CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = N : CodonNum = 367

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
N367E367EsyngaGgaA19741974129372-29374
N367E367DnonsyngaGgaT7777520.96782529372-29374
N367E367DnonsyngaGgaC777250.03217529372-29374
N367E367QnonsynGagCag4504300.95555629372-29374
N367E367QnonsynGaGCaA450200.044444429372-29374
N367E367GnonsyngAggGg2732660.97435929372-29374
N367E367GnonsyngAGgGA27340.01465229372-29374
N367E367GnonsyngAGgGT27330.01098929372-29374
N367E367KnonsynGagAag81410.50617329372-29374
N367E367KnonsynGaGAaA81400.49382729372-29374
N367E367deldelGAG---6565129372-29374
N367E367VnonsyngAggTg53480.9056629372-29374
N367E367VnonsyngAGgTA5330.056603829372-29374
N367E367VnonsyngAGgTT5320.037735829372-29374
N367E367AnonsyngAggCg50410.8229372-29374
N367E367AnonsyngAGgCA5060.1229372-29374
N367E367AnonsyngAGgCC5020.0429372-29374
N367E367AnonsyngAGgCT5010.0229372-29374
N367E367XnonsynGagTag35220.62857129372-29374
N367E367TnonsynGAGACA35180.51428629372-29374
N367E367XnonsynGaGTaA35130.37142929372-29374
N367E367TnonsynGAGACT3560.17142929372-29374
N367E367TnonsynGAGACC3560.17142929372-29374
N367E367TnonsynGAgACg3550.14285729372-29374
N367E367InonsynGAGATA32170.5312529372-29374
N367E367InonsynGAGATT32100.312529372-29374
N367E367InonsynGAGATC3250.1562529372-29374
N367E367NnonsynGaGAaT29170.58620729372-29374
N367E367NnonsynGaGAaC29120.41379329372-29374
N367E367LnonsynGAGTTA26100.38461529372-29374
N367E367LnonsynGAGCTA2660.23076929372-29374
N367E367LnonsynGAGCTT2640.15384629372-29374
N367E367LnonsynGAgTTg2640.15384629372-29374
N367E367LnonsynGAgCTg2610.038461529372-29374
N367E367LnonsynGAGCTC2610.038461529372-29374
N367E367PnonsynGAGCCA21110.5238129372-29374
N367E367PnonsynGAGCCC2140.19047629372-29374
N367E367PnonsynGAgCCg2130.14285729372-29374
N367E367PnonsynGAGCCT2130.14285729372-29374
N367E367YnonsynGaGTaC1470.529372-29374
N367E367YnonsynGaGTaT1470.529372-29374
N367E367HnonsynGaGCaT1380.61538529372-29374
N367E367HnonsynGaGCaC1350.38461529372-29374
N367E367FnonsynGAGTTT1060.629372-29374
N367E367FnonsynGAGTTC1040.429372-29374
N367E367del2delgAGg--99129372-29374
N367E367del1delGag-ag830.37529372-29374
N367E367del1delgAGg-N820.2529372-29374
N367E367del1delGAG-NN820.2529372-29374
N367E367del1delgAGgG-810.12529372-29374
N367E367SnonsynGAGTCA630.529372-29374
N367E367SnonsynGAGTCC630.529372-29374
N367E367MnonsynGAgATg55129372-29374
N367E367RnonsynGAgAGg33129372-29374
N367E367WnonsynGAgTGg11129372-29374

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
N367E367EgaGgaA19741974All0.000378
N367E367DgaGgaT752777All0.000144
N367E367DgaGgaC25777All0.000005
N367E367QGagCag430450All0.000082
N367E367QGaGCaA20450All0.000004
N367E367EgaGgaA421421B.1.20.003707
N367E367GgAggGg266273All0.000051
N367E367GgAGgGA4273All0.000001
N367E367GgAGgGT3273All0.000001
N367E367EgaGgaA237237B.1.1.70.000212
N367E367EgaGgaA222222AY.9.10.018587
N367E367QGagCag156174B.1.1.70.00014
N367E367QGaGCaA18174B.1.1.70.000016
N367E367DgaGgaT162166B.1.1.70.000145
N367E367DgaGgaC4166B.1.1.70.000004
