CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = N : Mut = V392V

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
N392V392VsyngtGgtT1042597270.93304629447-29449
N392V392VsyngtGgtC104255620.053908929447-29449
N392V392VsyngtGgtA104251360.013045629447-29449

Details of the mutation V392V within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
N392V392VgtGgtT972710425All0.00186
N392V392VgtGgtC56210425All0.000107
N392V392VgtGgtA13610425All0.000026
N392V392VgtGgtT17371827AY.40.002704
N392V392VgtGgtC861827AY.40.000134
N392V392VgtGgtA41827AY.40.000006
N392V392VgtGgtT10241060B.1.1.70.000917
N392V392VgtGgtC211060B.1.1.70.000019
N392V392VgtGgtA151060B.1.1.70.000013
N392V392VgtGgtT674687AY.440.004102
N392V392VgtGgtC7687AY.440.000043
N392V392VgtGgtA6687AY.440.000037
N392V392VgtGgtT554671B.1.617.20.002086
N392V392VgtGgtC116671B.1.617.20.000437
N392V392VgtGgtA1671B.1.617.20.000004
N392V392VgtGgtT551563AY.250.003314
N392V392VgtGgtC12563AY.250.000072
N392V392VgtGgtT456457AY.90.030823
N392V392VgtGgtC1457AY.90.000068
N392V392VgtGgtT406434AY.430.001799
N392V392VgtGgtC26434AY.430.000115
N392V392VgtGgtA2434AY.430.000009
N392V392VgtGgtT383385AY.50.007909
N392V392VgtGgtA2385AY.50.000041
N392V392VgtGgtT377377B.1.1.2220.076907
N392V392VgtGgtT288290B.1.20.002536
N392V392VgtGgtA1290B.1.20.000009
N392V392VgtGgtC1290B.1.20.000009
N392V392VgtGgtT240254B.10.002198
N392V392VgtGgtC14254B.10.000128
N392V392VgtGgtT173209P.10.002725
N392V392VgtGgtC31209P.10.000488
N392V392VgtGgtA5209P.10.000079
N392V392VgtGgtT208208B.1.575.21
N392V392VgtGgtT97121AY.1030.000602
N392V392VgtGgtA18121AY.1030.000112
N392V392VgtGgtC6121AY.1030.000037
N392V392VgtGgtT115119AY.98.10.00557
N392V392VgtGgtA3119AY.98.10.000145
N392V392VgtGgtC1119AY.98.10.000048
N392V392VgtGgtT96118AY.30.000955
N392V392VgtGgtA18118AY.30.000179
N392V392VgtGgtC4118AY.30.00004
N392V392VgtGgtT115115B.1.5260.002703
N392V392VgtGgtT8282B.1.2430.005706
N392V392VgtGgtT7279AY.390.001779
N392V392VgtGgtC779AY.390.000173
N392V392VgtGgtT5674AY.1020.001485
N392V392VgtGgtC1874AY.1020.000477
N392V392VgtGgtT6771B.1.10.001215
N392V392VgtGgtC471B.1.10.000073
N392V392VgtGgtC6870AY.750.00381
N392V392VgtGgtT270AY.750.000112
N392V392VgtGgtT6060B.1.177.210.004588
N392V392VgtGgtT5457AY.470.00168
N392V392VgtGgtC257AY.470.000062
N392V392VgtGgtA157AY.470.000031
N392V392VgtGgtT5657AY.9.20.002057
N392V392VgtGgtC157AY.9.20.000037
N392V392VgtGgtT5253B.1.4290.001224
N392V392VgtGgtC153B.1.4290.000024
N392V392VgtGgtT4749AY.1200.001747
N392V392VgtGgtC249AY.1200.000074
N392V392VgtGgtT4445AY.200.00171
N392V392VgtGgtC145AY.200.000039
N392V392VgtGgtT4545Q.10.005685
N392V392VgtGgtA2241B.1.2580.001464
N392V392VgtGgtT1841B.1.2580.001198
N392V392VgtGgtC141B.1.2580.000067
N392V392VgtGgtT4041P.1.140.001912
N392V392VgtGgtC141P.1.140.000048
N392V392VgtGgtT3638B.1.1770.000474
N392V392VgtGgtA138B.1.1770.000013
N392V392VgtGgtC138B.1.1770.000013
