CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = N : Mut = D401Y

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
N401D401YnonsynGatTat15626156240.99987229474-29476
N401D401YnonsynGaTTaC1562620.00012799229474-29476

Details of the mutation D401Y within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
N401D401YGatTat1562415626All0.002988
N401D401YGaTTaC215626All0
N401D401YGatTat82048204B.1.438.10.879974
N401D401YGatTat10411041B.1.5880.947225
N401D401YGatTat977977B.1.1.70.000875
N401D401YGatTat690690AY.40.001074
N401D401YGatTat639639B.1.1.700.21794
N401D401YGatTat556556B.1.2320.298764
N401D401YGatTat484484B.1.5870.918406
N401D401YGatTat450450B.10.004122
N401D401YGatTat269269AY.9.20.00988
N401D401YGatTat146146B.1.2520.966887
N401D401YGatTat145145B.1.4380.947712
N401D401YGatTat139139B.1.1.500.094365
N401D401YGatTat129129B.1.617.20.000486
N401D401YGatTat120120B.1.1.3060.052609
N401D401YGatTat8989AY.260.00252
N401D401YGatTat8383P.10.001308
N401D401YGatTat8181B.1.5950.021138
N401D401YGatTat7575B.1.1.2180.576923
N401D401YGatTat7171B.1.20.000625
N401D401YGatTat5454AY.430.000239
N401D401YGatTat5252B.1.438.21
N401D401YGatTat5050AY.1030.00031
N401D401YGatTat4949AY.250.000295
N401D401YGatTat4848B.1.10.000871
N401D401YGatTat4848B.1.1770.000632
N401D401YGatTat4848B.1.4290.001129
N401D401YGatTat4343B.1.438.40.914894
N401D401YGatTat3940AY.440.000237
N401D401YGaTTaC140AY.440.000006
N401D401YGatTat3838AY.30.000378
N401D401YGatTat3838AY.710.018052
N401D401YGatTat2626B.1.588.11
N401D401YGatTat2020AY.200.000777
N401D401YGatTat2020B.1.1.510.034364
N401D401YGatTat2020B.1.1600.000624
N401D401YGatTat1717B.1.36.310.029772
N401D401YGatTat1616AY.290.000252
N401D401YGatTat1515AY.4.20.000325
N401D401YGatTat1414B.1.4270.000707
N401D401YGatTat1313B.1.1.280.004046
N401D401YGatTat1313B.1.2580.000865
N401D401YGatTat1313B.1.258.170.001352
N401D401YGatTat1313B.1.438.31
N401D401YGatTat1313B.1.5960.001133
N401D401YGatTat1111AY.3.10.000938
N401D401YGatTat1111B.1.5260.000259
N401D401YGatTat1111P.1.10.003494
N401D401YGatTat1010AY.1020.000265
N401D401YGatTat1010B.1.177.120.001517
N401D401YGatTat1010B.1.3110.002746
N401D401YGatTat1010B.1.5670.033333
N401D401YGatTat1010L.10.019048
N401D401YGatTat99B.1.1.2310.027864
N401D401YGatTat99B.1.1.5190.000357
N401D401YGatTat99B.1.6280.003171
N401D401YGatTat99P.20.00168
N401D401YGatTat88AY.1200.000297
N401D401YGatTat88AY.1210.001083
N401D401YGatTat88AY.390.000198
N401D401YGatTat88B.1.36.290.004139
N401D401YGatTat88B.1.466.20.00313
N401D401YGatTat88B.1.6320.053691
N401D401YGatTat88P.1.100.002156
N401D401YGatTat77AY.116.10.00218
N401D401YGatTat77B.1.1.2970.01566
N401D401YGatTat77B.1.36.80.007
N401D401YGatTat77B.1.5480.25
N401D401YGatTat77B.1.6210.00062
N401D401YGatTat560.277778
N401D401YGaTTaC160.055556
N401D401YGatTat66AY.1190.000212
N401D401YGatTat66B.1.6360.040268
N401D401YGatTat55AY.39.10.000198
N401D401YGatTat55AY.46.20.003177
N401D401YGatTat55AY.50.000103
N401D401YGatTat55AY.750.00028
N401D401YGatTat55B.1.1.100.005574
N401D401YGatTat55B.1.2400.001078
N401D401YGatTat55B.1.3510.000149
N401D401YGatTat55B.1.36.10.005701
N401D401YGatTat55B.1.617.10.000645
N401D401YGatTat55B.1.6370.000365
N401D401YGatTat55P.1.170.000809
N401D401YGatTat44AY.20.001425
N401D401YGatTat44AY.4.2.10.000596
N401D401YGatTat44AY.420.000161
N401D401YGatTat44AY.510.003636
N401D401YGatTat44B.1.1.2220.000816
N401D401YGatTat44B.1.1.4640.005891
N401D401YGatTat44B.1.2210.000284
N401D401YGatTat44B.1.2430.000278
N401D401YGatTat33AY.1040.005952
N401D401YGatTat33AY.1180.000188
N401D401YGatTat33AY.120.2.10.001495
N401D401YGatTat33AY.240.001293
N401D401YGatTat33AY.470.000093
N401D401YGatTat33AY.60.000123
N401D401YGatTat33B.1.177.150.001893
N401D401YGatTat33B.1.2100.006397
N401D401YGatTat33B.1.36.170.001482
N401D401YGatTat33B.1.36.380.004926
N401D401YGatTat33B.1.4680.017143
N401D401YGatTat33B.1.5750.00091
N401D401YGatTat33B.1.619.10.001924
