CoV-GLUE | Mutations | Mutation
Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):
ORF | CodonNum | Mut | ORF1abMut | MutType | RefCodon | MutCodon | AACount | CodonCount | CodonProp | Genome Position |
N | 215 | G215C | nonsyn | Ggt | Tgt | 2396067 | 2395920 | 0.999939 | 28916-28918 | |
N | 215 | G215C | nonsyn | GgT | TgC | 2396067 | 147 | 0.0000613505 | 28916-28918 | |
N | 215 | G215del | del | GGT | --- | 3328 | 3328 | 1 | 28916-28918 | |
N | 215 | G215S | nonsyn | Ggt | Agt | 1034 | 832 | 0.804642 | 28916-28918 | |
N | 215 | G215S | nonsyn | GGt | TCt | 1034 | 200 | 0.193424 | 28916-28918 | |
N | 215 | G215S | nonsyn | GgT | AgC | 1034 | 2 | 0.00193424 | 28916-28918 | |
N | 215 | G215V | nonsyn | gGt | gTt | 595 | 594 | 0.998319 | 28916-28918 | |
N | 215 | G215V | nonsyn | gGT | gTG | 595 | 1 | 0.00168067 | 28916-28918 | |
N | 215 | G215G | syn | ggT | ggC | 553 | 519 | 0.938517 | 28916-28918 | |
N | 215 | G215G | syn | ggT | ggA | 553 | 24 | 0.0433996 | 28916-28918 | |
N | 215 | G215G | syn | ggT | ggG | 553 | 10 | 0.0180832 | 28916-28918 | |
N | 215 | G215F | nonsyn | GGt | TTt | 355 | 355 | 1 | 28916-28918 | |
N | 215 | G215Y | nonsyn | GGt | TAt | 184 | 184 | 1 | 28916-28918 | |
N | 215 | G215D | nonsyn | gGt | gAt | 98 | 98 | 1 | 28916-28918 | |
N | 215 | G215A | nonsyn | gGt | gCt | 33 | 33 | 1 | 28916-28918 | |
N | 215 | G215N | nonsyn | GGT | AAC | 28 | 15 | 0.535714 | 28916-28918 | |
N | 215 | G215N | nonsyn | GGt | AAt | 28 | 13 | 0.464286 | 28916-28918 | |
N | 215 | G215del1 | del | Ggt | -gt | 27 | 23 | 0.851852 | 28916-28918 | |
N | 215 | G215del1 | del | GGt | -Nt | 27 | 2 | 0.0740741 | 28916-28918 | |
N | 215 | G215del1 | del | GGt | -Tt | 27 | 1 | 0.037037 | 28916-28918 | |
N | 215 | G215del1 | del | GgT | Tg- | 27 | 1 | 0.037037 | 28916-28918 | |
N | 215 | G215del2 | del | GGt | --t | 22 | 21 | 0.954545 | 28916-28918 | |
N | 215 | G215del2 | del | GGT | --N | 22 | 1 | 0.0454545 | 28916-28918 | |
N | 215 | G215R | nonsyn | Ggt | Cgt | 17 | 17 | 1 | 28916-28918 | |
N | 215 | G215P | nonsyn | GGT | CCC | 1 | 1 | 1 | 28916-28918 | |
N | 215 | G215X | nonsyn | GgT | TgA | 1 | 1 | 1 | 28916-28918 |
Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):
ORF | CodonNum | Mut | RefCodon | MutCodon | CodonCount | AACount | Lineage | LineageCodonProp |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 2395920 | 2396067 | All | 0.458248 |
N | 215 | G215C | GgT | TgC | 147 | 2396067 | All | 0.000028 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 637679 | 637685 | AY.4 | 0.992498 |
N | 215 | G215C | GgT | TgC | 6 | 637685 | AY.4 | 0.000009 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 222588 | 222605 | B.1.617.2 | 0.838136 |
N | 215 | G215C | GgT | TgC | 17 | 222605 | B.1.617.2 | 0.000064 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 216579 | 216584 | AY.43 | 0.959545 |
N | 215 | G215C | GgT | TgC | 5 | 216584 | AY.43 | 0.000022 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 165134 | 165136 | AY.25 | 0.993251 |
N | 215 | G215C | GgT | TgC | 2 | 165136 | AY.25 | 0.000012 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 161462 | 161467 | AY.44 | 0.982781 |
N | 215 | G215C | GgT | TgC | 5 | 161467 | AY.44 | 0.00003 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 159627 | 159632 | AY.103 | 0.991133 |
N | 215 | G215C | GgT | TgC | 5 | 159632 | AY.103 | 0.000031 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 94926 | 94928 | AY.3 | 0.944171 |
N | 215 | G215C | GgT | TgC | 2 | 94928 | AY.3 | 0.00002 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 63345 | 63347 | AY.29 | 0.99918 |
N | 215 | G215C | GgT | TgC | 2 | 63347 | AY.29 | 0.000032 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 47256 | 47264 | AY.5 | 0.975799 |
N | 215 | G215C | GgT | TgC | 8 | 47264 | AY.5 | 0.000165 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 45947 | 45947 | AY.4.2 | 0.99653 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 39574 | 39578 | AY.39 | 0.977933 |
N | 215 | G215C | GgT | TgC | 4 | 39578 | AY.39 | 0.000099 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 37477 | 37507 | AY.102 | 0.993663 |
N | 215 | G215C | GgT | TgC | 30 | 37507 | AY.102 | 0.000795 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 27688 | 27688 | AY.119 | 0.977615 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 26665 | 26665 | AY.120 | 0.991375 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 25602 | 25602 | AY.20 | 0.995025 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 24838 | 24839 | AY.39.1 | 0.983917 |
N | 215 | G215C | GgT | TgC | 1 | 24839 | AY.39.1 | 0.00004 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 24423 | 24423 | AY.42 | 0.98254 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 24205 | 24206 | AY.6 | 0.995517 |
N | 215 | G215C | GgT | TgC | 1 | 24206 | AY.6 | 0.000041 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 21432 | 21432 | AY.100 | 0.986014 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 20135 | 20135 | AY.98.1 | 0.975155 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 15724 | 15724 | AY.118 | 0.98509 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 14741 | 14741 | AY.33 | 0.984374 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 13609 | 13609 | AY.46.6 | 0.98267 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 13205 | 13205 | AY.23 | 0.921043 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 12426 | 12426 | AY.98 | 0.981594 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 11661 | 11661 | AY.117 | 0.985548 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 11032 | 11032 | AY.3.1 | 0.940575 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 10725 | 10725 | AY.99.2 | 0.988388 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 10190 | 10244 | AY.34 | 0.988073 |
N | 215 | G215C | GgT | TgC | 54 | 10244 | AY.34 | 0.005236 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 9343 | 9344 | AY.46 | 0.972419 |
N | 215 | G215C | GgT | TgC | 1 | 9344 | AY.46 | 0.000104 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 9236 | 9236 | AY.4.5 | 0.992798 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 8823 | 8823 | AY.7.1 | 0.994365 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 7748 | 7748 | AY.45 | 0.942808 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 7301 | 7301 | AY.121 | 0.987957 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 6830 | 6831 | AY.113 | 0.972519 |
N | 215 | G215C | GgT | TgC | 1 | 6831 | AY.113 | 0.000142 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 6659 | 6659 | AY.36 | 0.986957 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 6621 | 6621 | AY.4.2.1 | 0.986442 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 6059 | 6060 | AY.46.4 | 0.99671 |
