CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = N : CodonNum = 139 & Codon = ttA

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
N139L139LsynttGttA17763650.20551828688-28690

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
N139L139LttGttA3651776All0.00007
N139L139LttGttA16528B.1.1.70.000014
N139L139LttGttA127127AY.1190.004484
N139L139LttGttA7071B.1.5880.063694
N139L139LttGttA3434AY.980.002686
N139L139LttGttA1824B.1.617.20.000068
N139L139LttGttA719AY.40.000011
N139L139LttGttA1215AY.250.000072
N139L139LttGttA313B.10.000027
N139L139LttGttA213B.1.10.000036
N139L139LttGttA513B.1.20.000044
N139L139LttGttA99AY.750.000504
N139L139LttGttA88B.1.1.370.001543
N139L139LttGttA37AY.440.000018
N139L139LttGttA77B.1.5260.000165
N139L139LttGttA35B.1.1770.00004
N139L139LttGttA55B.1.3110.001373
N139L139LttGttA45D.20.0003
N139L139LttGttA34AY.50.000062
N139L139LttGttA34B.1.1.250.001706
N139L139LttGttA24B.1.1.5190.000079
N139L139LttGttA33AY.290.000047
N139L139LttGttA13AY.30.00001
N139L139LttGttA33B.1.36.310.005254
N139L139LttGttA12AY.1030.000006
N139L139LttGttA12AY.470.000031
N139L139LttGttA12B.1.1.330.000421
N139L139LttGttA22B.1.2430.000139
N139L139LttGttA22P.20.000373
N139L139LttGttA110.055556
N139L139LttGttA11AY.1200.000037
N139L139LttGttA11AY.200.000039
N139L139LttGttA11AY.4.50.000107
N139L139LttGttA11AY.850.000427
N139L139LttGttA11B.1.1.4000.05
N139L139LttGttA11B.1.1600.000031
N139L139LttGttA11B.1.4290.000024
N139L139LttGttA11B.1.617.10.000129
N139L139LttGttA11R.10.00009