CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = N : CodonNum = 215

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
N215G215CnonsynGgtTgt239606723959200.99993928916-28918
N215G215CnonsynGgTTgC23960671470.000061350528916-28918
N215G215deldelGGT---33283328128916-28918
N215G215SnonsynGgtAgt10348320.80464228916-28918
N215G215SnonsynGGtTCt10342000.19342428916-28918
N215G215SnonsynGgTAgC103420.0019342428916-28918
N215G215VnonsyngGtgTt5955940.99831928916-28918
N215G215VnonsyngGTgTG59510.0016806728916-28918
N215G215GsynggTggC5535190.93851728916-28918
N215G215GsynggTggA553240.043399628916-28918
N215G215GsynggTggG553100.018083228916-28918
N215G215FnonsynGGtTTt355355128916-28918
N215G215YnonsynGGtTAt184184128916-28918
N215G215DnonsyngGtgAt9898128916-28918
N215G215AnonsyngGtgCt3333128916-28918
N215G215NnonsynGGTAAC28150.53571428916-28918
N215G215NnonsynGGtAAt28130.46428628916-28918
N215G215del1delGgt-gt27230.85185228916-28918
N215G215del1delGGt-Nt2720.074074128916-28918
N215G215del1delGGt-Tt2710.03703728916-28918
N215G215del1delGgTTg-2710.03703728916-28918
N215G215del2delGGt--t22210.95454528916-28918
N215G215del2delGGT--N2210.045454528916-28918
N215G215RnonsynGgtCgt1717128916-28918
N215G215PnonsynGGTCCC11128916-28918
N215G215XnonsynGgTTgA11128916-28918

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
N215G215CGgtTgt23959202396067All0.458248
N215G215CGgTTgC1472396067All0.000028
N215G215CGgtTgt637679637685AY.40.992498
N215G215CGgTTgC6637685AY.40.000009
N215G215CGgtTgt222588222605B.1.617.20.838136
N215G215CGgTTgC17222605B.1.617.20.000064
N215G215CGgtTgt216579216584AY.430.959545
N215G215CGgTTgC5216584AY.430.000022
N215G215CGgtTgt165134165136AY.250.993251
N215G215CGgTTgC2165136AY.250.000012
N215G215CGgtTgt161462161467AY.440.982781
N215G215CGgTTgC5161467AY.440.00003
N215G215CGgtTgt159627159632AY.1030.991133
N215G215CGgTTgC5159632AY.1030.000031
N215G215CGgtTgt9492694928AY.30.944171
N215G215CGgTTgC294928AY.30.00002
N215G215CGgtTgt6334563347AY.290.99918
N215G215CGgTTgC263347AY.290.000032
N215G215CGgtTgt4725647264AY.50.975799
N215G215CGgTTgC847264AY.50.000165
N215G215CGgtTgt4594745947AY.4.20.99653
N215G215CGgtTgt3957439578AY.390.977933
N215G215CGgTTgC439578AY.390.000099
N215G215CGgtTgt3747737507AY.1020.993663
N215G215CGgTTgC3037507AY.1020.000795
N215G215CGgtTgt2768827688AY.1190.977615
N215G215CGgtTgt2666526665AY.1200.991375
N215G215CGgtTgt2560225602AY.200.995025
N215G215CGgtTgt2483824839AY.39.10.983917
N215G215CGgTTgC124839AY.39.10.00004
N215G215CGgtTgt2442324423AY.420.98254
N215G215CGgtTgt2420524206AY.60.995517
N215G215CGgTTgC124206AY.60.000041
N215G215CGgtTgt2143221432AY.1000.986014
N215G215CGgtTgt2013520135AY.98.10.975155
N215G215CGgtTgt1572415724AY.1180.98509
N215G215CGgtTgt1474114741AY.330.984374
N215G215CGgtTgt1360913609AY.46.60.98267
N215G215CGgtTgt1320513205AY.230.921043
N215G215CGgtTgt1242612426AY.980.981594
N215G215CGgtTgt1166111661AY.1170.985548
N215G215CGgtTgt1103211032AY.3.10.940575
N215G215CGgtTgt1072510725AY.99.20.988388
N215G215CGgtTgt1019010244AY.340.988073