N | 215 | G215C | GgT | TgC | 1 | 6060 | AY.46.4 | 0.000165 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 5452 | 5452 | AY.111 | 0.998535 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 5074 | 5074 | AY.7 | 0.994512 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 5039 | 5039 | AY.46.5 | 0.999802 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 4533 | 4533 | AY.29.1 | 0.999559 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 4280 | 4280 | AY.114 | 0.989138 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 4168 | 4168 | AY.110 | 0.469687 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 3566 | 3566 | AY.93 | 0.973785 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 3532 | 3533 | AY.5.4 | 0.97731 |
N | 215 | G215C | GgT | TgC | 1 | 3533 | AY.5.4 | 0.000277 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 3353 | 3353 | AY.116 | 0.961572 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 3328 | 3328 | All | 0.000637 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 3327 | 3327 | AY.41 | 0.977954 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 3191 | 3191 | AY.116.1 | 0.993771 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 3087 | 3087 | AY.120.1 | 0.991011 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 3024 | 3024 | AY.92 | 0.868716 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 2920 | 2921 | AY.12 | 0.922882 |
N | 215 | G215C | GgT | TgC | 1 | 2921 | AY.12 | 0.000316 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 2919 | 2919 | AY.5.3 | 0.984818 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 2709 | 2709 | AY.9.2 | 0.0995 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 2501 | 2501 | AY.1 | 0.989711 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 2415 | 2415 | AY.4.4 | 0.988134 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 2396 | 2396 | AY.23.1 | 1 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 2324 | 2324 | AY.106 | 0.778299 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 2296 | 2296 | AY.85 | 0.980777 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 2265 | 2265 | AY.84 | 0.990814 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 2224 | 2224 | AY.94 | 0.984506 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 2135 | 2135 | AY.107 | 0.994874 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 1987 | 1987 | AY.101 | 0.974497 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 1960 | 1960 | AY.120.2.1 | 0.976582 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 1952 | 1952 | AY.34.1 | 0.995411 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 1828 | 1828 | AY.32 | 0.973376 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 1778 | 1778 | AY.7.2 | 0.994407 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 1507 | 1507 | AY.46.2 | 0.957433 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 1457 | 1457 | AY.105 | 0.936977 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 1440 | 1440 | AY.90 | 0.985626 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 1379 | 1379 | AY.39.1.1 | 0.999275 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 1346 | 1346 | AY.4.1 | 0.992625 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 1345 | 1345 | AY.109 | 0.994822 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 1330 | 1330 | AY.91 | 0.971512 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 1217 | 1217 | AY.95 | 0.92618 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 1180 | 1180 | AY.87 | 0.982515 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 1164 | 1164 | AY.4.3 | 0.979798 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 1161 | 1161 | AY.86 | 0.963485 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 1103 | 1103 | AY.88 | 0.975243 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 1071 | 1071 | AY.46.3 | 1 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 832 | 1034 | All | 0.000159 |
N | 215 | G215S | GGt | TCt | 200 | 1034 | All | 0.000038 |
N | 215 | G215S | GgT | AgC | 2 | 1034 | All | 0 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 994 | 994 | B.1.617.2 | 0.003743 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 965 | 965 | AY.46.1 | 0.99076 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 923 | 923 | AY.47 | 0.02871 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 868 | 868 | AY.80 | 0.979684 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 861 | 861 | AY.99 | 0.903463 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 821 | 821 | AY.79 | 0.993947 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 818 | 818 | AY.77 | 0.92221 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 765 | 765 | AY.108 | 0.84344 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 735 | 735 | AY.82 | 0.997286 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 714 | 714 | AY.120.2 | 0.917738 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 648 | 648 | AY.39.2 | 0.998459 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 639 | 639 | AY.99.1 | 0.992236 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 611 | 611 | AY.78 | 0.941448 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 610 | 610 | AY.73 | 0.405855 |
N | 215 | G215V | gGt | gTt | 594 | 595 | All | 0.000114 |
N | 215 | G215V | gGT | gTG | 1 | 595 | All | 0 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 577 | 577 | AY.83 | 0.994828 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 563 | 563 | AY.97 | 0.957483 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 561 | 561 | AY.75 | 0.031429 |
N | 215 | G215G | ggT | ggC | 519 | 553 | All | 0.000099 |
N | 215 | G215G | ggT | ggA | 24 | 553 | All | 0.000005 |
N | 215 | G215G | ggT | ggG | 10 | 553 | All | 0.000002 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 499 | 499 | AY.104 | 0.990079 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 489 | 489 | AY.81 | 0.974104 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 469 | 469 | AY.21 | 0.889943 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 469 | 469 | AY.22 | 0.981172 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 453 | 453 | AY.55 | 0.415596 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 404 | 404 | AY.5.2 | 0.995074 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 398 | 398 | AY.119 | 0.014053 |
N | 215 | G215G | ggT | ggC | 393 | 393 | AY.51 | 0.357273 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 383 | 383 | AY.74 | 0.044293 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 375 | 375 | AY.96 | 0.778008 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 363 | 363 | AY.68 | 0.09937 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 360 | 360 | B.1 | 0.003297 |
