CoV-GLUE Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = N : Mut = S193I

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORF	CodonNum	Mut	ORF1abMut	MutType	RefCodon	MutCodon	AACount	CodonCount	CodonProp	Genome Position
N	193	S193I		nonsyn	aGt	aTt	9107	9106	0.99989	28850-28852
N	193	S193I		nonsyn	aGT	aTC	9107	1	0.000109806	28850-28852

Details of the mutation S193I within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORF	CodonNum	Mut	RefCodon	MutCodon	CodonCount	AACount	Lineage	LineageCodonProp
N	193	S193I	aGt	aTt	9106	9107	All	0.001742
N	193	S193I	aGT	aTC	1	9107	All	0
N	193	S193I	aGt	aTt	1325	1325	B.1.258	0.088175
N	193	S193I	aGt	aTt	816	816	AY.44	0.004967
N	193	S193I	aGt	aTt	603	603	B.3.1	1
N	193	S193I	aGt	aTt	542	542	AY.5	0.011192
N	193	S193I	aGt	aTt	510	510	AY.4	0.000794
N	193	S193I	aGt	aTt	454	454	B.1.617.2	0.001709
N	193	S193I	aGt	aTt	405	405	B.1.1.7	0.000363
N	193	S193I	aGt	aTt	247	247	B.1.1	0.004481
N	193	S193I	aGt	aTt	237	237	AY.103	0.001472
N	193	S193I	aGt	aTt	236	236	B.1.221.4	0.983333
N	193	S193I	aGt	aTt	225	225	AY.3	0.002238
N	193	S193I	aGt	aTt	211	211	AY.25	0.001269
N	193	S193I	aGt	aTt	206	206	AY.43	0.000913
N	193	S193I	aGt	aTt	202	202	B.1	0.00185
N	193	S193I	aGt	aTt	154	154	B.1.416	0.195431
N	193	S193I	aGt	aTt	142	142	B.1.575	0.043083
N	193	S193I	aGt	aTt	118	118	B.1.1.219	0.59
N	193	S193I	aGt	aTt	106	106	AY.98.1	0.005134
N	193	S193I	aGt	aTt	103	103	B.1.595	0.026879
N	193	S193I	aGt	aTt	90	90	B.1.385	0.957447
N	193	S193I	aGt	aTt	78	78	B.1.160	0.002433
N	193	S193I	aGt	aTt	72	72	P.1	0.001134
N	193	S193I	aGt	aTt	62	62	B.1.459	0.253061
N	193	S193I	aGt	aTt	62	62	B.1.621.1	0.031361
N	193	S193I	aGt	aTt	57	57	B.1.2	0.000502
N	193	S193I	aGt	aTt	55	55	B.1.429	0.001294
N	193	S193I	aGt	aTt	42	42	AY.33	0.002805
N	193	S193I	aGt	aTt	41	41	AY.47	0.001275
N	193	S193I	aGt	aTt	40	40	AY.100	0.00184
N	193	S193I	aGt	aTt	39	39	B.1.177	0.000514
N	193	S193I	aGt	aTt	36	36	AY.102	0.000955
N	193	S193I	aGt	aTt	33	33	C.36	0.030055
N	193	S193I	aGt	aTt	32	32	AY.23	0.002232
N	193	S193I	aGt	aTt	31	31	B.1.177.81	0.005869
N	193	S193I	aGt	aTt	30	30	AY.114	0.006933
N	193	S193I	aGt	aTt	30	30	B.61	0.172414
N	193	S193I	aGt	aTt	29	29	AY.109	0.02145
N	193	S193I	aGt	aTt	29	29	AY.4.2	0.000629
N	193	S193I	aGt	aTt	29	29	B.1.1.28	0.009026
N	193	S193I	aGt	aTt	29	29	B.1.36	0.004231
N	193	S193I	aGt	aTt	28	28	AY.46	0.002914
N	193	S193I	aGt	aTt	26	26	AY.20	0.00101
N	193	S193I	aGt	aTt	26	26	B.1.427	0.001313
N	193	S193I	aGt	aTt	25	25	AY.34	0.002424
N	193	S193I	aGt	aTt	25	25	AY.99.2	0.002304
N	193	S193I	aGt	aTt	24	24	AY.39	0.000593
N	193	S193I	aGt	aTt	23	23	AY.46.6	0.001661
N	193	S193I	aGt	aTt	21	21	B.1.1.121	0.050971
N	193	S193I	aGt	aTt	21	21	B.1.1.519	0.000834
N	193	S193I	aGt	aTt	20	20	AY.61	0.002096
N	193	S193I	aGt	aTt	20	20	B.1.1.50	0.013578
N	193	S193I	aGt	aTt	19	19	AY.121	0.002571
N	193	S193I	aGt	aTt	19	19	AY.29	0.0003
N	193	S193I	aGt	aTt	19	19	B.1.177.36	0.306452
N	193	S193I	aGt	aTt	19	19	B.1.221	0.00135
N	193	S193I	aGt	aTt	19	19	P.1.14	0.000908
N	193	S193I	aGt	aTt	18	18	B.1.588.1	0.692308
N	193	S193I	aGt	aTt	17	17	AY.6	0.000699
N	193	S193I	aGt	aTt	17	17	B.1.400	0.007293
N	193	S193I	aGt	aTt	17	17	B.1.526	0.0004
N	193	S193I	aGt	aTt	16	16	AY.4.3	0.013468
N	193	S193I	aGt	aTt	16	16	B.3	0.013289
N	193	S193I	aGt	aTt	15	15	AY.4.5	0.001612
N	193	S193I	aGt	aTt	15	15	B.1.619	0.013066
N	193	S193I	aGt	aTt	14	14	B.1.617.1	0.001806
N	193	S193I	aGt	aTt	14	14	B.1.621	0.001239
N	193	S193I	aGt	aTt	13	13	AY.113	0.001851
N	193	S193I	aGt	aTt	13	13	B.1.234	0.001715
N	193	S193I	aGt	aTt	12	12	AY.120	0.000446
N	193	S193I	aGt	aTt	12	12	AY.26	0.00034
