CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = M : Mut = L90L

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
M90L90LsynTtgCtg3432100.61224526790-26792
M90L90LsynttGttA3431330.38775526790-26792

Details of the mutation L90L within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
M90L90LTtgCtg210343All0.00004
M90L90LttGttA133343All0.000025
M90L90LTtgCtg8989B.1.1600.002776
M90L90LttGttA3843B.1.1.70.000034
M90L90LTtgCtg543B.1.1.70.000004
M90L90LttGttA1822AY.440.00011
M90L90LTtgCtg422AY.440.000024
M90L90LttGttA1519B.1.2580.000998
M90L90LTtgCtg419B.1.2580.000266
M90L90LTtgCtg1418B.1.617.20.000053
M90L90LttGttA418B.1.617.20.000015
M90L90LTtgCtg1215AY.30.000119
M90L90LttGttA315AY.30.00003
M90L90LttGttA1015AY.40.000016
M90L90LTtgCtg515AY.40.000008
M90L90LTtgCtg1212B.1.160.200.107143
M90L90LTtgCtg610AY.430.000027
M90L90LttGttA410AY.430.000018
M90L90LTtgCtg1010B.1.20.000088
M90L90LTtgCtg68B.10.000055
M90L90LttGttA28B.10.000018
M90L90LttGttA88B.1.5260.000188
M90L90LTtgCtg77AY.1210.000947
M90L90LTtgCtg67B.1.6210.000531
M90L90LttGttA17B.1.6210.000089
M90L90LttGttA34AY.1020.00008
M90L90LTtgCtg14AY.1020.000027
M90L90LTtgCtg44AY.250.000024
M90L90LttGttA23AY.1030.000012
M90L90LTtgCtg13AY.1030.000006
M90L90LttGttA33AY.46.60.000217
M90L90LTtgCtg33AY.850.001282
M90L90LTtgCtg23B.1.10.000036
M90L90LttGttA13B.1.10.000018
M90L90LttGttA33P.10.000047
M90L90LttGttA22AY.10.000791
M90L90LTtgCtg22AY.1200.000074
M90L90LTtgCtg22AY.75.10.000361
M90L90LTtgCtg22B.1.2210.000142
M90L90LTtgCtg11AY.1060.000335
M90L90LttGttA11AY.1190.000035
M90L90LTtgCtg11AY.120.10.000321
M90L90LttGttA11AY.260.000028
M90L90LTtgCtg11AY.270.000065
M90L90LttGttA11AY.3.10.000085
M90L90LTtgCtg11AY.390.000025
M90L90LttGttA11AY.50.000021
M90L90LTtgCtg11AY.5.30.000337
M90L90LttGttA11AY.540.000095
M90L90LttGttA11AY.550.000917
M90L90LttGttA11AY.680.000274
M90L90LTtgCtg11AY.750.000056
M90L90LttGttA11AY.9.20.000037
M90L90LttGttA11AY.990.001049
M90L90LTtgCtg11B0.000128
M90L90LTtgCtg11B.1.1.2070.001182
M90L90LttGttA11B.1.1.280.000311
M90L90LTtgCtg11B.1.160.70.002079
M90L90LTtgCtg11B.1.1770.000013
M90L90LttGttA11B.1.177.210.000076
M90L90LTtgCtg11B.1.3260.007576
M90L90LttGttA11B.1.3340.018182
M90L90LttGttA11B.1.351.50.0006
M90L90LttGttA11B.1.360.000146
M90L90LttGttA11B.1.36.350.002604
M90L90LttGttA11B.1.4290.000024
M90L90LTtgCtg11B.40.002208
M90L90LTtgCtg11B.400.000364