N | 215 | G215F | GGt | TTt | 355 | 355 | All | 0.000068 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 355 | 355 | AY.4 | 0.000553 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 337 | 337 | AY.26 | 0.009541 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 315 | 315 | AY.54 | 0.030034 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 284 | 284 | AY.19 | 0.323831 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 266 | 266 | AY.5.1 | 1 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 257 | 257 | AY.59 | 0.136123 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 246 | 246 | AY.91.1 | 1 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 240 | 240 | AY.43 | 0.001063 |
N | 215 | G215V | gGt | gTt | 234 | 234 | B.1.146 | 0.991525 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 233 | 233 | AY.53 | 0.066993 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 225 | 225 | AY.58 | 0.204174 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 205 | 205 | AY.76 | 0.990338 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 203 | 203 | AY.89 | 0.995098 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 195 | 195 | AY.103 | 0.001211 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 188 | 188 | AY.62 | 0.081917 |
N | 215 | G215Y | GGt | TAt | 184 | 184 | All | 0.000035 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 183 | 183 | AY.69 | 0.034161 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 180 | 180 | AY.115 | 0.9375 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 174 | 174 | B.1.1.7 | 0.000156 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 170 | 170 | AY.64 | 0.10119 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 164 | 164 | AY.67 | 0.076137 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 161 | 161 | AY.52 | 0.131107 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 160 | 160 | AY.10 | 0.084791 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 157 | 157 | AY.75.1 | 0.028309 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 150 | 150 | AY.37 | 0.047408 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 147 | 147 | AY.56 | 0.235955 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 141 | 141 | B.1.1.525 | 0.770492 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 140 | 140 | AY.16 | 0.053151 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 129 | 129 | AY.63 | 0.049903 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 126 | 126 | AY.44 | 0.000767 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 109 | 109 | AY.57 | 0.071522 |
N | 215 | G215F | GGt | TTt | 106 | 106 | AY.4 | 0.000165 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 105 | 105 | AY.14 | 0.009241 |
N | 215 | G215D | gGt | gAt | 98 | 98 | All | 0.000019 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 93 | 93 | AY.40 | 0.089682 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 90 | 90 | B.1.509 | 0.077922 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 86 | 86 | AY.48 | 0.04 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 83 | 83 | AY.13 | 0.013361 |
N | 215 | G215Y | GGt | TAt | 83 | 83 | AY.4 | 0.000129 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 82 | 82 | AY.70 | 0.017098 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 81 | 81 | AY.35 | 0.018877 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 80 | 80 | AY.24 | 0.034483 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 80 | 80 | B.1.443 | 0.373832 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 79 | 79 | AY.30 | 0.031262 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 78 | 78 | AY.25 | 0.000469 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 77 | 77 | B | 0.009842 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 73 | 73 | AY.33 | 0.004875 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 70 | 70 | AY.71 | 0.033254 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 66 | 66 | B.1.609 | 0.03164 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 65 | 65 | B.1.232 | 0.034927 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 64 | 64 | B.1.1.7 | 0.000057 |
N | 215 | G215S | GGt | TCt | 62 | 63 | AY.4 | 0.000096 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 1 | 63 | AY.4 | 0.000002 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 62 | 62 | AY.102 | 0.001644 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 61 | 61 | AY.60 | 0.057223 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 56 | 56 | AY.3 | 0.000557 |
N | 215 | G215V | gGt | gTt | 56 | 56 | B.1.635 | 0.982456 |
N | 215 | G215V | gGt | gTt | 56 | 56 | P.5 | 0.767123 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 55 | 55 | AY.4.2 | 0.001193 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 54 | 54 | AY.11 | 0.072289 |
N | 215 | G215F | GGt | TTt | 54 | 54 | B.1.617.2 | 0.000203 |
N | 215 | G215V | gGt | gTt | 53 | 53 | B.1.604 | 0.913793 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 50 | 50 | AY.46.6 | 0.00361 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 47 | 47 | B.1.1.7 | 0.000042 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 45 | 45 | AY.65 | 0.023987 |
N | 215 | G215D | gGt | gAt | 44 | 44 | B.1.1.7 | 0.000039 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 23 | 44 | B.1.617.2 | 0.000087 |
N | 215 | G215S | GGt | TCt | 20 | 44 | B.1.617.2 | 0.000075 |
N | 215 | G215S | GgT | AgC | 1 | 44 | B.1.617.2 | 0.000004 |
N | 215 | G215V | gGt | gTt | 42 | 42 | B.1.536 | 1 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 39 | 39 | AY.118 | 0.002443 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 38 | 38 | AY.39 | 0.000939 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 38 | 38 | AY.75 | 0.002129 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 37 | 37 | AY.110 | 0.004169 |
N | 215 | G215F | GGt | TTt | 37 | 37 | AY.3 | 0.000368 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 37 | 37 | AY.49 | 0.118211 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 37 | 37 | B.1.527 | 0.137037 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 36 | 36 | AY.50 | 0.028777 |
N | 215 | G215S | GGt | TCt | 35 | 35 | AY.100 | 0.00161 |
N | 215 | G215V | gGt | gTt | 35 | 35 | C.40 | 0.972222 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 34 | 34 | AY.100 | 0.001564 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 34 | 34 | B.1 | 0.000311 |
N | 215 | G215A | gGt | gCt | 33 | 33 | All | 0.000006 |
N | 215 | G215F | GGt | TTt | 33 | 33 | AY.25 | 0.000198 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 33 | 33 | AY.5 | 0.000681 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 33 | 33 | AY.61 | 0.003458 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 31 | 31 | AY.38 | 0.015477 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 31 | 31 | B.1.1 | 0.000562 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 31 | 31 | B.1.2 | 0.000273 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 31 | 31 | B.1.525 | 0.003508 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 30 | 30 | AY.17 | 0.245902 |
N | 215 | G215N | GGT | AAC | 15 | 28 | All | 0.000003 |
N | 215 | G215N | GGt | AAt | 13 | 28 | All | 0.000002 |