N	193	S193I	aGt	aTt	12	12	AY.9.2	0.000441
N	193	S193I	aGt	aTt	12	12	B.1.1.291	0.008909
N	193	S193I	aGt	aTt	12	12	B.1.243	0.000835
N	193	S193I	aGt	aTt	12	12	B.1.332	0.041958
N	193	S193I	aGt	aTt	11	11	B	0.001406
N	193	S193I	aGt	aTt	10	10	AY.41	0.002939
N	193	S193I	aGt	aTt	10	10	AY.9.1	0.000837
N	193	S193I	aGt	aTt	10	10	B.1.1.322	0.087719
N	193	S193I	aGt	aTt	10	10	B.1.1.37	0.001929
N	193	S193I	aGt	aTt	9	9	AY.117	0.000761
N	193	S193I	aGt	aTt	9	9	AY.36	0.001334
N	193	S193I	aGt	aTt	9	9	AY.42	0.000362
N	193	S193I	aGt	aTt	9	9	AY.98	0.000711
N	193	S193I	aGt	aTt	8	8	AY.14	0.000704
N	193	S193I	aGt	aTt	8	8	AY.21	0.01518
N	193	S193I	aGt	aTt	8	8	AY.71	0.0038
N	193	S193I	aGt	aTt	8	8	B.1.1.174	0.027027
N	193	S193I	aGt	aTt	8	8	B.1.568	0.008889
N	193	S193I	aGt	aTt	8	8	B.1.609	0.003835
N	193	S193I	aGt	aTt	8	8	B.1.628	0.002819
N	193	S193I	aGt	aTt	8	8	R.1	0.00072
N	193	S193I	aGt	aTt	7	7	AY.12	0.002212
N	193	S193I	aGt	aTt	7	7	AY.45	0.000852
N	193	S193I	aGt	aTt	7	7	AY.5.4	0.001937
N	193	S193I	aGt	aTt	7	7	AY.7.2	0.003915
N	193	S193I	aGt	aTt	7	7	B.1.1.326	0.012324
N	193	S193I	aGt	aTt	7	7	B.1.236	0.014374
N	193	S193I	aGt	aTt	7	7	B.1.351	0.000208
N	193	S193I	aGt	aTt	7	7	B.1.475	1
N	193	S193I	aGt	aTt	7	7	B.1.596	0.00061
N	193	S193I	aGt	aTt	7	7	C.36.3	0.003971
N	193	S193I	aGt	aTt	6	6	AY.119	0.000212
N	193	S193I	aGt	aTt	6	6	AY.38	0.002996
N	193	S193I	aGt	aTt	6	6	AY.67	0.002786
N	193	S193I	aGt	aTt	6	6	AY.70	0.001251
N	193	S193I	aGt	aTt	6	6	B.1.1.306	0.00263
N	193	S193I	aGt	aTt	6	6	B.1.1.70	0.002046
N	193	S193I	aGt	aTt	6	6	B.1.456	0.019608
N	193	S193I	aGt	aTt	6	6	B.1.525	0.000679
N	193	S193I	aGt	aTt	6	6	B.31	0.022388
N	193	S193I	aGt	aTt	6	6	C.37	0.000696
N	193	S193I	aGt	aTt	6	6	D.2	0.00045
N	193	S193I	aGt	aTt	6	6	P.2	0.00112
N	193	S193I	aGt	aTt	5	5	AY.106	0.001674
N	193	S193I	aGt	aTt	5	5	AY.116.1	0.001557
N	193	S193I	aGt	aTt	5	5	AY.16	0.001898
N	193	S193I	aGt	aTt	5	5	AY.27	0.000324
N	193	S193I	aGt	aTt	5	5	AY.3.1	0.000426
N	193	S193I	aGt	aTt	5	5	AY.46.4	0.000823
N	193	S193I	aGt	aTt	5	5	AY.62	0.002179
N	193	S193I	aGt	aTt	5	5	B.1.1.305	0.019305
N	193	S193I	aGt	aTt	5	5	B.1.1.420	0.00503
N	193	S193I	aGt	aTt	5	5	B.1.258.17	0.00052
N	193	S193I	aGt	aTt	5	5	B.1.260	0.016722
N	193	S193I	aGt	aTt	5	5	B.1.396	0.003529
N	193	S193I	aGt	aTt	5	5	B.1.462	0.036232
N	193	S193I	aGt	aTt	5	5	P.1.1	0.001588
N	193	S193I	aGt	aTt	4	4	AD.2	0.000876
N	193	S193I	aGt	aTt	4	4	AY.120.1	0.001284
N	193	S193I	aGt	aTt	4	4	AY.75.1	0.000721
N	193	S193I	aGt	aTt	4	4	AY.93	0.001092
N	193	S193I	aGt	aTt	4	4	B.1.1.161	0.014134
N	193	S193I	aGt	aTt	4	4	B.1.1.294	0.005063
N	193	S193I	aGt	aTt	4	4	B.1.104	0.01476
N	193	S193I	aGt	aTt	4	4	B.1.258.14	0.003922
N	193	S193I	aGt	aTt	4	4	B.1.281	0.086957
N	193	S193I	aGt	aTt	4	4	B.1.356	0.006908
N	193	S193I	aGt	aTt	4	4	B.1.36.29	0.002069
N	193	S193I	aGt	aTt	4	4	B.1.466.2	0.001565
N	193	S193I	aGt	aTt	4	4	B.1.582	0.001963
N	193	S193I	aGt	aTt	3	3	A.21	0.00831
N	193	S193I	aGt	aTt	3	3	AY.1	0.001187
N	193	S193I	aGt	aTt	3	3	AY.16.1	0.00141
N	193	S193I	aGt	aTt	3	3	AY.32	0.001597
N	193	S193I	aGt	aTt	3	3	AY.34.1	0.00153
N	193	S193I	aGt	aTt	3	3	AY.53	0.000863
N	193	S193I	aGt	aTt	3	3	AY.55	0.002752
N	193	S193I	aGt	aTt	3	3	AY.72	0.004082
N	193	S193I	aGt	aTt	3	3	AY.74	0.000347
N	193	S193I	aGt	aTt	3	3	AY.75	0.000168
N	193	S193I	aGt	aTt	3	3	AY.87	0.002498
N	193	S193I	aGt	aTt	3	3	AY.88	0.002653
N	193	S193I	aGt	aTt	3	3	B.1.1.1	0.00098
N	193	S193I	aGt	aTt	3	3	B.1.1.107	0.096774
N	193	S193I	aGt	aTt	3	3	B.1.1.214	0.000166
N	193	S193I	aGt	aTt	3	3	B.1.1.25	0.001706
N	193	S193I	aGt	aTt	3	3	B.1.1.277	0.002276
N	193	S193I	aGt	aTt	3	3	B.1.1.318	0.000905