N401D401YGatTat33C.370.000348
N401D401YGatTat33C.70.103448
N401D401YGatTat33P.1.140.000143
N401D401YGatTat33P.1.150.000697
N401D401YGatTat22A.90.090909
N401D401YGatTat22AY.1170.000169
N401D401YGatTat22AY.130.000322
N401D401YGatTat22AY.140.000176
N401D401YGatTat22AY.330.000134
N401D401YGatTat22AY.360.000296
N401D401YGatTat22AY.39.20.003082
N401D401YGatTat22AY.450.000243
N401D401YGatTat22AY.5.30.000675
N401D401YGatTat22AY.75.10.000361
N401D401YGatTat22AY.90.000135
N401D401YGatTat22AY.980.000158
N401D401YGatTat22AY.99.20.000184
N401D401YGatTat22AZ.10.001735
N401D401YGatTat22B0.000256
N401D401YGatTat22B.1.1.10.000653
N401D401YGatTat22B.1.1.1700.002494
N401D401YGatTat22B.1.1.2170.007273
N401D401YGatTat22B.1.1.3770.002762
N401D401YGatTat22B.1.1.4200.002012
N401D401YGatTat22B.1.1.4320.002532
N401D401YGatTat22B.1.1.950.039216
N401D401YGatTat22B.1.130.004751
N401D401YGatTat22B.1.2230.005556
N401D401YGatTat22B.1.2360.004107
N401D401YGatTat22B.1.2370.00995
N401D401YGatTat22B.1.2390.002442
N401D401YGatTat22B.1.3460.002621
N401D401YGatTat22B.1.360.000292
N401D401YGatTat22B.1.4920.014085
N401D401YGatTat22B.1.5250.000226
N401D401YGatTat22B.1.5640.000852
N401D401YGatTat22B.4.10.037736
N401D401YGatTat22B.6.60.001778
N401D401YGatTat22P.1.120.000968
N401D401YGatTat11A0.000387
N401D401YGatTat11A.20.000662
N401D401YGatTat11A.2.40.003367
N401D401YGatTat11AN.10.02
N401D401YGatTat11AY.1130.000142
N401D401YGatTat11AY.1160.000287
N401D401YGatTat11AY.190.00114
N401D401YGatTat11AY.230.00007
N401D401YGatTat11AY.29.10.000221
N401D401YGatTat11AY.350.000233
N401D401YGatTat11AY.460.000104
N401D401YGatTat11AY.5.40.000277
N401D401YGatTat11AY.530.000288
N401D401YGatTat11AY.540.000095
N401D401YGatTat11AY.650.000533
N401D401YGatTat11AY.680.000274
N401D401YGatTat11AY.70.000196
N401D401YGatTat11AY.9.10.000084
N401D401YGatTat11AY.930.000273
N401D401YGatTat11AY.98.10.000048
N401D401YGatTat11AY.99.10.001553
N401D401YGatTat11B.1.1.1760.000439
N401D401YGatTat11B.1.1.2090.008929
N401D401YGatTat11B.1.1.2530.002506
N401D401YGatTat11B.1.1.2770.000759
N401D401YGatTat11B.1.1.2820.011628
N401D401YGatTat11B.1.1.2840.000107
N401D401YGatTat11B.1.1.3070.002532
N401D401YGatTat11B.1.1.3120.001912
N401D401YGatTat11B.1.1.3750.011905
N401D401YGatTat11B.1.1.4100.037037
N401D401YGatTat11B.1.1.4130.006897
N401D401YGatTat11B.1.1.4160.000905
N401D401YGatTat11B.1.1.4340.000349
N401D401YGatTat11B.1.1.470.005348
N401D401YGatTat11B.1.1.480.002874
N401D401YGatTat11B.1.1.5250.005464
N401D401YGatTat11B.1.1.5260.003546
N401D401YGatTat11B.1.1.560.017857
N401D401YGatTat11B.1.110.30.000718
N401D401YGatTat11B.1.1110.001175
N401D401YGatTat11B.1.1390.000733
N401D401YGatTat11B.1.1420.002899
N401D401YGatTat11B.1.1490.003425
N401D401YGatTat11B.1.160.180.007299
N401D401YGatTat11B.1.177.100.000878
N401D401YGatTat11B.1.177.170.000821
N401D401YGatTat11B.1.177.560.000668
N401D401YGatTat11B.1.177.600.000218
N401D401YGatTat11B.1.177.730.000566
N401D401YGatTat11B.1.2410.000812
N401D401YGatTat11B.1.2420.018868
N401D401YGatTat11B.1.258.160.001637
N401D401YGatTat11B.1.3060.005714
N401D401YGatTat11B.1.3670.000792
N401D401YGatTat11B.1.3690.000285
N401D401YGatTat11B.1.3890.001002
N401D401YGatTat11B.1.390.003906
N401D401YGatTat11B.1.4090.000781
N401D401YGatTat11B.1.429.10.012048
N401D401YGatTat11B.1.4360.001029
N401D401YGatTat11B.1.4390.005917
N401D401YGatTat11B.1.4690.00361
N401D401YGatTat11B.1.4740.001901
N401D401YGatTat11B.1.4990.00105
N401D401YGatTat11B.1.5230.002451
N401D401YGatTat11B.1.5380.008065
N401D401YGatTat11B.1.5610.000397
N401D401YGatTat11B.1.6120.002653
N401D401YGatTat11B.1.6180.004032
N401D401YGatTat11B.1.930.000934
N401D401YGatTat11B.230.002924
N401D401YGatTat11B.280.003279
N401D401YGatTat11B.400.000364
N401D401YGatTat11B.60.00091
N401D401YGatTat11D.20.000075
N401D401YGatTat11P.1.40.000977
N401D401YGatTat11P.1.70.000319
N401D401YGatTat11P.30.001595
N401D401YGatTat11Q.10.000126
N401D401YGatTat11R.10.00009