CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = N : CodonNum = 412 & Codon = agT

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
N412S412SsynagCagT120872120872129507-29509

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
N412S412SagCagT120872120872All0.023118
N412S412SagCagT9780297802AY.30.972777
N412S412SagCagT1146411464AY.3.10.977406
N412S412SagCagT15571557B.1.617.20.005863
N412S412SagCagT13321332B.1.1.70.001192
N412S412SagCagT677677AY.110.906292
N412S412SagCagT645645AY.250.00388
N412S412SagCagT627627AY.4.20.013599
N412S412SagCagT598598AY.1170.050541
N412S412SagCagT504504AY.470.015677
N412S412SagCagT477477Q.30.069181
N412S412SagCagT433433AY.920.12439
N412S412SagCagT301301AY.1030.001869
N412S412SagCagT295295AY.440.001796
N412S412SagCagT259259B.1.20.002281
N412S412SagCagT226226AY.40.000352
N412S412SagCagT209209AY.1050.134405
N412S412SagCagT203203AY.840.088801
N412S412SagCagT169169AY.1190.005967
N412S412SagCagT166166AY.5.30.056005
N412S412SagCagT150150AY.430.000665
N412S412SagCagT141141AY.46.60.010181
N412S412SagCagT140140AY.1020.003712
N412S412SagCagT114114AY.420.004586
N412S412SagCagT9191AY.390.002249
N412S412SagCagT9191AY.50.001879
N412S412SagCagT8989AY.1160.025523
N412S412SagCagT8282AY.1100.00924
N412S412SagCagT7676B.10.000696
N412S412SagCagT7272AY.260.002038
N412S412SagCagT5757AY.450.006936
N412S412SagCagT5656AY.98.10.002712
N412S412SagCagT5454B.1.36.160.076923
N412S412SagCagT5454B.1.4270.002727
N412S412SagCagT5353AY.460.005516
N412S412SagCagT4949AY.1180.00307
N412S412SagCagT4949AY.330.003272
N412S412SagCagT4747AY.1130.006692
N412S412SagCagT4646AY.1060.015405
N412S412SagCagT4141P.10.000646
N412S412SagCagT4040AY.230.00279
N412S412SagCagT3838AY.730.025283
N412S412SagCagT3636AY.790.043584
N412S412SagCagT3434B.1.177.730.019253
N412S412SagCagT3333AY.620.014379
N412S412SagCagT3333AY.950.025114
N412S412SagCagT3232AY.820.043419
N412S412SagCagT3131AY.990.032529
N412S412SagCagT3030AY.550.027523
N412S412SagCagT3030C.370.003482
N412S412SagCagT2929AY.1000.001334
N412S412SagCagT2727B.1.1770.000356
N412S412SagCagT2424B0.003067
N412S412SagCagT2323AY.46.10.023614
N412S412SagCagT2323AY.980.001817
N412S412SagCagT2323B.1.10.000417
N412S412SagCagT2323B.1.1.4860.036278
N412S412SagCagT2222AY.540.002098
N412S412SagCagT2121AY.1140.004853
N412S412SagCagT2020AY.850.008543
N412S412SagCagT1919AY.930.005188
N412S412SagCagT1919AY.960.039419
N412S412SagCagT1919B.1.4050.234568
N412S412SagCagT1919B.1.5260.000447
N412S412SagCagT1818AY.910.013148
N412S412SagCagT1818B.1.177.840.12
N412S412SagCagT1818B.1.466.20.007042
N412S412SagCagT1717B.1.1.4640.025037
N412S412SagCagT1717B.1.2430.001183
N412S412SagCagT1616AY.200.000622
N412S412SagCagT1616AY.340.001551
N412S412SagCagT1616AY.880.014147
N412S412SagCagT1515AY.900.010267
N412S412SagCagT1414AY.1200.000521
N412S412SagCagT1414B.1.1.5190.000556
N412S412SagCagT1313AY.370.004109
