CoV-GLUE | Mutations | Mutation
Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):
ORF | CodonNum | Mut | ORF1abMut | MutType | RefCodon | MutCodon | AACount | CodonCount | CodonProp | Genome Position |
N | 144 | D144Y | nonsyn | Gat | Tat | 3806 | 3804 | 0.999475 | 28703-28705 | |
N | 144 | D144Y | nonsyn | GaT | TaC | 3806 | 2 | 0.000525486 | 28703-28705 |
Details of the mutation D144Y within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):
ORF | CodonNum | Mut | RefCodon | MutCodon | CodonCount | AACount | Lineage | LineageCodonProp |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 3804 | 3806 | All | 0.000728 |
N | 144 | D144Y | GaT | TaC | 2 | 3806 | All | 0 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 269 | 269 | B.1.617.2 | 0.001013 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 246 | 246 | B.1.427 | 0.012422 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 241 | 241 | AY.4 | 0.000375 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 239 | 239 | B.1.637 | 0.017464 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 219 | 219 | B.1.177.86 | 0.040176 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 150 | 150 | B.1 | 0.001374 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 123 | 123 | B.1.463 | 0.991935 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 108 | 108 | B.1.177 | 0.001422 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 103 | 103 | B.1.351 | 0.003062 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 88 | 88 | AY.26 | 0.002491 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 83 | 83 | B.1.2 | 0.000731 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 74 | 74 | B.1.406 | 0.448485 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 72 | 72 | B.1.351.2 | 0.021785 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 67 | 67 | AY.44 | 0.000408 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 61 | 61 | B.1.160 | 0.001902 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 59 | 59 | AY.61 | 0.006182 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 56 | 56 | B.1.1.216 | 0.049866 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 51 | 51 | B.1.1 | 0.000925 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 50 | 50 | AY.43 | 0.000222 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 49 | 49 | B.1.243 | 0.00341 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 48 | 48 | B.1.177.7 | 0.007913 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 47 | 47 | AY.39 | 0.001161 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 46 | 46 | B.1.526 | 0.001081 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 45 | 45 | B.1.36 | 0.006566 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 42 | 42 | AY.25 | 0.000253 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 38 | 38 | AY.101 | 0.018637 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 33 | 33 | AY.4.2 | 0.000716 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 33 | 33 | B.1.1.70 | 0.011255 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 32 | 32 | B.1.429 | 0.000753 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 31 | 31 | AY.24 | 0.013362 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 31 | 31 | AY.9.2 | 0.001139 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 30 | 30 | AY.103 | 0.000186 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 29 | 29 | B.1.320 | 0.036115 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 28 | 28 | AY.9 | 0.001893 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 28 | 28 | B.1.1.214 | 0.001553 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 25 | 26 | B.1.1.7 | 0.000022 |
N | 144 | D144Y | GaT | TaC | 1 | 26 | B.1.1.7 | 0.000001 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 26 | 26 | B.1.258 | 0.00173 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 25 | 25 | AY.68 | 0.006844 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 24 | 24 | B.1.1.483 | 0.923077 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 24 | 24 | B.1.595 | 0.006263 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 21 | 21 | AY.75.1 | 0.003787 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 17 | 18 | AY.47 | 0.000529 |
N | 144 | D144Y | GaT | TaC | 1 | 18 | AY.47 | 0.000031 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 16 | 16 | AY.3 | 0.000159 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 16 | 16 | B.1.1.164 | 0.082474 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 16 | 16 | B.1.596 | 0.001394 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 15 | 15 | AY.13 | 0.002415 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 14 | 14 | B.1.466.2 | 0.005477 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 13 | 13 | AY.102 | 0.000345 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 13 | 13 | B.1.221 | 0.000923 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 13 | 13 | B.1.621 | 0.001151 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 12 | 12 | B.1.160.24 | 0.053097 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 11 | 11 | AY.9.1 | 0.000921 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 11 | 11 | B.1.213 | 0.164179 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 11 | 11 | B.1.36.18 | 0.004622 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 10 | 10 | AY.34.1 | 0.005099 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 10 | 10 | AY.42 | 0.000402 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 10 | 10 | B | 0.001278 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 10 | 10 | B.1.524 | 0.014065 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 9 | 9 | AY.120 | 0.000335 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 9 | 9 | AY.20 | 0.00035 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 9 | 9 | P.2 | 0.00168 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 8 | 8 | AY.106 | 0.002679 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 8 | 8 | AY.54 | 0.000763 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 8 | 8 | B.1.617.1 | 0.001032 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 7 | 7 | AY.99.2 | 0.000645 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 7 | 7 | B.1.1.284 | 0.000752 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 7 | 7 | B.1.1.434 | 0.00244 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 6 | 6 | AY.16.1 | 0.00282 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 6 | 6 | AY.27 | 0.000388 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 6 | 6 | B.1.1.318 | 0.001811 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 6 | 6 | B.1.517 | 0.002562 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 5 | 5 | A.23.1 | 0.003521 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 5 | 5 | AY.117 | 0.000423 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 5 | 5 | AY.46 | 0.00052 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 5 | 5 | AY.7.1 | 0.000564 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 5 | 5 | B.1.1.269 | 0.006766 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 5 | 5 | B.1.1.302 | 0.010373 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 5 | 5 | B.1.177.83 | 0.007407 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 5 | 5 | B.1.400 | 0.002145 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 