N	193	S193I	aGt	aTt	3	3	B.1.1.355	0.046154
N	193	S193I	aGt	aTt	3	3	B.1.1.89	0.018182
N	193	S193I	aGt	aTt	3	3	B.1.240	0.000647
N	193	S193I	aGt	aTt	3	3	B.1.293	0.0375
N	193	S193I	aGt	aTt	3	3	B.1.367	0.002377
N	193	S193I	aGt	aTt	3	3	B.1.416.1	0.004687
N	193	S193I	aGt	aTt	3	3	B.1.565	0.002431
N	193	S193I	aGt	aTt	3	3	B.1.576	0.00272
N	193	S193I	aGt	aTt	3	3	B.1.9.5	0.017045
N	193	S193I	aGt	aTt	3	3	B.4	0.006623
N	193	S193I	aGt	aTt	3	3	P.1.10	0.000808
N	193	S193I	aGt	aTt	3	3	Q.8	0.000495
N	193	S193I	aGt	aTt	2	2	A.1	0.000564
N	193	S193I	aGt	aTt	2	2	AY.111	0.000366
N	193	S193I	aGt	aTt	2	2	AY.116	0.000574
N	193	S193I	aGt	aTt	2	2	AY.118	0.000125
N	193	S193I	aGt	aTt	2	2	AY.120.2	0.002571
N	193	S193I	aGt	aTt	2	2	AY.120.2.1	0.000997
N	193	S193I	aGt	aTt	2	2	AY.13	0.000322
N	193	S193I	aGt	aTt	2	2	AY.40	0.001929
N	193	S193I	aGt	aTt	2	2	AY.46.5	0.000397
N	193	S193I	aGt	aTt	2	2	AY.56	0.00321
N	193	S193I	aGt	aTt	2	2	AY.59	0.001059
N	193	S193I	aGt	aTt	2	2	AY.68	0.000547
N	193	S193I	aGt	aTt	2	2	AY.81	0.003984
N	193	S193I	aGt	aTt	2	2	AY.84	0.000875
N	193	S193I	aGt	aTt	2	2	AY.9	0.000135
N	193	S193I	aGt	aTt	2	2	AY.99	0.002099
N	193	S193I	aGt	aTt	2	2	B.1.1.159	0.009346
N	193	S193I	aGt	aTt	2	2	B.1.1.189	0.003026
N	193	S193I	aGt	aTt	2	2	B.1.1.203	0.033898
N	193	S193I	aGt	aTt	2	2	B.1.1.208	0.02439
N	193	S193I	aGt	aTt	2	2	B.1.1.269	0.002706
N	193	S193I	aGt	aTt	2	2	B.1.1.284	0.000215
N	193	S193I	aGt	aTt	2	2	B.1.1.317	0.000823
N	193	S193I	aGt	aTt	2	2	B.1.1.398	0.006452
N	193	S193I	aGt	aTt	2	2	B.1.1.416	0.00181
N	193	S193I	aGt	aTt	2	2	B.1.1.444	0.285714
N	193	S193I	aGt	aTt	2	2	B.1.1.528	0.009615
N	193	S193I	aGt	aTt	2	2	B.1.1.63	0.000772
N	193	S193I	aGt	aTt	2	2	B.1.177.33	0.003289
N	193	S193I	aGt	aTt	2	2	B.1.177.57	0.000562
N	193	S193I	aGt	aTt	2	2	B.1.177.60	0.000437
N	193	S193I	aGt	aTt	2	2	B.1.177.79	0.004684
N	193	S193I	aGt	aTt	2	2	B.1.189	0.008584
N	193	S193I	aGt	aTt	2	2	B.1.265	0.002541
N	193	S193I	aGt	aTt	2	2	B.1.279	0.001027
N	193	S193I	aGt	aTt	2	2	B.1.320	0.002491
N	193	S193I	aGt	aTt	2	2	B.1.344	0.016393
N	193	S193I	aGt	aTt	2	2	B.1.351.2	0.000605
N	193	S193I	aGt	aTt	2	2	B.1.351.3	0.001753
N	193	S193I	aGt	aTt	2	2	B.1.637	0.000146
N	193	S193I	aGt	aTt	2	2	B.40	0.000729
N	193	S193I	aGt	aTt	2	2	B.6	0.00182
N	193	S193I	aGt	aTt	2	2	C.1	0.004785
N	193	S193I	aGt	aTt	2	2	P.1.7	0.000639
N	193	S193I	aGt	aTt	2	2	P.6	0.006289
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	A	0.000387
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	A.2.5	0.000499
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	A.30	0.142857
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	A.5	0.001923
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	AA.1	0.007246
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	AV.1	0.005051
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	AY.10	0.00053
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	AY.107	0.000466
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	AY.110	0.000113
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	AY.17	0.008197
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	AY.24	0.000431
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	AY.29.1	0.000221
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	AY.30	0.000396
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	AY.37	0.000316
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	AY.4.4	0.000409
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	AY.46.3	0.000934
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	AY.48	0.000465
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	AY.57	0.000656
