CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = N : Mut = S194del

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
N194S194deldelTCA---107107128853-28855

Details of the mutation S194del within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
N194S194delTCA---107107All0.00002
N194S194delTCA---1616AY.250.000096
N194S194delTCA---1313B.10.000119
N194S194delTCA---1212AY.60.000494
N194S194delTCA---1111AY.40.000017
N194S194delTCA---99B.1.1.70.000008
N194S194delTCA---33B.1.1770.00004
N194S194delTCA---33P.10.000047
N194S194delTCA---22AY.400.001929
N194S194delTCA---22AY.500.001599
N194S194delTCA---22AY.9.20.000073
N194S194delTCA---22B.1.10.000036
N194S194delTCA---22B.1.20.000018
N194S194delTCA---22B.1.2650.002541
N194S194delTCA---22B.1.3510.000059
N194S194delTCA---11AY.1080.001103
N194S194delTCA---11AY.430.000004
N194S194delTCA---11AY.460.000104
N194S194delTCA---11AY.50.000021
N194S194delTCA---11AY.750.000056
N194S194delTCA---11B0.000128
N194S194delTCA---11B.1.1.1530.001095
N194S194delTCA---11B.1.1.700.000341
N194S194delTCA---11B.1.177.680.015152
N194S194delTCA---11B.1.2210.000071
N194S194delTCA---11B.1.2340.000132
N194S194delTCA---11B.1.416.10.001563
N194S194delTCA---11B.1.4270.00005
N194S194delTCA---11B.1.4650.003802
N194S194delTCA---11B.1.5250.000113
N194S194delTCA---11B.1.5260.000024
N194S194delTCA---11B.1.5760.000907
N194S194delTCA---11B.1.5960.000087
N194S194delTCA---11B.1.5990.00365
N194S194delTCA---11B.1.617.10.000129
N194S194delTCA---11B.1.617.20.000004
N194S194delTCA---11B.40.002208
N194S194delTCA---11C.37.10.002618
N194S194delTCA---11P.1.120.000484
N194S194delTCA---11P.1.140.000048
N194S194delTCA---11P.1.150.000232