N367E367QGagCag161161B.1.6180.649194
N367E367DgaGgaT148148B.1.617.20.000557
N367E367EgaGgaA146146P.10.0023
N367E367DgaGgaT133133B.1.5561
N367E367EgaGgaA9292AY.40.000143
N367E367GgAggGg9191B.1.360.013277
N367E367KGagAag4181All0.000008
N367E367KGaGAaA4081All0.000008
N367E367DgaGgaT7878AY.350.018178
N367E367delGAG---6565All0.000012
N367E367EgaGgaA6262B.1.617.20.000233
N367E367EgaGgaA6060B.4.61
N367E367EgaGgaA5858AY.1030.00036
N367E367EgaGgaA5555AY.430.000244
N367E367VgAggTg4853All0.000009
N367E367VgAGgTA353All0.000001
N367E367VgAGgTT253All0
N367E367AgAggCg4150All0.000008
N367E367AgAGgCA650All0.000001
N367E367AgAGgCC250All0
N367E367AgAGgCT150All0
N367E367EgaGgaA4747AY.440.000286
N367E367KGaGAaA3546B.1.1.70.000031
N367E367KGagAag1146B.1.1.70.00001
N367E367EgaGgaA4242AY.1000.001932
N367E367EgaGgaA4040AY.30.000398
N367E367EgaGgaA3636B.10.00033
N367E367XGagTag2235All0.000004
N367E367TGAGACA1835All0.000003
N367E367XGaGTaA1335All0.000002
N367E367TGAGACC635All0.000001
N367E367TGAGACT635All0.000001
N367E367TGAgACg535All0.000001
N367E367EgaGgaA3434AY.250.000205
N367E367EgaGgaA3333B.1.1.3770.04558
N367E367IGAGATA1732All0.000003
N367E367IGAGATT1032All0.000002
N367E367IGAGATC532All0.000001
N367E367TGAGACA1631B.1.1.70.000014
N367E367TGAGACT631B.1.1.70.000005
N367E367TGAgACg531B.1.1.70.000004
N367E367TGAGACC431B.1.1.70.000004
N367E367IGAGATA1630B.1.1.70.000014
N367E367IGAGATT930B.1.1.70.000008
N367E367IGAGATC530B.1.1.70.000004
N367E367NGaGAaT1729All0.000003
N367E367NGaGAaC1229All0.000002
N367E367LGAGTTA1026All0.000002
N367E367LGAGCTA626All0.000001
N367E367LGAgTTg426All0.000001
N367E367LGAGCTT426All0.000001
N367E367LGAgCTg126All0
N367E367LGAGCTC126All0
N367E367NGaGAaT1626B.1.1.70.000014
N367E367NGaGAaC1026B.1.1.70.000009
N367E367EgaGgaA2525AY.390.000618
N367E367DgaGgaT2525AY.40.000039
N367E367LGAGTTA1024B.1.1.70.000009
N367E367LGAGCTA524B.1.1.70.000004
N367E367LGAgTTg424B.1.1.70.000004
N367E367LGAGCTT324B.1.1.70.000003
N367E367LGAgCTg124B.1.1.70.000001
N367E367LGAGCTC124B.1.1.70.000001
N367E367DgaGgaT2222AY.430.000097
N367E367PGAGCCA1121All0.000002
N367E367PGAGCCC421All0.000001
N367E367PGAGCCT321All0.000001
N367E367PGAgCCg321All0.000001
N367E367EgaGgaA2121B.1.1.2840.002255
N367E367GgAggGg2121B.1.1.70.000019
N367E367PGAGCCA1121B.1.1.70.00001
N367E367PGAGCCC421B.1.1.70.000004
N367E367PGAGCCT321B.1.1.70.000003
N367E367PGAgCCg321B.1.1.70.000003
N367E367DgaGgaT1919B.1.1600.000593
N367E367EgaGgaA1919B.1.2210.00135
N367E367AgAggCg1818B.1.2580.001198
N367E367QGagCag1616AY.430.000071
N367E367XGaGTaA1115B.1.1.70.00001
N367E367XGagTag415B.1.1.70.000004
N367E367EgaGgaA1515B.1.1770.000198
N367E367YGaGTaC714All0.000001
N367E367YGaGTaT714All0.000001
N367E367EgaGgaA1414AY.1190.000494
N367E367GgAggGg1414B.1.2580.000932
N367E367QGagCag1414B.1.4290.000329
N367E367GgAggGg1414C.10.033493
N367E367EgaGgaA1414P.1.140.000669
N367E367HGaGCaT813All0.000002
N367E367HGaGCaC513All0.000001
N367E367EgaGgaA1212B.1.10.000218
N367E367HGaGCaT712B.1.1.70.000006
N367E367HGaGCaC512B.1.1.70.000004
N367E367GgAggGg1212B.1.1490.041096