N392V392VgtGgtT2237AY.1000.001012
N392V392VgtGgtC1237AY.1000.000552
N392V392VgtGgtA337AY.1000.000138
N392V392VgtGgtT3334B.1.1.5190.00131
N392V392VgtGgtA134B.1.1.5190.00004
N392V392VgtGgtT3434B.1.3610.043814
N392V392VgtGgtT2732AY.1190.000953
N392V392VgtGgtC432AY.1190.000141
N392V392VgtGgtA132AY.1190.000035
N392V392VgtGgtT3131AY.60.001275
N392V392VgtGgtT3131C.370.003598
N392V392VgtGgtT3030AY.4.2.10.00447
N392V392VgtGgtT1930B.1.6210.001682
N392V392VgtGgtA930B.1.6210.000797
N392V392VgtGgtC230B.1.6210.000177
N392V392VgtGgtT2828A0.010836
N392V392VgtGgtT2828D.20.002101
N392V392VgtGgtT2727AY.260.000764
N392V392VgtGgtT2427B.1.3510.000713
N392V392VgtGgtC227B.1.3510.000059
N392V392VgtGgtA127B.1.3510.00003
N392V392VgtGgtT2626B.1.1.4511
N392V392VgtGgtC2025AY.140.00176
N392V392VgtGgtT525AY.140.00044
N392V392VgtGgtT2323AY.540.002193
N392V392VgtGgtT2323AY.940.010181
N392V392VgtGgtT2323B.1.1.150.310811
N392V392VgtGgtT2122AY.420.000845
N392V392VgtGgtC122AY.420.00004
N392V392VgtGgtT2021AY.460.002082
N392V392VgtGgtC121AY.460.000104
N392V392VgtGgtT2121AY.860.017427
N392V392VgtGgtT1920AY.120.006005
N392V392VgtGgtC120AY.120.000316
N392V392VgtGgtT2020AY.130.00322
N392V392VgtGgtT2020AY.490.063898
N392V392VgtGgtT2020B.1.1.1920.046189
N392V392VgtGgtT2020B.1.1600.000624
N392V392VgtGgtT1518AY.290.000237
N392V392VgtGgtC318AY.290.000047
N392V392VgtGgtT1818AY.3.10.001535
N392V392VgtGgtT1818AY.39.10.000713
N392V392VgtGgtT1818AY.5.40.004981
N392V392VgtGgtT1517B.1.1.3060.006576
N392V392VgtGgtC217B.1.1.3060.000877
N392V392VgtGgtT1616AY.46.50.003175
N392V392VgtGgtT1616AY.740.00185
N392V392VgtGgtT1616B.1.360.002334
N392V392VgtGgtT1515AY.1210.00203
N392V392VgtGgtT1515B0.001917
N392V392VgtGgtT1314AY.1180.000814
N392V392VgtGgtC114AY.1180.000063
N392V392VgtGgtT1313AY.4.20.000282
N392V392VgtGgtC1313B.1.177.330.021382
N392V392VgtGgtT1313B.1.4350.147727
N392V392VgtGgtT1313B.1.5820.006379
N392V392VgtGgtT912AY.46.40.001481
N392V392VgtGgtC212AY.46.40.000329
N392V392VgtGgtA112AY.46.40.000165
N392V392VgtGgtT1212B.1.36.290.006208
N392V392VgtGgtT1212B.1.4270.000606
N392V392VgtGgtT1112B.1.466.20.004304
N392V392VgtGgtA112B.1.466.20.000391
N392V392VgtGgtT1212B.1.6280.004228
N392V392VgtGgtT1111AY.160.004176
N392V392VgtGgtT1111AY.5.20.027094
N392V392VgtGgtT911B.1.6370.000658
N392V392VgtGgtA211B.1.6370.000146
N392V392VgtGgtT1111N.50.019435
N392V392VgtGgtT1010AY.330.000668
N392V392VgtGgtT1010AY.46.60.000722
N392V392VgtGgtT1010AY.9.10.000837
N392V392VgtGgtT1010AY.99.20.000922
N392V392VgtGgtC1010B.1.5020.526316
N392V392VgtGgtT99AY.1150.046875
N392V392VgtGgtT69AY.1170.000507
N392V392VgtGgtC39AY.1170.000254
N392V392VgtGgtT89AY.450.000973
N392V392VgtGgtC19AY.450.000122
N392V392VgtGgtT99AY.610.000943
N392V392VgtGgtT89AY.850.003417
N392V392VgtGgtC19AY.850.000427
N392V392VgtGgtT89B.1.1.2140.000444
N392V392VgtGgtC19B.1.1.2140.000055
N392V392VgtGgtT99B.1.3930.257143
