0.000067
ORF1030V30LGtACtT1177483All0
ORF1030V30LGtaTta7380473807B.1.1770.971821
ORF1030V30LGtaCta373807B.1.1770.00004
ORF1030V30LGtaTta1279712797B.1.177.210.978588
ORF1030V30LGtaTta65346534B.1.177.120.991201
ORF1030V30LGtaTta59595959B.1.177.70.982361
ORF1030V30LGtaTta51955195B.1.177.810.983529
ORF1030V30LGtaTta50585058B.1.177.860.927903
ORF1030V30LGtaTta47064706B.1.177.40.993246
ORF1030V30LGtaTta42874287B.1.177.600.936435
ORF1030V30LGtaTta35423542B.1.177.570.995223
ORF1030V30LGtaTta26112611B.1.177.450.995425
ORF1030V30LGtaTta18722070AY.40.002914
ORF1030V30LGtaCta1982070AY.40.000308
ORF1030V30LGtaTta19431943B.1.177.820.927446
ORF1030V30LGtaTta18181818B.1.177.440.943435
ORF1030V30LGtaTta16361636B.1.177.540.992116
ORF1030V30LGtaTta15771577B.1.177.150.994953
ORF1030V30LGtaTta15031503B.1.177.651
ORF1030V30LGtaTta14941494B.1.177.160.992691
ORF1030V30LGtaTta14861486B.1.177.560.991989
ORF1030V30LGtaTta14461446B.1.177.350.999309
ORF1030V30LGtaTta13591359B.1.177.870.989083
ORF1030V30LGtaTta13271327B.1.177.770.963689
ORF1030V30LGtaTta13231323B.1.177.80.995485
ORF1030V30LGtaTta12781283B.10.011706
ORF1030V30LGtaCta41283B.10.000037
ORF1030V30LGtACtT11283B.10.000009
ORF1030V30LGtaTta12691269B.1.177.730.718573
ORF1030V30LGtaTta12071207B.1.177.170.990969
ORF1030V30LGtaTta11211121B.1.177.100.984197
ORF1030V30LGtaTta10091009B.1.177.60.985352
ORF1030V30LGtaTta979979B.1.177.460.89899
ORF1030V30LGtaTta945945B.1.177.750.983351
ORF1030V30LGtaTta912912B.1.177.420.815742
ORF1030V30LGtaTta852852B.1.177.180.988399
ORF1030V30LGtaTta826826B.1.177.620.984505
ORF1030V30LGtaTta799799B.1.177.50.992547
ORF1030V30LGtaTta760760B.1.177.240.984456
ORF1030V30LGtaTta746746B.1.177.90.993342
ORF1030V30LGtaTta743743B.1.177.580.989348
ORF1030V30LGtaTta735735W.40.993243
ORF1030V30LGtaTta734734B.1.177.320.990553
ORF1030V30LGtaTta697697B.1.177.190.997139
ORF1030V30LGtaTta673673B.1.177.690.998516
ORF1030V30LGtaTta651651B.1.177.200.98786
ORF1030V30LGtaTta642642B.1.177.430.948301
ORF1030V30LGtaTta635635B.1.177.830.940741
ORF1030V30LGtaTta606606B.1.177.330.996711
ORF1030V30LGtaTta573595B.1.1.70.000513
ORF1030V30LGtaCta22595B.1.1.70.00002
ORF1030V30LGtaTta588588B.1.177.110.998302
ORF1030V30LGtaTta549549B.1.177.520.964851
ORF1030V30LGtaTta508522AY.1030.003154
ORF1030V30LGtaCta14522AY.1030.000087
ORF1030V30LGtaTta483483B.1.177.800.923518
ORF1030V30VgtAgtG355480All0.000068
ORF1030V30VgtAgtT118480All0.000023
ORF1030V30VgtAgtC7480All0.000001
ORF1030V30LGtaTta427427B.1.177.550.995338
ORF1030V30LGtaTta413413B.1.177.530.988038
ORF1030V30LGtaTta398398B.1.177.301
ORF1030V30LGtaTta397397B.1.177.790.929742
ORF1030V30LGtaTta390390B.1.177.760.972569