N215G215CGgTTgC5410244AY.340.005236
N215G215CGgtTgt93439344AY.460.972419
N215G215CGgTTgC19344AY.460.000104
N215G215CGgtTgt92369236AY.4.50.992798
N215G215CGgtTgt88238823AY.7.10.994365
N215G215CGgtTgt77487748AY.450.942808
N215G215CGgtTgt73017301AY.1210.987957
N215G215CGgtTgt68306831AY.1130.972519
N215G215CGgTTgC16831AY.1130.000142
N215G215CGgtTgt66596659AY.360.986957
N215G215CGgtTgt66216621AY.4.2.10.986442
N215G215CGgtTgt60596060AY.46.40.99671
N215G215CGgTTgC16060AY.46.40.000165
N215G215CGgtTgt54525452AY.1110.998535
N215G215CGgtTgt50745074AY.70.994512
N215G215CGgtTgt50395039AY.46.50.999802
N215G215CGgtTgt45334533AY.29.10.999559
N215G215CGgtTgt42804280AY.1140.989138
N215G215CGgtTgt41684168AY.1100.469687
N215G215CGgtTgt35663566AY.930.973785
N215G215CGgtTgt35323533AY.5.40.97731
N215G215CGgTTgC13533AY.5.40.000277
N215G215CGgtTgt33533353AY.1160.961572
N215G215delGGT---33283328All0.000637
N215G215CGgtTgt33273327AY.410.977954
N215G215CGgtTgt31913191AY.116.10.993771
N215G215CGgtTgt30873087AY.120.10.991011
N215G215CGgtTgt30243024AY.920.868716
N215G215CGgtTgt29202921AY.120.922882
N215G215CGgTTgC12921AY.120.000316
N215G215CGgtTgt29192919AY.5.30.984818
N215G215CGgtTgt27092709AY.9.20.0995
N215G215CGgtTgt25012501AY.10.989711
N215G215CGgtTgt24152415AY.4.40.988134
N215G215CGgtTgt23962396AY.23.11
N215G215CGgtTgt23242324AY.1060.778299
N215G215CGgtTgt22962296AY.850.980777
N215G215CGgtTgt22652265AY.840.990814
N215G215CGgtTgt22242224AY.940.984506
N215G215CGgtTgt21352135AY.1070.994874
N215G215CGgtTgt19871987AY.1010.974497
N215G215CGgtTgt19601960AY.120.2.10.976582
N215G215CGgtTgt19521952AY.34.10.995411
N215G215CGgtTgt18281828AY.320.973376
N215G215CGgtTgt17781778AY.7.20.994407
N215G215CGgtTgt15071507AY.46.20.957433
N215G215CGgtTgt14571457AY.1050.936977
N215G215CGgtTgt14401440AY.900.985626
N215G215CGgtTgt13791379AY.39.1.10.999275
N215G215CGgtTgt13461346AY.4.10.992625
N215G215CGgtTgt13451345AY.1090.994822
N215G215CGgtTgt13301330AY.910.971512
N215G215CGgtTgt12171217AY.950.92618
N215G215CGgtTgt11801180AY.870.982515
N215G215CGgtTgt11641164AY.4.30.979798
N215G215CGgtTgt11611161AY.860.963485
N215G215CGgtTgt11031103AY.880.975243
N215G215CGgtTgt10711071AY.46.31
N215G215SGgtAgt8321034All0.000159
N215G215SGGtTCt2001034All0.000038
N215G215SGgTAgC21034All0
N215G215delGGT---994994B.1.617.20.003743
N215G215CGgtTgt965965AY.46.10.99076
N215G215CGgtTgt923923AY.470.02871
N215G215CGgtTgt868868AY.800.979684
N215G215CGgtTgt861861AY.990.903463
N215G215CGgtTgt821821AY.790.993947
N215G215CGgtTgt818818AY.770.92221
N215G215CGgtTgt765765AY.1080.84344
N215G215CGgtTgt735735AY.820.997286
N215G215CGgtTgt714714AY.120.20.917738
N215G215CGgtTgt648648AY.39.20.998459
N215G215CGgtTgt639639AY.99.10.992236
N215G215CGgtTgt611611AY.780.941448
N215G215CGgtTgt610610AY.730.405855
N215G215VgGtgTt594595All0.000114
N215G215VgGTgTG1595All0
N215G215CGgtTgt577577AY.830.994828
N215G215CGgtTgt563563AY.970.957483
N215G215CGgtTgt561561AY.750.031429
N215G215GggTggC519553All0.000099
N215G215GggTggA24553All0.000005