N | 215 | G215V | gGt | gTt | 28 | 28 | B.1.115 | 0.608696 |
N | 215 | G215del1 | Ggt | -gt | 23 | 27 | All | 0.000004 |
N | 215 | G215del1 | GGt | -Nt | 2 | 27 | All | 0 |
N | 215 | G215del1 | GGt | -Tt | 1 | 27 | All | 0 |
N | 215 | G215del1 | GgT | Tg- | 1 | 27 | All | 0 |
N | 215 | G215G | ggT | ggC | 27 | 27 | B.1.2 | 0.000238 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 25 | 25 | B.1.221 | 0.001776 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 25 | 25 | B.1.437 | 0.520833 |
N | 215 | G215V | gGt | gTt | 23 | 23 | B.1 | 0.000211 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 23 | 23 | B.1.595 | 0.006002 |
N | 215 | G215del2 | GGt | --t | 21 | 22 | All | 0.000004 |
N | 215 | G215del2 | GGT | --N | 1 | 22 | All | 0 |
N | 215 | G215S | GGt | TCt | 21 | 22 | AY.3 | 0.000209 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 1 | 22 | AY.3 | 0.00001 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 22 | 22 | AY.51 | 0.02 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 22 | 22 | S.1 | 0.108911 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 21 | 21 | AY.120 | 0.000781 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 21 | 21 | AY.16.1 | 0.009868 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 21 | 21 | AY.28 | 0.039698 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 17 | 21 | AY.44 | 0.000103 |
N | 215 | G215S | GGt | TCt | 4 | 21 | AY.44 | 0.000024 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 20 | 20 | AY.9.1 | 0.001674 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 20 | 20 | B.1.160 | 0.000624 |
N | 215 | G215A | gGt | gCt | 20 | 20 | P.1 | 0.000315 |
N | 215 | G215F | GGt | TTt | 19 | 19 | AY.118 | 0.00119 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 19 | 19 | AY.9 | 0.001284 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 19 | 19 | P.1 | 0.000299 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 18 | 18 | AY.45 | 0.00219 |
N | 215 | G215R | Ggt | Cgt | 17 | 17 | All | 0.000003 |
N | 215 | G215V | gGt | gTt | 17 | 17 | B.1.400 | 0.007293 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 17 | 17 | B.1.526 | 0.0004 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 17 | 17 | B.1.596 | 0.001481 |
N | 215 | G215Y | GGt | TAt | 16 | 16 | AY.103 | 0.000099 |
N | 215 | G215Y | GGt | TAt | 16 | 16 | AY.44 | 0.000097 |
N | 215 | G215G | ggT | ggC | 14 | 16 | B.1.1.7 | 0.000013 |
N | 215 | G215G | ggT | ggA | 1 | 16 | B.1.1.7 | 0.000001 |
N | 215 | G215G | ggT | ggG | 1 | 16 | B.1.1.7 | 0.000001 |
N | 215 | G215F | GGt | TTt | 15 | 15 | AY.43 | 0.000066 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 15 | 15 | AY.77 | 0.016911 |
N | 215 | G215G | ggT | ggC | 15 | 15 | B.1.617.2 | 0.000056 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 14 | 14 | AY.29 | 0.000221 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 14 | 14 | AY.36 | 0.002075 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 14 | 14 | AY.66 | 0.014973 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 14 | 14 | AY.8 | 0.008485 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 14 | 14 | AY.99.2 | 0.00129 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 14 | 14 | B.1.1.316 | 0.012951 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 14 | 14 | B.1.438.1 | 0.001502 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 14 | 14 | B.1.621 | 0.001239 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 13 | 13 | A.2.5.2 | 0.02044 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 13 | 13 | B.1.2 | 0.000114 |
N | 215 | G215D | gGt | gAt | 13 | 13 | B.1.526 | 0.000306 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 13 | 13 | B.1.621 | 0.001151 |
N | 215 | G215S | GGt | TCt | 11 | 12 | AY.39 | 0.000272 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 1 | 12 | AY.39 | 0.000025 |
N | 215 | G215Y | GGt | TAt | 12 | 12 | AY.42 | 0.000483 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 12 | 12 | AY.6 | 0.000494 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 12 | 12 | AY.98 | 0.000948 |
N | 215 | G215D | gGt | gAt | 12 | 12 | D.2 | 0.0009 |
N | 215 | G215F | GGt | TTt | 11 | 11 | AY.39 | 0.000272 |
N | 215 | G215F | GGt | TTt | 11 | 11 | AY.44 | 0.000067 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 11 | 11 | AY.72 | 0.014966 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 11 | 11 | B.1.596 | 0.000959 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 11 | 11 | B.1.600 | 0.064327 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 11 | 11 | P.1 | 0.000173 |
N | 215 | G215F | GGt | TTt | 10 | 10 | AY.102 | 0.000265 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 10 | 10 | AY.20 | 0.000389 |
N | 215 | G215S | GGt | TCt | 8 | 10 | AY.43 | 0.000035 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 2 | 10 | AY.43 | 0.000009 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 10 | 10 | B.1.617.1 | 0.00129 |
N | 215 | G215Y | GGt | TAt | 10 | 10 | B.1.617.2 | 0.000038 |
N | 215 | G215Y | GGt | TAt | 9 | 9 | AY.118 | 0.000564 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 9 | 9 | AY.121 | 0.001218 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 9 | 9 | AY.4.5 | 0.000967 |
N | 215 | G215Y | GGt | TAt | 9 | 9 | AY.43 | 0.00004 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 9 | 9 | AY.46 | 0.000937 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 9 | 9 | B.1.351 | 0.000268 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 9 | 9 | B.1.9.5 | 0.051136 |
N | 215 | G215S | GGt | TCt | 7 | 8 | AY.120 | 0.00026 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 1 | 8 | AY.120 | 0.000037 |
N | 215 | G215Y | GGt | TAt | 8 | 8 | AY.20 | 0.000311 |
N | 215 | G215Y | GGt | TAt | 8 | 8 | AY.25 | 0.000048 |
N | 215 | G215S | GGt | TCt | 8 | 8 | AY.29 | 0.000126 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 8 | 8 | AY.3.1 | 0.000682 |
N | 215 | G215G | ggT | ggC | 8 | 8 | AY.37 | 0.002528 |
N | 215 | G215G | ggT | ggC | 8 | 8 | AY.9.1 | 0.00067 |
N | 215 | G215G | ggT | ggC | 8 | 8 | AY.9.2 | 0.000294 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 8 | 8 | B.1 | 0.000073 |
N | 215 | G215G | ggT | ggC | 6 | 8 | B.1 | 0.000055 |
N | 215 | G215G | ggT | ggG | 2 | 8 | B.1 | 0.000018 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 8 | 8 | B.1.1 | 0.000145 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 8 | 8 | B.1.628 | 0.002819 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 7 | 7 | AY.27 | 0.000453 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 7 | 7 | AY.47 | 0.000218 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 7 | 7 | AY.61 | 0.000733 |
N | 215 | G215N | GGT | AAC | 4 | 7 | B.1 | 0.000037 |
N | 215 | G215N | GGt | AAt | 3 | 7 | B.1 | 0.000027 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 7 | 7 | B.1.1.265 | 0.022082 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 7 | 7 | B.1.1.432 | 0.008861 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 7 | 7 | B.1.1.486 | 0.011041 |