N412S412SagCagT1212AY.130.001932
N412S412SagCagT1212AY.34.10.006119
N412S412SagCagT1212AY.590.006356
N412S412SagCagT1212AY.750.000672
N412S412SagCagT1212Q.10.001516
N412S412SagCagT1111AY.39.10.000436
N412S412SagCagT1111B.1.177.350.007602
N412S412SagCagT1010AY.99.20.000922
N412S412SagCagT1010B.1.3510.000297
N412S412SagCagT99AY.290.000142
N412S412SagCagT99AY.320.004792
N412S412SagCagT99AY.580.008167
N412S412SagCagT99AY.70.001764
N412S412SagCagT99AY.710.004276
N412S412SagCagT99B.1.4970.002833
N412S412SagCagT88AY.380.003994
N412S412SagCagT88AY.410.002352
N412S412SagCagT88AY.630.003095
N412S412SagCagT88AY.690.001493
N412S412SagCagT88B.1.1600.00025
N412S412SagCagT77AY.1080.007718
N412S412SagCagT77AY.46.20.004447
N412S412SagCagT77AY.46.40.001152
N412S412SagCagT77AY.9.20.000257
N412S412SagCagT77B.1.4290.000165
N412S412SagCagT77B.1.5960.00061
N412S412SagCagT77B.6.60.006222
N412S412SagCagT66AY.610.000629
N412S412SagCagT66AY.740.000694
N412S412SagCagT66B.1.1.2220.001224
N412S412SagCagT55AY.1110.000916
N412S412SagCagT55AY.680.001369
N412S412SagCagT55B.1.1.3170.002058
N412S412SagCagT55B.1.1.630.001929
N412S412SagCagT55B.1.2210.000355
N412S412SagCagT55B.1.2580.000333
N412S412SagCagT55D.20.000375
N412S412SagCagT44AY.1090.002959
N412S412SagCagT44AY.4.2.10.000596
N412S412SagCagT44AY.4.30.003367
N412S412SagCagT44AY.530.00115
N412S412SagCagT44AY.60.000165
N412S412SagCagT44AY.75.10.000721
N412S412SagCagT44B.1.1.2140.000222
N412S412SagCagT44B.1.1.3120.007648
N412S412SagCagT44B.1.1.330.001684
N412S412SagCagT44B.1.1110.0047
N412S412SagCagT44B.1.177.420.003578
N412S412SagCagT44C.36.30.002269
N412S412SagCagT44P.1.20.004624
N412S412SagCagT44P.20.000747
N412S412SagCagT33AY.100.00159
N412S412SagCagT33AY.1210.000406
N412S412SagCagT33AY.4.50.000322
N412S412SagCagT33AY.5.40.00083
N412S412SagCagT33AY.570.001969
N412S412SagCagT33AY.640.001786
N412S412SagCagT33B.1.1.10.00098
N412S412SagCagT33B.1.1.280.000934
N412S412SagCagT33B.1.1.370.000579
N412S412SagCagT33B.1.1390.002199
N412S412SagCagT33B.1.3690.000856
N412S412SagCagT33B.1.5170.001281
N412S412SagCagT33B.1.5250.000339
N412S412SagCagT33B.1.6210.000266
N412S412SagCagT33Q.80.000495
N412S412SagCagT22A.2.50.000998
N412S412SagCagT22A.23.10.001408
N412S412SagCagT22AY.29.10.000441
N412S412SagCagT22AY.480.00093
N412S412SagCagT22AY.670.000929
N412S412SagCagT22AY.7.10.000225
N412S412SagCagT22AY.7.20.001119
N412S412SagCagT22AY.90.000135
N412S412SagCagT22AY.9.10.000167
N412S412SagCagT22B.1.1.100.00223
N412S412SagCagT22B.1.1.3010.002358
N412S412SagCagT22B.1.1.3290.007692
N412S412SagCagT22B.1.1.3980.006452
N412S412SagCagT22B.1.1.4200.002012
N412S412SagCagT22B.1.2340.000264
N412S412SagCagT22B.1.360.000292
N412S412SagCagT22B.1.36.290.001035
N412S412SagCagT22B.1.438.10.000215
N412S412SagCagT22B.1.4530.006472
N412S412SagCagT22B.1.4740.003802
N412S412SagCagT22B.1.5600.009259
N412S412SagCagT22B.1.575.10.004878