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	AY.60	0.000938
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	AY.69	0.000187
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	AY.78	0.001541
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	AY.80	0.001129
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	AY.83	0.001724
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	AY.85	0.000427
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	AY.92	0.000287
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	AZ.1	0.000867
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.1.1.10	0.001115
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.1.1.153	0.001095
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.1.1.194	0.00495
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.1.1.197	0.037037
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.1.1.216	0.00089
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.1.1.222	0.000204
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.1.1.241	0.00207
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.1.1.307	0.002532
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.1.1.316	0.000925
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.1.1.33	0.000421
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.1.1.348	0.000796
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.1.1.369	0.000446
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.1.1.372	0.000689
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.1.1.38	0.058824
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.1.1.409	0.002833
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.1.1.434	0.000349
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.1.110.3	0.000718
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.1.119	0.010526
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.1.160.26	0.002421
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.1.160.9	0.007194
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.1.177.12	0.000152
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.1.177.23	0.003236
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.1.177.35	0.000691
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.1.177.46	0.000918
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.1.177.51	0.004566
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.1.177.53	0.002392
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.1.177.65	0.000665
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.1.177.75	0.001041
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.1.177.82	0.000477
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.1.194	0.04
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.1.206	0.000816
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.1.222	0.001692
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.1.235	0.002519
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.1.252	0.006623
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.1.258.12	0.007874
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.1.258.24	0.010753
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.1.306	0.005714
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.1.311	0.000275
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.1.315	0.006061
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.1.346	0.001311
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.1.349	0.000715
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.1.36.17	0.000494
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.1.36.19	0.009259