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N | 215 | G215S | GGt | TCt | 6 | 6 | AY.103 | 0.000037 |
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N | 215 | G215del2 | GGt | --t | 6 | 6 | AY.3 | 0.00006 |
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N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 5 | 5 | B.1.634 | 0.017123 |
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N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 5 | 5 | P.1.12 | 0.00242 |
N | 215 | G215F | GGt | TTt | 4 | 4 | AY.103 | 0.000025 |
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N | 215 | G215del1 | Ggt | -gt | 4 | 4 | AY.3 | 0.00004 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 4 | 4 | AY.34 | 0.000388 |
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N | 215 | G215F | GGt | TTt | 4 | 4 | AY.4.4 | 0.001637 |
N | 215 | G215del1 | Ggt | -gt | 4 | 4 | AY.44 | 0.000024 |
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N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 4 | 4 | B.1.351 | 0.000119 |
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N | 215 | G215N | GGt | AAt | 4 | 4 | B.1.617.2 | 0.000015 |
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N | 215 | G215G | ggT | ggC | 4 | 4 | Q.8 | 0.00066 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 3 | 3 | A | 0.001161 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 3 | 3 | A.1 | 0.000846 |
N | 215 | G215del1 | Ggt | -gt | 3 | 3 | AY.102 | 0.00008 |
N | 215 | G215S | GGt | TCt | 3 | 3 | AY.114 | 0.000693 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 3 | 3 | AY.116 | 0.00086 |
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N | 215 | G215G | ggT | ggG | 1 | 3 | AY.13 | 0.000161 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 3 | 3 | AY.21 | 0.005693 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 3 | 3 | AY.23 | 0.000209 |
N | 215 | G215Y | GGt | TAt | 3 | 3 | AY.29 | 0.000047 |
N | 215 | G215F | GGt | TTt | 3 | 3 | AY.29 | 0.000047 |
N | 215 | G215R | Ggt | Cgt | 3 | 3 | AY.3 | 0.00003 |
N | 215 | G215del1 | GGt | -Nt | 2 | 3 | AY.4 | 0.000003 |
N | 215 | G215del1 | Ggt | -gt | 1 | 3 | AY.4 | 0.000002 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 3 | 3 | AY.41 | 0.000882 |
N | 215 | G215G | ggT | ggC | 3 | 3 | AY.43 | 0.000013 |
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N | 215 | G215G | ggT | ggG | 1 | 3 | AY.47 | 0.000031 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 3 | 3 | AY.85 | 0.001282 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 3 | 3 | AY.93 | 0.000819 |
N | 215 | G215S | GGt | TCt | 2 | 3 | AY.98 | 0.000158 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 1 | 3 | AY.98 | 0.000079 |
N | 215 | G215V | gGt | gTt | 3 | 3 | B | 0.000383 |
N | 215 | G215G | ggT | ggC | 3 | 3 | B.1.1 | 0.000054 |
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N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 3 | 3 | B.1.258.11 | 0.001189 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 3 | 3 | B.1.406 | 0.018182 |
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N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 1 | 3 | P.1.14 | 0.000048 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | 0.111111 | |
N | 215 | G215V | gGT | gTG | 1 | 2 | 0.055556 | |
N | 215 | G215V | gGt | gTt | 1 | 2 | 0.055556 | |
N | 215 | G215V | gGt | gTt | 2 | 2 | A | 0.000774 |
N | 215 | G215A | gGt | gCt | 2 | 2 | A | 0.000774 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 2 | 2 | AE.8 | 0.000978 |
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N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | AU.3 | 0.004219 |
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N | 215 | G215del2 | GGt | --t | 2 | 2 | AY.103 | 0.000012 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 2 | 2 | AY.105 | 0.001286 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 2 | 2 | AY.108 | 0.002205 |
N | 215 | G215S | GGt | TCt | 2 | 2 | AY.116.1 | 0.000623 |
N | 215 | G215F | GGt | TTt | 2 | 2 | AY.117 | 0.000169 |
N | 215 | G215F | GGt | TTt | 2 | 2 | AY.120 | 0.000074 |
N | 215 | G215D | gGt | gAt | 2 | 2 | AY.13 | 0.000322 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | AY.15 | 0.004444 |
N | 215 | G215G | ggT | ggG | 1 | 2 | AY.16.1 | 0.00047 |
N | 215 | G215G | ggT | ggC | 1 | 2 | AY.16.1 | 0.00047 |
N | 215 | G215del2 | GGt | --t | 1 | 2 | AY.20 | 0.000039 |
N | 215 | G215del2 | GGT | --N | 1 | 2 | AY.20 | 0.000039 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 2 | 2 | AY.24 | 0.000862 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 2 | 2 | AY.29.1 | 0.000441 |
N | 215 | G215Y | GGt | TAt | 2 | 2 | AY.3 | 0.00002 |
N | 215 | G215N | GGt | AAt | 2 | 2 | AY.3 | 0.00002 |
N | 215 | G215F | GGt | TTt | 2 | 2 | AY.34.1 | 0.00102 |
N | 215 | G215S | GGt | TCt | 2 | 2 | AY.36 | 0.000296 |
N | 215 | G215del1 | Ggt | -gt | 2 | 2 | AY.39.1 | 0.000079 |
N | 215 | G215Y | GGt | TAt | 2 | 2 | AY.4.2 | 0.000043 |
N | 215 | G215F | GGt | TTt | 2 | 2 | AY.4.2 | 0.000043 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 2 | 2 | AY.42 | 0.00008 |
N | 215 | G215del1 | Ggt | -gt | 1 | 2 | AY.43 | 0.000004 |
N | 215 | G215del1 | GgT | Tg- | 1 | 2 | AY.43 | 0.000004 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 2 | 2 | AY.46.4 | 0.000329 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 2 | 2 | AY.50 | 0.001599 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 2 | 2 | AY.59 | 0.001059 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 2 | 2 | AY.7 | 0.000392 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 2 | 2 | AY.75 | 0.000112 |
N | 215 | G215A | gGt | gCt | 2 | 2 | AY.9.2 | 0.000073 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 2 | 2 | AY.9.2 | 0.000073 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 2 | 2 | AY.92 | 0.000575 |
N | 215 | G215D | gGt | gAt | 2 | 2 | AY.98.1 | 0.000097 |
N | 215 | G215Y | GGt | TAt | 2 | 2 | AY.99.2 | 0.000184 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 2 | 2 | B.1.1 | 0.000036 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | B.1.1.306 | 0.000877 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 1 | 2 | B.1.1.306 | 0.000438 |
N | 215 | G215S | GgT | AgC | 1 | 2 | B.1.1.306 | 0.000438 |
N | 215 | G215V | gGt | gTt | 2 | 2 | B.1.1.317 | 0.000823 |
N | 215 | G215G | ggT | ggA | 2 | 2 | B.1.1.318 | 0.000604 |
N | 215 | G215D | gGt | gAt | 2 | 2 | B.1.1.329 | 0.007692 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | B.1.1.37 | 0.000386 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 2 | 2 | B.1.1.370 | 0.025316 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | B.1.1.526 | 0.007092 |
N | 215 | G215G | ggT | ggC | 1 | 2 | B.1.160 | 0.000031 |
N | 215 | G215G | ggT | ggA | 1 | 2 | B.1.160 | 0.000031 |
