CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = N : Mut = I84V

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
N84I84VnonsynAttGtt7447420.99731228523-28525
N84I84VnonsynAtTGtA74410.0013440928523-28525
N84I84VnonsynAtTGtG74410.0013440928523-28525

Details of the mutation I84V within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
N84I84VAttGtt742744All0.000142
N84I84VAtTGtA1744All0
N84I84VAtTGtG1744All0
N84I84VAttGtt378379B.1.10.006857
N84I84VAtTGtA1379B.1.10.000018
N84I84VAttGtt115115B.1.1.3290.442308
N84I84VAttGtt110110B.1.1.2370.594595
N84I84VAttGtt2525B.1.1.4190.185185
N84I84VAttGtt1717B.10.000156
N84I84VAttGtt1414B.1.1650.166667
N84I84VAttGtt1313B.1.6380.684211
N84I84VAttGtt66AY.50.000124
N84I84VAttGtt55B.1.1.70.000004
N84I84VAttGtt55B.1.2410.004058
N84I84VAttGtt55B.1.438.10.000536
N84I84VAttGtt44B.1.1.10.001307
N84I84VAttGtt33B.1.4290.000071
N84I84VAttGtt33B.1.617.20.000011
N84I84VAttGtt22AY.1200.000074
N84I84VAttGtt22AY.40.000003
N84I84VAttGtt22B.1.1.2200.003717
N84I84VAttGtt22B.1.1.3720.001377
N84I84VAttGtt22B.1.1.4320.002532
N84I84VAttGtt22B.1.1.4480.004065
N84I84VAttGtt22P.10.000032
N84I84VAttGtt11AV.10.005051
N84I84VAttGtt11AY.230.00007
N84I84VAttGtt11AY.260.000028
N84I84VAttGtt11AY.290.000016
N84I84VAttGtt11AY.30.00001
N84I84VAtTGtG11AY.400.000964
N84I84VAttGtt11AY.470.000031
N84I84VAttGtt11AY.99.20.000092
N84I84VAttGtt11B.1.1.280.000311
N84I84VAttGtt11B.1.1.2940.001266
N84I84VAttGtt11B.1.1.3360.016667
N84I84VAttGtt11B.1.1.4090.002833
N84I84VAttGtt11B.1.1.460.004367
N84I84VAttGtt11B.1.1.5250.005464
N84I84VAttGtt11B.1.1.700.000341
N84I84VAttGtt11B.1.1110.001175
N84I84VAttGtt11B.1.20.000009
N84I84VAttGtt11B.1.243.10.022222
N84I84VAttGtt11B.1.360.000146
N84I84VAttGtt11B.1.3990.001934
N84I84VAttGtt11B.1.466.20.000391
N84I84VAttGtt11B.1.5960.000087
N84I84VAttGtt11B.1.6090.000479
N84I84VAttGtt11B.1.617.10.000129
N84I84VAttGtt11B.1.6370.000073
N84I84VAttGtt11C.60.037037