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.1.36.31	0.001751
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.1.36.35	0.002604
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.1.36.7	0.004
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.1.380	0.006623
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.1.413	0.004255
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.1.415	0.014286
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.1.437	0.020833
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.1.44	0.008333
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.1.467	0.04
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.1.470	0.001404
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.1.480	0.002488
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.1.503	0.002488
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.1.517	0.000427
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.1.533	0.009615
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.1.538	0.008065
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.1.549	0.007194
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.1.555	0.022222
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.1.558	0.004566
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.1.564	0.000426
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.1.577	0.000687
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.1.588	0.00091
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.1.589	0.007576
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.1.600	0.005848
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.1.607	0.052632
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.1.623	0.000536
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.1.8	0.001972
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.1.9	0.006173
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.20	0.023256
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.23	0.002924
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.29	0.003509
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.55	0.00295
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	B.6.6	0.000889
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	C.16	0.00106
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	C.22	0.071429
N	193	S193I	aGT	aTC	1	1	C.35	0.000774
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	C.37.1	0.002618
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	K.2	0.04
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	P.1.11	0.010204
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	P.1.12	0.000484
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	P.1.15	0.000232
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	P.1.17	0.000162
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	P.1.4	0.000977
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	Q.1	0.000126
N	193	S193I	aGt	aTt	1	1	Q.3	0.000145

CoV-GLUE is still in development. CoV-GLUE was originally developed as part of COG-UK by Josh Singer using the GLUE framework at the MRC-University of Glasgow Centre for Virus Research (CVR). In 2021 it was redeveloped by Richard Orton to scale to the millions of genome sequences available. We acknowledge support from the MRC (MC_UU_12014/12), WT (220977/Z/20/Z) and UKRI G2P (MR/W005611/1). Please contact Richard Orton with any queries: Richard.Orton@glasgow.ac.uk

CoV-GLUE uses sequence data from GISAID. GISAID data provided via this web application is subject to GISAID's Terms and Conditions.