N | 215 | G215V | gGt | gTt | 2 | 2 | B.1.177 | 0.000026 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 2 | 2 | B.1.177 | 0.000026 |
N | 215 | G215D | gGt | gAt | 2 | 2 | B.1.2 | 0.000018 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | B.1.214 | 0.007326 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 2 | 2 | B.1.243 | 0.000139 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | B.1.243 | 0.000139 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 2 | 2 | B.1.320 | 0.002491 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 2 | 2 | B.1.351 | 0.000059 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | B.1.422 | 0.001625 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | B.1.485 | 0.029851 |
N | 215 | G215V | gGt | gTt | 2 | 2 | B.1.526 | 0.000047 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | B.1.576 | 0.001813 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | B.1.580 | 0.00813 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | B.1.619 | 0.001742 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | B.1.623 | 0.001073 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | B.1.633 | 0.083333 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 2 | 2 | B.6 | 0.00182 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | C.37 | 0.000232 |
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N | 215 | G215G | ggT | ggA | 1 | 2 | D.2 | 0.000075 |
N | 215 | G215G | ggT | ggG | 1 | 1 | 0.055556 | |
N | 215 | G215V | gGt | gTt | 1 | 1 | A.1 | 0.000282 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | A.2.2 | 0.001689 |
N | 215 | G215G | ggT | ggA | 1 | 1 | A.2.4 | 0.003367 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | A.2.5 | 0.000499 |
N | 215 | G215N | GGt | AAt | 1 | 1 | A.23.1 | 0.000704 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | AK.1 | 0.012658 |
N | 215 | G215X | GgT | TgA | 1 | 1 | All | 0 |
N | 215 | G215P | GGT | CCC | 1 | 1 | All | 0 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | AU.2 | 0.002421 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 1 | 1 | AW.1 | 0.003049 |
N | 215 | G215del2 | GGt | --t | 1 | 1 | AY.100 | 0.000046 |
N | 215 | G215N | GGt | AAt | 1 | 1 | AY.103 | 0.000006 |
N | 215 | G215R | Ggt | Cgt | 1 | 1 | AY.103 | 0.000006 |
N | 215 | G215F | GGt | TTt | 1 | 1 | AY.105 | 0.000643 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 1 | 1 | AY.105 | 0.000643 |
N | 215 | G215F | GGt | TTt | 1 | 1 | AY.106 | 0.000335 |
N | 215 | G215S | GGt | TCt | 1 | 1 | AY.107 | 0.000466 |
N | 215 | G215del1 | Ggt | -gt | 1 | 1 | AY.107 | 0.000466 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.107 | 0.000466 |
N | 215 | G215X | GgT | TgA | 1 | 1 | AY.108 | 0.001103 |
N | 215 | G215R | Ggt | Cgt | 1 | 1 | AY.113 | 0.000142 |
N | 215 | G215Y | GGt | TAt | 1 | 1 | AY.113 | 0.000142 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.116.1 | 0.000311 |
N | 215 | G215del1 | Ggt | -gt | 1 | 1 | AY.117 | 0.000085 |
N | 215 | G215del2 | GGt | --t | 1 | 1 | AY.118 | 0.000063 |
N | 215 | G215del1 | Ggt | -gt | 1 | 1 | AY.12 | 0.000316 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.12 | 0.000316 |
N | 215 | G215R | Ggt | Cgt | 1 | 1 | AY.120 | 0.000037 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.120.1 | 0.000321 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.120.2 | 0.001285 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.120.2.1 | 0.000498 |
N | 215 | G215F | GGt | TTt | 1 | 1 | AY.121 | 0.000135 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 1 | 1 | AY.16.1 | 0.00047 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.16.1 | 0.00047 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | AY.18 | 0.010101 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 1 | 1 | AY.19 | 0.00114 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 1 | 1 | AY.2 | 0.000356 |
N | 215 | G215F | GGt | TTt | 1 | 1 | AY.20 | 0.000039 |
N | 215 | G215del1 | Ggt | -gt | 1 | 1 | AY.23 | 0.00007 |
N | 215 | G215Y | GGt | TAt | 1 | 1 | AY.23 | 0.00007 |
N | 215 | G215S | GGt | TCt | 1 | 1 | AY.25 | 0.000006 |
N | 215 | G215N | GGt | AAt | 1 | 1 | AY.25 | 0.000006 |
N | 215 | G215P | GGT | CCC | 1 | 1 | AY.25 | 0.000006 |
N | 215 | G215G | ggT | ggA | 1 | 1 | AY.26 | 0.000028 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.26 | 0.000028 |
N | 215 | G215del1 | Ggt | -gt | 1 | 1 | AY.3.1 | 0.000085 |
N | 215 | G215del2 | GGt | --t | 1 | 1 | AY.3.1 | 0.000085 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | AY.31 | 0.018519 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.32 | 0.000532 |
N | 215 | G215S | GGt | TCt | 1 | 1 | AY.33 | 0.000067 |
N | 215 | G215S | GGt | TCt | 1 | 1 | AY.34 | 0.000097 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.34.1 | 0.00051 |
N | 215 | G215V | gGt | gTt | 1 | 1 | AY.35 | 0.000233 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 1 | 1 | AY.37 | 0.000316 |
N | 215 | G215F | GGt | TTt | 1 | 1 | AY.38 | 0.000499 |
N | 215 | G215R | Ggt | Cgt | 1 | 1 | AY.39 | 0.000025 |
N | 215 | G215D | gGt | gAt | 1 | 1 | AY.39 | 0.000025 |
N | 215 | G215del1 | Ggt | -gt | 1 | 1 | AY.39 | 0.000025 |
N | 215 | G215del2 | GGt | --t | 1 | 1 | AY.39 | 0.000025 |
N | 215 | G215F | GGt | TTt | 1 | 1 | AY.39.1 | 0.00004 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.39.1.1 | 0.000725 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.39.2 | 0.001541 |
N | 215 | G215del2 | GGt | --t | 1 | 1 | AY.4 | 0.000002 |
N | 215 | G215R | Ggt | Cgt | 1 | 1 | AY.4 | 0.000002 |
N | 215 | G215F | GGt | TTt | 1 | 1 | AY.4.5 | 0.000107 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.40 | 0.000964 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 1 | 1 | AY.40 | 0.000964 |
N | 215 | G215N | GGT | AAC | 1 | 1 | AY.40 | 0.000964 |
N | 215 | G215S | GGt | TCt | 1 | 1 | AY.41 | 0.000294 |
N | 215 | G215S | GGt | TCt | 1 | 1 | AY.42 | 0.00004 |
N | 215 | G215R | Ggt | Cgt | 1 | 1 | AY.42 | 0.00004 |
N | 215 | G215F | GGt | TTt | 1 | 1 | AY.42 | 0.00004 |
N | 215 | G215del2 | GGt | --t | 1 | 1 | AY.43 | 0.000004 |
N | 215 | G215R | Ggt | Cgt | 1 | 1 | AY.43 | 0.000004 |
N | 215 | G215N | GGt | AAt | 1 | 1 | AY.44 | 0.000006 |
N | 215 | G215G | ggT | ggC | 1 | 1 | AY.44 | 0.000006 |
N | 215 | G215del2 | GGt | --t | 1 | 1 | AY.44 | 0.000006 |
N | 215 | G215R | Ggt | Cgt | 1 | 1 | AY.44 | 0.000006 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 1 | 1 | AY.45 | 0.000122 |
N | 215 | G215F | GGt | TTt | 1 | 1 | AY.46 | 0.000104 |
N | 215 | G215G | ggT | ggC | 1 | 1 | AY.46.2 | 0.000635 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.46.5 | 0.000198 |
N | 215 | G215F | GGt | TTt | 1 | 1 | AY.46.6 | 0.000072 |
N | 215 | G215del2 | GGt | --t | 1 | 1 | AY.46.6 | 0.000072 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.47 | 0.000031 |
N | 215 | G215F | GGt | TTt | 1 | 1 | AY.49 | 0.003195 |