N215G215GggTggG10553All0.000002
N215G215CGgtTgt499499AY.1040.990079
N215G215CGgtTgt489489AY.810.974104
N215G215CGgtTgt469469AY.210.889943
N215G215CGgtTgt469469AY.220.981172
N215G215CGgtTgt453453AY.550.415596
N215G215CGgtTgt404404AY.5.20.995074
N215G215delGGT---398398AY.1190.014053
N215G215GggTggC393393AY.510.357273
N215G215CGgtTgt383383AY.740.044293
N215G215CGgtTgt375375AY.960.778008
N215G215CGgtTgt363363AY.680.09937
N215G215CGgtTgt360360B.10.003297
N215G215FGGtTTt355355All0.000068
N215G215delGGT---355355AY.40.000553
N215G215CGgtTgt337337AY.260.009541
N215G215CGgtTgt315315AY.540.030034
N215G215CGgtTgt284284AY.190.323831
N215G215CGgtTgt266266AY.5.11
N215G215CGgtTgt257257AY.590.136123
N215G215CGgtTgt246246AY.91.11
N215G215delGGT---240240AY.430.001063
N215G215VgGtgTt234234B.1.1460.991525
N215G215CGgtTgt233233AY.530.066993
N215G215CGgtTgt225225AY.580.204174
N215G215CGgtTgt205205AY.760.990338
N215G215CGgtTgt203203AY.890.995098
N215G215delGGT---195195AY.1030.001211
N215G215CGgtTgt188188AY.620.081917
N215G215YGGtTAt184184All0.000035
N215G215CGgtTgt183183AY.690.034161
N215G215CGgtTgt180180AY.1150.9375
N215G215SGgtAgt174174B.1.1.70.000156
N215G215CGgtTgt170170AY.640.10119
N215G215CGgtTgt164164AY.670.076137
N215G215CGgtTgt161161AY.520.131107
N215G215CGgtTgt160160AY.100.084791
N215G215CGgtTgt157157AY.75.10.028309
N215G215CGgtTgt150150AY.370.047408
N215G215CGgtTgt147147AY.560.235955
N215G215CGgtTgt141141B.1.1.5250.770492
N215G215CGgtTgt140140AY.160.053151
N215G215CGgtTgt129129AY.630.049903
N215G215delGGT---126126AY.440.000767
N215G215CGgtTgt109109AY.570.071522
N215G215FGGtTTt106106AY.40.000165
N215G215CGgtTgt105105AY.140.009241
N215G215DgGtgAt9898All0.000019
N215G215CGgtTgt9393AY.400.089682
N215G215delGGT---9090B.1.5090.077922
N215G215CGgtTgt8686AY.480.04
N215G215CGgtTgt8383AY.130.013361
N215G215YGGtTAt8383AY.40.000129
N215G215CGgtTgt8282AY.700.017098
N215G215CGgtTgt8181AY.350.018877
N215G215CGgtTgt8080AY.240.034483
N215G215SGgtAgt8080B.1.4430.373832
N215G215CGgtTgt7979AY.300.031262
N215G215delGGT---7878AY.250.000469
N215G215CGgtTgt7777B0.009842
N215G215delGGT---7373AY.330.004875
N215G215CGgtTgt7070AY.710.033254
N215G215CGgtTgt6666B.1.6090.03164
N215G215SGgtAgt6565B.1.2320.034927
N215G215CGgtTgt6464B.1.1.70.000057
N215G215SGGtTCt6263AY.40.000096
N215G215SGgtAgt163AY.40.000002
N215G215delGGT---6262AY.1020.001644
N215G215CGgtTgt6161AY.600.057223
N215G215delGGT---5656AY.30.000557
N215G215VgGtgTt5656B.1.6350.982456
N215G215VgGtgTt5656P.50.767123
N215G215delGGT---5555AY.4.20.001193
N215G215CGgtTgt5454AY.110.072289
N215G215FGGtTTt5454B.1.617.20.000203
N215G215VgGtgTt5353B.1.6040.913793
N215G215delGGT---5050AY.46.60.00361
N215G215delGGT---4747B.1.1.70.000042
N215G215CGgtTgt4545AY.650.023987
N215G215DgGtgAt4444B.1.1.70.000039
N215G215SGgtAgt2344B.1.617.20.000087
N215G215SGGtTCt2044B.1.617.20.000075
N215G215SGgTAgC144B.1.617.20.000004
N215G215VgGtgTt4242B.1.5361
N215G215delGGT---3939AY.1180.002443
N215G215delGGT---3838AY.390.000939
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