N412S412SagCagT22B.1.5760.001813
N412S412SagCagT22B.1.5880.00182
N412S412SagCagT22B.1.6040.034483
N412S412SagCagT22B.1.6190.001742
N412S412SagCagT22B.1.6280.000705
N412S412SagCagT22C.360.001821
N412S412SagCagT11A.190.009434
N412S412SagCagT11AD.20.000219
N412S412SagCagT11AY.10.000396
N412S412SagCagT11AY.1010.00049
N412S412SagCagT11AY.1070.000466
N412S412SagCagT11AY.120.10.000321
N412S412SagCagT11AY.120.2.10.000498
N412S412SagCagT11AY.140.000088
N412S412SagCagT11AY.160.00038
N412S412SagCagT11AY.240.000431
N412S412SagCagT11AY.350.000233
N412S412SagCagT11AY.46.30.000934
N412S412SagCagT11AY.520.000814
N412S412SagCagT11AY.650.000533
N412S412SagCagT11AY.700.000209
N412S412SagCagT11AY.870.000833
N412S412SagCagT11AY.890.004902
N412S412SagCagT11AZ.30.00152
N412S412SagCagT11B.1.1.1530.001095
N412S412SagCagT11B.1.1.1740.003378
N412S412SagCagT11B.1.1.250.000569
N412S412SagCagT11B.1.1.2580.003257
N412S412SagCagT11B.1.1.2730.006757
N412S412SagCagT11B.1.1.3060.000438
N412S412SagCagT11B.1.1.3510.002793
N412S412SagCagT11B.1.1.3540.004386
N412S412SagCagT11B.1.1.3680.003086
N412S412SagCagT11B.1.1.3690.000446
N412S412SagCagT11B.1.1.4090.002833
N412S412SagCagT11B.1.1.4340.000349
N412S412SagCagT11B.1.1.510.001718
N412S412SagCagT11B.1.1570.002985
N412S412SagCagT11B.1.160.160.000929
N412S412SagCagT11B.1.160.290.004219
N412S412SagCagT11B.1.177.210.000076
N412S412SagCagT11B.1.177.330.001645
N412S412SagCagT11B.1.177.430.001477
N412S412SagCagT11B.1.177.440.000519
N412S412SagCagT11B.1.177.540.000606
N412S412SagCagT11B.1.177.570.000281
N412S412SagCagT11B.1.177.600.000218
N412S412SagCagT11B.1.177.70.000165
N412S412SagCagT11B.1.177.790.002342
N412S412SagCagT11B.1.177.810.000189
N412S412SagCagT11B.1.2060.000816
N412S412SagCagT11B.1.214.20.0006
N412S412SagCagT11B.1.2400.000216
N412S412SagCagT11B.1.351.50.0006
N412S412SagCagT11B.1.36.180.00042
N412S412SagCagT11B.1.36.80.001
N412S412SagCagT11B.1.3620.001541
N412S412SagCagT11B.1.4280.00102
N412S412SagCagT11B.1.4360.001029
N412S412SagCagT11B.1.4690.00361
N412S412SagCagT11B.1.4700.001404
N412S412SagCagT11B.1.4850.014925
N412S412SagCagT11B.1.5090.000866
N412S412SagCagT11B.1.5460.003704
N412S412SagCagT11B.1.5640.000426
N412S412SagCagT11B.1.5800.004065
N412S412SagCagT11B.1.5860.010989
N412S412SagCagT11B.1.6000.005848
N412S412SagCagT11B.1.617.10.000129
N412S412SagCagT11B.1.6200.000946
N412S412SagCagT11B.1.6230.000536
N412S412SagCagT11B.1.6250.002353
N412S412SagCagT11B.1.6370.000073
N412S412SagCagT11B.1.780.008547
N412S412SagCagT11B.1.80.001972
N412S412SagCagT11B.280.003279
N412S412SagCagT11B.40.002208
N412S412SagCagT11B.400.000364
N412S412SagCagT11B.520.010101
N412S412SagCagT11C.1.10.076923
N412S412SagCagT11C.180.002591
N412S412SagCagT11N.50.001767
N412S412SagCagT11P.1.140.000048
N412S412SagCagT11P.1.150.000232
N412S412SagCagT11P.1.40.000977
N412S412SagCagT11Q.50.016949
N412S412SagCagT11R.10.00009