N | 215 | G215V | gGt | gTt | 1 | 1 | AY.49 | 0.003195 |
N | 215 | G215G | ggT | ggC | 1 | 1 | AY.49 | 0.003195 |
N | 215 | G215S | GGt | TCt | 1 | 1 | AY.5 | 0.000021 |
N | 215 | G215F | GGt | TTt | 1 | 1 | AY.5 | 0.000021 |
N | 215 | G215Y | GGt | TAt | 1 | 1 | AY.5 | 0.000021 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.5.3 | 0.000337 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.5.4 | 0.000277 |
N | 215 | G215F | GGt | TTt | 1 | 1 | AY.5.4 | 0.000277 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.51 | 0.000909 |
N | 215 | G215G | ggT | ggA | 1 | 1 | AY.52 | 0.000814 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 1 | 1 | AY.54 | 0.000095 |
N | 215 | G215F | GGt | TTt | 1 | 1 | AY.56 | 0.001605 |
N | 215 | G215D | gGt | gAt | 1 | 1 | AY.57 | 0.000656 |
N | 215 | G215G | ggT | ggG | 1 | 1 | AY.59 | 0.00053 |
N | 215 | G215F | GGt | TTt | 1 | 1 | AY.6 | 0.000041 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 1 | 1 | AY.67 | 0.000464 |
N | 215 | G215V | gGt | gTt | 1 | 1 | AY.68 | 0.000274 |
N | 215 | G215G | ggT | ggG | 1 | 1 | AY.69 | 0.000187 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.7.1 | 0.000113 |
N | 215 | G215F | GGt | TTt | 1 | 1 | AY.7.2 | 0.000559 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 1 | 1 | AY.73 | 0.000665 |
N | 215 | G215V | gGt | gTt | 1 | 1 | AY.75 | 0.000056 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.76 | 0.004831 |
N | 215 | G215F | GGt | TTt | 1 | 1 | AY.77 | 0.001127 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.79 | 0.001211 |
N | 215 | G215R | Ggt | Cgt | 1 | 1 | AY.79 | 0.001211 |
N | 215 | G215R | Ggt | Cgt | 1 | 1 | AY.81 | 0.001992 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.83 | 0.001724 |
N | 215 | G215F | GGt | TTt | 1 | 1 | AY.84 | 0.000437 |
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N | 215 | G215del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.89 | 0.004902 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 1 | 1 | AY.9.1 | 0.000084 |
N | 215 | G215N | GGT | AAC | 1 | 1 | AY.9.2 | 0.000037 |
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N | 215 | G215del1 | Ggt | -gt | 1 | 1 | AY.90 | 0.000684 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.91 | 0.00073 |
N | 215 | G215F | GGt | TTt | 1 | 1 | AY.93 | 0.000273 |
N | 215 | G215del2 | GGt | --t | 1 | 1 | AY.94 | 0.000443 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.96 | 0.002075 |
N | 215 | G215F | GGt | TTt | 1 | 1 | AY.98 | 0.000079 |
N | 215 | G215G | ggT | ggC | 1 | 1 | AZ.2 | 0.000821 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B | 0.000128 |
N | 215 | G215D | gGt | gAt | 1 | 1 | B.1 | 0.000009 |
N | 215 | G215F | GGt | TTt | 1 | 1 | B.1 | 0.000009 |
N | 215 | G215D | gGt | gAt | 1 | 1 | B.1.1 | 0.000018 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.1.1 | 0.000327 |
N | 215 | G215V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1.1.1 | 0.000327 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.1.153 | 0.001095 |
N | 215 | G215V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1.1.174 | 0.003378 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.1.186 | 0.003436 |
N | 215 | G215G | ggT | ggA | 1 | 1 | B.1.1.214 | 0.000055 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.1.214 | 0.000055 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.1.216 | 0.00089 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.1.228 | 0.003049 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.1.265 | 0.003155 |
N | 215 | G215V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1.1.28 | 0.000311 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.1.286 | 0.002899 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.1.294 | 0.001266 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.1.301 | 0.001179 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.1.303 | 0.002762 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.1.307 | 0.002532 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.1.317 | 0.000412 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.1.318 | 0.000302 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.1.318 | 0.000302 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.1.328 | 0.016949 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.1.329 | 0.003846 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.1.33 | 0.000421 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.1.33 | 0.000421 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.1.39 | 0.00051 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.1.434 | 0.000349 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.1.464 | 0.001473 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.1.50 | 0.000679 |
N | 215 | G215V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1.1.50 | 0.000679 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.1.512 | 0.028571 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.1.519 | 0.00004 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.1.523 | 0.001563 |
N | 215 | G215F | GGt | TTt | 1 | 1 | B.1.1.7 | 0.000001 |
N | 215 | G215V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1.1.70 | 0.000341 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.110.3 | 0.000718 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.128 | 0.000635 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.131 | 0.008772 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.14 | 0.017544 |
N | 215 | G215D | gGt | gAt | 1 | 1 | B.1.147 | 0.000756 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.157 | 0.002985 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.160 | 0.000031 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.160 | 0.000031 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.164 | 0.014925 |
N | 215 | G215G | ggT | ggA | 1 | 1 | B.1.177 | 0.000013 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.177.21 | 0.000076 |
N | 215 | G215D | gGt | gAt | 1 | 1 | B.1.177.21 | 0.000076 |
N | 215 | G215D | gGt | gAt | 1 | 1 | B.1.177.45 | 0.000381 |
N | 215 | G215V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1.177.60 | 0.000218 |
N | 215 | G215G | ggT | ggC | 1 | 1 | B.1.177.60 | 0.000218 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.177.63 | 0.002703 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.177.7 | 0.000165 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.177.7 | 0.000165 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.177.73 | 0.000566 |
N | 215 | G215G | ggT | ggC | 1 | 1 | B.1.177.75 | 0.001041 |
N | 215 | G215G | ggT | ggC | 1 | 1 | B.1.177.81 | 0.000189 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.199 | 0.004132 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.2 | 0.000009 |
N | 215 | G215R | Ggt | Cgt | 1 | 1 | B.1.2 | 0.000009 |