5 | 5 | B.1.416 | 0.006345 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 5 | 5 | B.1.468 | 0.028571 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 5 | 5 | C.37 | 0.00058 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 4 | 4 | AY.100 | 0.000184 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 4 | 4 | AY.23 | 0.000279 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 4 | 4 | AY.29 | 0.000063 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 4 | 4 | AY.32 | 0.00213 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 4 | 4 | AY.33 | 0.000267 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 4 | 4 | AY.34 | 0.000388 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 4 | 4 | AY.46.6 | 0.000289 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 4 | 4 | AY.5 | 0.000083 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 4 | 4 | AY.71 | 0.0019 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 4 | 4 | B.1.1.222 | 0.000816 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 4 | 4 | B.1.1.240 | 0.018779 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 4 | 4 | B.1.1.519 | 0.000159 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 4 | 4 | B.1.1.521 | 0.02139 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 4 | 4 | B.1.194 | 0.16 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 4 | 4 | B.1.206 | 0.003263 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 4 | 4 | B.1.258.3 | 0.0067 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 4 | 4 | B.1.362 | 0.006163 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 4 | 4 | B.1.576 | 0.003626 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 4 | 4 | B.1.610 | 0.014184 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 4 | 4 | D.2 | 0.0003 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 3 | 3 | AY.1 | 0.001187 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 3 | 3 | AY.116.1 | 0.000934 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 3 | 3 | AY.119 | 0.000106 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 3 | 3 | AY.16 | 0.001139 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 3 | 3 | AY.39.1 | 0.000119 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 3 | 3 | AY.4.4 | 0.001227 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 3 | 3 | AY.45 | 0.000365 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 3 | 3 | AY.69 | 0.00056 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 3 | 3 | AY.75 | 0.000168 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 3 | 3 | AY.91 | 0.002191 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 3 | 3 | AY.98.1 | 0.000145 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 3 | 3 | B.1.1.25 | 0.001706 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 3 | 3 | B.1.1.28 | 0.000934 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 3 | 3 | B.1.1.306 | 0.001315 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 3 | 3 | B.1.1.47 | 0.016043 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 3 | 3 | B.1.157 | 0.008955 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 3 | 3 | B.1.177.42 | 0.002683 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 3 | 3 | B.1.177.60 | 0.000655 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 3 | 3 | B.1.258.17 | 0.000312 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 3 | 3 | B.1.332 | 0.01049 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 3 | 3 | B.1.367 | 0.002377 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 3 | 3 | B.1.411 | 0.011111 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 3 | 3 | B.1.422 | 0.002437 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 3 | 3 | B.1.438.1 | 0.000322 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 3 | 3 | B.1.499 | 0.003151 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 3 | 3 | B.1.525 | 0.000339 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 3 | 3 | B.1.582 | 0.001472 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 3 | 3 | B.1.609 | 0.001438 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 3 | 3 | B.4 | 0.006623 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 3 | 3 | R.1 | 0.00027 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 2 | 2 | A | 0.000774 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 2 | 2 | A.1 | 0.000564 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 2 | 2 | AY.121 | 0.000271 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 2 | 2 | AY.14 | 0.000176 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 2 | 2 | AY.19 | 0.002281 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 2 | 2 | AY.38 | 0.000999 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 2 | 2 | AY.4.5 | 0.000215 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 2 | 2 | AY.46.4 | 0.000329 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 2 | 2 | AY.59 | 0.001059 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 2 | 2 | AY.6 | 0.000082 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 2 | 2 | AY.70 | 0.000417 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 2 | 2 | AY.74 | 0.000231 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 2 | 2 | AY.81 | 0.003984 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 2 | 2 | AY.90 | 0.001369 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 2 | 2 | AZ.2 | 0.001642 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 2 | 2 | B.1.1.359 | 0.055556 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 2 | 2 | B.1.1.39 | 0.001019 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 2 | 2 | B.1.1.416 | 0.00181 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 2 | 2 | B.1.1.46 | 0.008734 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 2 | 2 | B.1.1.507 | 0.017391 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 2 | 2 | B.1.12 | 0.016 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 2 | 2 | B.1.160.26 | 0.004843 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 2 | 2 | B.1.177.41 | 0.005 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 2 | 2 | B.1.346 | 0.002621 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 2 | 2 | B.1.36.36 | 0.001204 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 2 | 2 | B.1.36.8 | 0.002 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 2 | 2 | B.1.366 | 0.009756 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 2 | 2 | B.1.402 | 0.019608 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 2 | 2 | B.1.466.1 | 0.014388 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 2 | 2 | B.1.540 | 0.019417 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 2 | 2 | B.1.575.1 | 0.004878 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 2 | 2 | B.1.8 | 0.003945 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 2 | 2 | B.3.1 | 0.003317 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 2 | 2 | W.2 | 0.009662 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | A.11 | 0.058824 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | A.2.5 | 0.000499 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | A.5 | 0.001923 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | AD.2 | 0.000219 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | AY.10 | 0.00053 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | AY.110 | 0.000113 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | AY.2 | 0.000356 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | AY.23.1 | 0.000417 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | AY.36 | 0.000148 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | AY.4.2.1 | 0.000149 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | AY.46.1 | 0.001027 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | AY.46.2 | 0.000635 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | AY.46.5 | 0.000198 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | AY.48 | 0.000465 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | AY.52 | 0.000814 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | AY.65 | 0.000533 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | AY.67 | 0.000464 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | AY.72 | 0.001361 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | AY.73 | 0.000665 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | AY.8 | 0.000606 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.1.1 | 0.000327 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.1.159 | 0.004673 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.1.176 | 0.000439 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.1.192 | 0.002309 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.1.201 | 0.02439 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.1.207 | 0.001182 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.1.220 | 0.001859 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.1.225 | 0.007194 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.1.228 | 0.003049 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.1.263 | 0.001558 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.1.291 | 0.000742 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.1.298 | 0.000862 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.1.311 | 0.000358 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.1.312 | 0.001912 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.1.33 | 0.000421 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.1.348 | 0.000796 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.1.354 | 0.004386 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.1.372 | 0.000689 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.1.398 | 0.003226 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.1.407 | 0.041667 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.1.432 | 0.001266 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.1.438 | 0.05 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.1.448 | 0.002033 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.1.464 | 0.001473 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.1.54 | 0.003021 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.111 | 0.001175 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.177.21 | 0.000076 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.177.31 | 0.011494 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.177.4 | 0.000211 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.177.44 | 0.000519 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.177.48 | 0.003125 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.177.57 | 0.000281 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.177.69 | 0.001484 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.177.73 | 0.000566 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.177.75 | 0.001041 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.177.81 | 0.000189 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.177.84 | 0.006667 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.214 | 0.003663 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.232 | 0.000537 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.239 | 0.001221 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.260 | 0.003344 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.265 | 0.001271 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.279 | 0.000514 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.305 | 0.002151 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.338 | 0.008621 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.349 | 0.000715 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.36.10 | 0.004785 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.36.9 | 0.003215 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.361 | 0.001289 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.370 | 0.008 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.391 | 0.001127 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.428.3 | 0.012821 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.439 | 0.005917 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.469 | 0.00361 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.470 | 0.001404 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.471 | 0.002732 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.504 | 0.03125 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.530 | 0.007143 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.532 | 0.006211 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.538 | 0.008065 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.558 | 0.004566 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.560 | 0.00463 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.562 | 0.018519 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.564 | 0.000426 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.574 | 0.002151 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.575 | 0.000303 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.575.2 | 0.004808 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.595.1 | 0.005848 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.595.3 | 0.026316 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.600 | 0.005848 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.602 | 0.006536 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.617.3 | 0.002985 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.618 | 0.004032 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.623 | 0.000536 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.628 | 0.000352 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.3 | 0.000831 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.40 | 0.000364 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | C.1 | 0.002392 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | C.16 | 0.00106 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | C.36 | 0.000911 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | L.2 | 0.011364 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | N.3 | 0.005814 |
N | 144 | D144Y | Gat | Tat | 1 | 1 | P.1.15 | 0.000232 |
CoV-GLUE is still in development. CoV-GLUE was originally developed as part of COG-UK by Josh Singer using the GLUE framework at the MRC-University of Glasgow Centre for Virus Research (CVR). In 2021 it was redeveloped by Richard Orton to scale to the millions of genome sequences available. We acknowledge support from the MRC (MC_UU_12014/12), WT (220977/Z/20/Z) and UKRI G2P (MR/W005611/1). Please contact Richard Orton with any queries: Richard.Orton@glasgow.ac.uk
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