N392V392VgtGgtT69B.1.5610.002382
N392V392VgtGgtC39B.1.5610.001191
N392V392VgtGgtT99B.1.5720.225
N392V392VgtGgtT88AY.340.000776
N392V392VgtGgtT88AY.360.001186
N392V392VgtGgtT88AY.7.10.000902
N392V392VgtGgtT88AY.720.010884
N392V392VgtGgtT88AY.920.002298
N392V392VgtGgtT88B.1.1.280.00249
N392V392VgtGgtT78B.1.1.3180.002112
N392V392VgtGgtA18B.1.1.3180.000302
N392V392VgtGgtT58B.1.2210.000355
N392V392VgtGgtC38B.1.2210.000213
N392V392VgtGgtT68B.1.258.170.000624
N392V392VgtGgtC28B.1.258.170.000208
N392V392VgtGgtT88B.1.3690.002282
N392V392VgtGgtT78Q.80.001154
N392V392VgtGgtA18Q.80.000165
N392V392VgtGgtT77AY.410.002058
N392V392VgtGgtT57AY.680.001369
N392V392VgtGgtC17AY.680.000274
N392V392VgtGgtA17AY.680.000274
N392V392VgtGgtT67B.1.6090.002876
N392V392VgtGgtA17B.1.6090.000479
N392V392VgtGgtT67B.1.617.10.000774
N392V392VgtGgtC17B.1.617.10.000129
N392V392VgtGgtT66AY.230.000418
N392V392VgtGgtT66AY.910.004383
N392V392VgtGgtT66B.1.1.10.00196
N392V392VgtGgtT66B.1.1.390.003058
N392V392VgtGgtT66B.1.1.440.014458
N392V392VgtGgtT66B.1.177.770.004357
N392V392VgtGgtT66B.1.5970.027778
N392V392VgtGgtT66P.1.17.10.005249
N392V392VgtGgtT35AY.1060.001005
N392V392VgtGgtA15AY.1060.000335
N392V392VgtGgtC15AY.1060.000335
N392V392VgtGgtT55AY.730.003327
N392V392VgtGgtT45AY.75.10.000721
N392V392VgtGgtC15AY.75.10.00018
N392V392VgtGgtT55B.1.1.1630.038168
N392V392VgtGgtC35B.1.3620.004622
N392V392VgtGgtT25B.1.3620.003082
N392V392VgtGgtT55C.110.053191
N392V392VgtGgtT55P.1.20.00578
N392V392VgtGgtT44AD.20.000876
N392V392VgtGgtT44AY.1130.00057
N392V392VgtGgtT44AY.120.2.10.001993
N392V392VgtGgtT44AY.240.001724
N392V392VgtGgtT44AY.270.000259
N392V392VgtGgtT34AY.640.001786
N392V392VgtGgtC14AY.640.000595
N392V392VgtGgtT44AY.690.000747
N392V392VgtGgtT34AY.980.000237
N392V392VgtGgtC14AY.980.000079
N392V392VgtGgtC24B.1.1.2160.001781
N392V392VgtGgtT24B.1.1.2160.001781
N392V392VgtGgtT44B.1.1.2770.003035
N392V392VgtGgtT44B.1.177.60.003906
N392V392VgtGgtA34B.1.438.10.000322
N392V392VgtGgtT14B.1.438.10.000107
N392V392VgtGgtT44B.1.5170.001708
N392V392VgtGgtT44B.1.5250.000453
N392V392VgtGgtT44B.1.5750.001214
N392V392VgtGgtT44B.1.5960.000349
N392V392VgtGgtT34C.360.002732
N392V392VgtGgtC14C.360.000911
N392V392VgtGgtT44P.1.120.001936
N392V392VgtGgtT44P.20.000747
N392V392VgtGgtT33AY.1040.005952
N392V392VgtGgtT23AY.1080.002205
N392V392VgtGgtA13AY.1080.001103
N392V392VgtGgtT33AY.120.10.000963
N392V392VgtGgtC23AY.34.10.00102
N392V392VgtGgtT13AY.34.10.00051
N392V392VgtGgtT33AY.4.50.000322
N392V392VgtGgtC33AY.46.20.001906
N392V392VgtGgtT33AY.630.001161
N392V392VgtGgtT33AY.840.001312
N392V392VgtGgtT33AY.900.002053
N392V392VgtGgtT33B.1.1.100.003344
N392V392VgtGgtC33B.1.1.3540.013158
N392V392VgtGgtT33B.1.1.4340.001046
N392V392VgtGgtA23B.1.1.580.010753
N392V392VgtGgtT13B.1.1.580.005376
N392V392VgtGgtC33B.1.177.100.002634
N392V392VgtGgtT33B.1.177.150.001893
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