ORF1030V30LGtaTta376376B.1.177.410.94
ORF1030V30LGtaTta367367B.1.177.630.991892
ORF1030V30LGtaTta343343Z.10.991329
ORF1030V30LGtaTta318318B.1.177.480.99375
ORF1030V30LGtaTta303303B.1.177.230.980583
ORF1030V30LGtaTta297298AY.1130.04229
ORF1030V30LGtaCta1298AY.1130.000142
ORF1030V30LGtaTta292292B.1.177.720.989831
ORF1030V30IGtaAta261261All0.00005
ORF1030V30LGtaTta253253U.30.976834
ORF1030V30LGtaTta234248B.1.617.20.000881
ORF1030V30LGtaCta14248B.1.617.20.000053
ORF1030V30LGtaTta220220B.1.177.21
ORF1030V30LGtaTta219219B.1.177.511
ORF1030V30LGtaTta213213B.1.1.2401
ORF1030V30LGtaTta208208B.1.177.500.976526
ORF1030V30LGtaTta202202W.20.975845
ORF1030V30LGtaTta190190W.31
ORF1030V30LGtaTta188188B.1.177.400.969072
ORF1030V30LGtaTta179184B.1.10.003247
ORF1030V30LGtaCta5184B.1.10.000091
ORF1030V30LGtaTta181181B.1.177.850.983696
ORF1030V30LGtaTta165165B.1.177.700.976331
ORF1030V30LGtaTta164164B.1.177.141
ORF1030V30IGtaAta156156AY.30.001552
ORF1030V30LGtaTta150150B.1.177.841
ORF1030V30LGtaTta143143B.1.177.261
ORF1030V30LGtaTta137137AA.10.992754
ORF1030V30LGtaTta133133B.1.177.280.985185
ORF1030V30LGtaTta131131B.1.177.31
ORF1030V30LGtaTta130130AA.21
ORF1030V30LGtaTta122126AY.430.000541
ORF1030V30LGtaCta4126AY.430.000018
ORF1030V30VgtAgtG119121B.10.00109
ORF1030V30VgtAgtC1121B.10.000009
ORF1030V30VgtAgtT1121B.10.000009
ORF1030V30LGtaTta119119B.1.1600.003711
ORF1030V30LGtaTta111113B.1.2210.007885
ORF1030V30LGtaCta2113B.1.2210.000142
ORF1030V30LGtaTta113113W.10.982609
ORF1030V30LGtaTta112112B.1.177.670.854962
ORF1030V30VgtAgtT110111AY.290.001735
ORF1030V30VgtAgtG1111AY.290.000016
ORF1030V30LGtaTta110110AA.41
ORF1030V30LGtaTta109109AA.71
ORF1030V30LGtaTta109109U.20.95614
ORF1030V30LGtaTta106106AY.1210.014344
ORF1030V30LGtaTta105105B.1.177.270.990566
ORF1030V30LGtaTta104104B.1.160.300.309524
ORF1030V30LGtaTta102102B.1.177.780.990291
ORF1030V30LGtaTta9999B.1.177.711
ORF1030V30LGtaTta9595B.1.177.380.989583
ORF1030V30LGtaTta9292B.1.6190.080139
ORF1030V30LGtaTta7482B.1.20.000652
ORF1030V30LGtaCta882B.1.20.00007
ORF1030V30LGtaTta8181B.1.177.881
ORF1030V30LGtaTta7878U.11
ORF1030V30LGtaTta7777B.1.177.471
ORF1030V30LGtaTta7777Y.10.987179
ORF1030V30LGtaTta7476AY.250.000445
ORF1030V30LGtaCta276AY.250.000012
ORF1030V30IGtaAta7272B.1.1.70.000064
ORF1030V30LGtaTta7070B.1.1.5190.00278
ORF1030V30AgTagCa6868All0.000013
ORF1030V30LGtaTta6767B.1.177.251
ORF1030V30LGtaTta6565AY.440.000396
ORF1030V30LGtaTta6565B.1.177.740.984848
ORF1030V30LGtaTta6464B.1.177.390.984615
ORF1030V30LGtaTta6464P.10.001008
ORF1030V30LGtaTta6262AA.51
ORF1030V30LGtaTta6262AA.61
ORF1030V30LGtaTta6262B.1.177.361
ORF1030V30LGtaTta5959AY.46.60.00426
ORF1030V30LGtaTta5959B.1.177.590.951613