N | 215 | G215del2 | GGt | --t | 1 | 1 | B.1.2 | 0.000009 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.210 | 0.002132 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.212 | 0.016667 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.218 | 0.005155 |
N | 215 | G215G | ggT | ggC | 1 | 1 | B.1.221 | 0.000071 |
N | 215 | G215V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1.224 | 0.025 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.240 | 0.000216 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.241 | 0.000812 |
N | 215 | G215V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1.243 | 0.00007 |
N | 215 | G215G | ggT | ggA | 1 | 1 | B.1.243 | 0.00007 |
N | 215 | G215G | ggT | ggC | 1 | 1 | B.1.258 | 0.000067 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.258 | 0.000067 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.301 | 0.005917 |
N | 215 | G215D | gGt | gAt | 1 | 1 | B.1.311 | 0.000275 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.346 | 0.001311 |
N | 215 | G215Y | GGt | TAt | 1 | 1 | B.1.351 | 0.00003 |
N | 215 | G215G | ggT | ggA | 1 | 1 | B.1.351 | 0.00003 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.351.5 | 0.0006 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.355 | 0.011111 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.36 | 0.000146 |
N | 215 | G215V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1.36 | 0.000146 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.36 | 0.000146 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.36.16 | 0.001425 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.36.29 | 0.000517 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.36.8 | 0.001 |
N | 215 | G215V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1.360 | 0.012658 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.362 | 0.001541 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.366 | 0.004878 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.367 | 0.000792 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.369 | 0.000285 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.371 | 0.001122 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.378 | 0.006849 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.395 | 0.007042 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.400 | 0.000429 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.427 | 0.00005 |
N | 215 | G215G | ggT | ggA | 1 | 1 | B.1.427 | 0.00005 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.427 | 0.00005 |
N | 215 | G215G | ggT | ggC | 1 | 1 | B.1.429 | 0.000024 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.429 | 0.000024 |
N | 215 | G215D | gGt | gAt | 1 | 1 | B.1.429 | 0.000024 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.432 | 0.011236 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.433 | 0.003195 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.438 | 0.006536 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.438.1 | 0.000107 |
N | 215 | G215N | GGT | AAC | 1 | 1 | B.1.465 | 0.003802 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.480 | 0.002488 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.499 | 0.00105 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.524 | 0.001406 |
N | 215 | G215D | gGt | gAt | 1 | 1 | B.1.525 | 0.000113 |
N | 215 | G215N | GGT | AAC | 1 | 1 | B.1.525 | 0.000113 |
N | 215 | G215F | GGt | TTt | 1 | 1 | B.1.526 | 0.000024 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.530 | 0.007143 |
N | 215 | G215D | gGt | gAt | 1 | 1 | B.1.538 | 0.008065 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.545 | 0.014493 |
N | 215 | G215V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1.546 | 0.003704 |
N | 215 | G215G | ggT | ggG | 1 | 1 | B.1.560 | 0.00463 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.564 | 0.000426 |
N | 215 | G215G | ggT | ggC | 1 | 1 | B.1.567 | 0.003333 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.575.1 | 0.002439 |
N | 215 | G215N | GGT | AAC | 1 | 1 | B.1.576 | 0.000907 |
N | 215 | G215V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1.577 | 0.000687 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.582 | 0.000491 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.588 | 0.00091 |
N | 215 | G215V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1.596 | 0.000087 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.604 | 0.017241 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.612 | 0.002653 |
N | 215 | G215del1 | Ggt | -gt | 1 | 1 | B.1.617.1 | 0.000129 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.617.1 | 0.000129 |
N | 215 | G215del1 | GGt | -Tt | 1 | 1 | B.1.617.2 | 0.000004 |
N | 215 | G215del2 | GGt | --t | 1 | 1 | B.1.617.2 | 0.000004 |
N | 215 | G215A | gGt | gCt | 1 | 1 | B.1.617.2 | 0.000004 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.621.1 | 0.000506 |
N | 215 | G215D | gGt | gAt | 1 | 1 | B.1.628 | 0.000352 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.637 | 0.000073 |
N | 215 | G215D | gGt | gAt | 1 | 1 | B.36 | 0.076923 |
N | 215 | G215V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.40 | 0.000364 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.55 | 0.00295 |
N | 215 | G215G | ggT | ggC | 1 | 1 | B.58 | 0.010204 |
N | 215 | G215N | GGT | AAC | 1 | 1 | C.35 | 0.000774 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | C.36.3 | 0.000567 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | C.36.3.1 | 0.002717 |
N | 215 | G215D | gGt | gAt | 1 | 1 | C.37 | 0.000116 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 1 | 1 | C.37 | 0.000116 |
N | 215 | G215del | GGT | --- | 1 | 1 | C.37.1 | 0.002618 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 1 | 1 | D.2 | 0.000075 |
N | 215 | G215A | gGt | gCt | 1 | 1 | P.1.1 | 0.000318 |
N | 215 | G215G | ggT | ggA | 1 | 1 | P.1.10 | 0.000269 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | P.1.10 | 0.000269 |
N | 215 | G215G | ggT | ggA | 1 | 1 | P.1.13 | 0.000898 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 1 | 1 | P.1.13 | 0.000898 |
N | 215 | G215V | gGt | gTt | 1 | 1 | P.1.15 | 0.000232 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 1 | 1 | P.1.2 | 0.001156 |
N | 215 | G215V | gGt | gTt | 1 | 1 | P.2 | 0.000187 |
N | 215 | G215C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | Q.1 | 0.000126 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 1 | 1 | Q.3 | 0.000145 |
N | 215 | G215S | Ggt | Agt | 1 | 1 | Q.8 | 0.000165 |
CoV-GLUE is still in development. CoV-GLUE was originally developed as part of COG-UK by Josh Singer using the GLUE framework at the MRC-University of Glasgow Centre for Virus Research (CVR). In 2021 it was redeveloped by Richard Orton to scale to the millions of genome sequences available. We acknowledge support from the MRC (MC_UU_12014/12), WT (220977/Z/20/Z) and UKRI G2P (MR/W005611/1). Please contact Richard Orton with any queries: Richard.Orton@glasgow.ac.uk
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