N367E367EgaGgaA1212B.1.438.10.001287
N367E367EgaGgaA1212B.1.5960.001046
N367E367EgaGgaA1111AY.260.000311
N367E367QGagCag1111AY.4.20.000239
N367E367AgAggCg711B.1.1.70.000006
N367E367YGaGTaT611B.1.1.70.000005
N367E367YGaGTaC511B.1.1.70.000004
N367E367AgAGgCA311B.1.1.70.000003
N367E367AgAGgCT111B.1.1.70.000001
N367E367DgaGgaT1111B.1.1770.000145
N367E367EgaGgaA1111B.1.5260.000259
N367E367delGAG---1111B.1.6210.000974
N367E367QGagCag1111P.10.000173
N367E367FGAGTTT610All0.000001
N367E367FGAGTTC410All0.000001
N367E367DgaGgaT1010AY.1020.000265
N367E367DgaGgaT1010AY.1180.000626
N367E367GgAggGg1010B.10.000092
N367E367EgaGgaA1010B.1.1.5190.000397
N367E367FGAGTTT610B.1.1.70.000005
N367E367FGAGTTC410B.1.1.70.000004
N367E367DgaGgaT510B.1.20.000044
N367E367DgaGgaC510B.1.20.000044
N367E367VgAggTg1010C.10.023923
N367E367QGagCag99A.2.50.004491
N367E367del2gAGg--99All0.000002
N367E367EgaGgaA99AY.1170.000761
N367E367VgAggTg49B.1.1.70.000004
N367E367VgAGgTA39B.1.1.70.000003
N367E367VgAGgTT29B.1.1.70.000002
N367E367DgaGgaT99B.1.177.120.001365
N367E367EgaGgaA99B.1.177.430.013294
N367E367GgAggGg99B.1.20.000079
N367E367EgaGgaA99B.1.2580.000599
N367E367EgaGgaA99B.1.3510.000268
N367E367GgAggGg79B.1.617.20.000026
N367E367GgAGgGA19B.1.617.20.000004
N367E367GgAGgGT19B.1.617.20.000004
N367E367del1Gag-ag38All0.000001
N367E367del1GAG-NN28All0
N367E367del1gAGg-N28All0
N367E367del1gAGgG-18All0
N367E367DgaGgaT88AY.440.000049
N367E367DgaGgaT78AY.9.20.000257
N367E367DgaGgaC18AY.9.20.000037
N367E367KGagAag88B.10.000073
N367E367delGAG---88B.1.1.70.000007
N367E367QGagCag88B.1.6210.000708
N367E367EgaGgaA77AY.1020.000186
N367E367DgaGgaT77B.1.10.000127
N367E367GgAggGg77B.1.2430.000487
N367E367KGagAag77B.1.5760.006346
N367E367EgaGgaA77C.370.000812
N367E367SGAGTCC36All0.000001
N367E367SGAGTCA36All0.000001
N367E367EgaGgaA66AY.50.000124
N367E367EgaGgaA66B.1.1.2180.046154
N367E367EgaGgaA66B.1.1.370.001157
N367E367delGAG---66B.1.1770.000079
N367E367GgAggGg46B.1.617.10.000516
N367E367GgAGgGT16B.1.617.10.000129
N367E367GgAGgGA16B.1.617.10.000129
N367E367EgaGgaA66B.40.013245
N367E367MGAgATg55All0.000001
N367E367DgaGgaT55AY.16.10.00235
N367E367EgaGgaA55AY.46.40.000823
N367E367DgaGgaC55AY.9.10.000419
N367E367delGAG---55AY.920.001436
N367E367VgAggTg55B.10.000046
N367E367delGAG---55B.1.10.000091
N367E367GgAggGg55B.1.10.000091
N367E367KGagAag55B.1.1.3720.003444
N367E367GgAggGg55B.1.3290.003038
N367E367QGagCag55B.1.36.290.002587
N367E367EgaGgaA55B.1.5640.002129
N367E367delGAG---55C.370.00058
N367E367GgAggGg55C.37.10.013089
N367E367GgAggGg44AY.1030.000025
N367E367GgAggGg44AY.430.000018
N367E367EgaGgaA44AY.98.10.000194
N367E367XGagTag44B.10.000037
N367E367delGAG---44B.10.000037
N367E367EgaGgaA44B.1.1.250.002274
N367E367VgAggTg44B.1.1.4480.00813
N367E367GgAggGg44B.1.1.520.04878
N367E367MGAgATg44B.1.1.70.000004
N367E367QGagCag44B.1.1600.000125
N367E367DgaGgaT44B.1.177.440.002076
N367E367AgAggCg44B.1.177.830.005926
N367E367QGagCag44B.1.20.000035
N367E367del1Gag-ag24B.1.20.000018
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