ORF1030V30LGtaTta5454AY.140.004753
ORF1030V30LGtaTta5454B.1.2580.003594
ORF1030V30LGtaTta5151B.1.177.680.772727
ORF1030V30LGtaTta4545AA.81
ORF1030V30LGtaTta4444V.11
ORF1030V30LGtaTta4243AY.390.001038
ORF1030V30LGtaCta143AY.390.000025
ORF1030V30delGTA---4141All0.000008
ORF1030V30LGtaTta4141B.1.177.891
ORF1030V30LGtaTta3737AA.31
ORF1030V30LGtaTta3637AY.50.000743
ORF1030V30LGtaCta137AY.50.000021
ORF1030V30LGtaTta3737B.1.177.371
ORF1030V30LGtaTta3436B.1.5260.000799
ORF1030V30LGtaCta236B.1.5260.000047
ORF1030V30LGtaTta3434B.1.2430.002366
ORF1030V30VgtAgtG3333B.1.1.70.00003
ORF1030V30LGtaTta2532AY.30.000249
ORF1030V30LGtaCta732AY.30.00007
ORF1030V30LGtaTta3131B0.003962
ORF1030V30LGtaTta3131B.1.177.310.356322
ORF1030V30LGtaTta3131B.1.6090.014861
ORF1030V30LGtaTta3131V.21
ORF1030V30LGtaTta3030B.1.1.500.020367
ORF1030V30LGtaTta3030B.1.160.200.267857
ORF1030V30LGtaTta2028AY.610.002096
ORF1030V30LGtaCta828AY.610.000838
ORF1030V30LGtaTta2828B.1.360.004085
ORF1030V30LGtaTta2828P.1.160.010475
ORF1030V30LGtaTta2727P.1.170.004368
ORF1030V30LGtaTta2424B.1.177.490.888889
ORF1030V30LGtaTta2424B.1.177.661
ORF1030V30LGtaTta1923AY.1020.000504
ORF1030V30LGtaCta423AY.1020.000106
ORF1030V30VgtAgtG2323AY.540.002193
ORF1030V30LGtaTta2323B.1.177.611
ORF1030V30LGtaTta2222AJ.11
ORF1030V30LGtaTta1920AY.1000.000874
ORF1030V30LGtaCta120AY.1000.000046
ORF1030V30LGtaTta2020AY.4.20.000434
ORF1030V30LGtaTta2020AY.99.20.001843
ORF1030V30LGtaTta2020B.1.3510.000595
ORF1030V30LGtaTta2020B.1.3960.014114
ORF1030V30VgtAgtG2020B.1.5960.001743
ORF1030V30VgtAgtG1919AY.1030.000118
ORF1030V30LGtaTta1819B.1.1.2140.000998
ORF1030V30LGtaCta119B.1.1.2140.000055
ORF1030V30LGtaTta1919B.1.177.341
ORF1030V30VgtAgtG1318AY.40.00002
ORF1030V30VgtAgtT318AY.40.000005
ORF1030V30VgtAgtC218AY.40.000003
ORF1030V30LGtaTta1618AY.420.000644
ORF1030V30LGtaCta218AY.420.00008
ORF1030V30LGtaTta1818B.1.1.390.009174
ORF1030V30LGtaTta1717B.1.1.3060.007453
ORF1030V30LGtaTta1515AY.200.000583
ORF1030V30LGtaTta1015AY.290.000158
ORF1030V30LGtaCta515AY.290.000079
ORF1030V30LGtaTta1515AY.330.001002
ORF1030V30AgTagCa1515B.1.1.70.000013
ORF1030V30LGtaTta1515B.1.177.291
ORF1030V30VgtAgtG1414B.1.1.5190.000556
ORF1030V30LGtaTta1213AY.1170.001014
ORF1030V30LGtaCta113AY.1170.000085
ORF1030V30LGtaTta1313AY.230.000907
ORF1030V30LGtaTta1313B.1.5960.001133
ORF1030V30LGtaTta1212B.1.416.10.01875
ORF1030V30LGtaTta1212B.1.4290.000282
ORF1030V30LGtaTta1111B.1.177.641
ORF1030V30VgtAgtG1011B.1.617.20.000038
ORF1030V30VgtAgtT111B.1.617.20.000004
ORF1030V30GgTagGa610All0.000001
ORF1030V30GgTAgGC310All0.000001
ORF1030V30GgTAgGG110All0
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