CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = M : Mut = L138L

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
M138L138LsynctCctT10357102170.98648326934-26936
M138L138LsynctCctA103571180.011393326934-26936
M138L138LsynctCctG10357220.0021241726934-26936

Details of the mutation L138L within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
M138L138LctCctT1021710357All0.001954
M138L138LctCctA11810357All0.000023
M138L138LctCctG2210357All0.000004
M138L138LctCctT35933620B.1.1.70.003217
M138L138LctCctA203620B.1.1.70.000018
M138L138LctCctG73620B.1.1.70.000006
M138L138LctCctT854885B.1.617.20.003216
M138L138LctCctA31885B.1.617.20.000117
M138L138LctCctT713722AY.430.003159
M138L138LctCctA9722AY.430.00004
M138L138LctCctT415415AY.80.251515
M138L138LctCctT338338B.1.10.006132
M138L138LctCctT320320B.1.177.481
M138L138LctCctT313315AY.30.003113
M138L138LctCctA2315AY.30.00002
M138L138LctCctT274281AY.40.000426
M138L138LctCctG4281AY.40.000006
M138L138LctCctA3281AY.40.000005
M138L138LctCctT215218AY.1030.001335
M138L138LctCctG2218AY.1030.000012
M138L138LctCctA1218AY.1030.000006
M138L138LctCctT124132AY.440.000755
M138L138LctCctA8132AY.440.000049
M138L138LctCctT113114P.10.00178
M138L138LctCctG1114P.10.000016
M138L138LctCctT94107B.1.20.000828
M138L138LctCctA13107B.1.20.000114
M138L138LctCctT102102AY.420.004103
M138L138LctCctT101102B.1.3510.003002
M138L138LctCctA1102B.1.3510.00003
M138L138LctCctT7282B.10.000659
M138L138LctCctA1082B.10.000092
M138L138LctCctT8181B.1.1770.001067
M138L138LctCctT7676AY.7.20.042506
M138L138LctCctT7575AY.4.50.008062
M138L138LctCctT7373AY.46.10.074949
M138L138LctCctT7272AY.1020.001909
M138L138LctCctT7272AY.390.001779
M138L138LctCctT7272AY.460.007494
M138L138LctCctT6868AY.610.007125
M138L138LctCctT6868AY.98.10.003293
M138L138LctCctT6666AY.340.0064
M138L138LctCctT6565B.1.1.2620.984848
M138L138LctCctT6161B.1.1600.001902
M138L138LctCctT6161B.1.177.860.011191
M138L138LctCctT4956AY.250.000295
M138L138LctCctG556AY.250.00003
M138L138LctCctA256AY.250.000012
M138L138LctCctT5555AY.1200.002045
M138L138LctCctT5555B.1.2390.067155
M138L138LctCctT5252AY.200.002021
M138L138LctCctT5151AY.5.40.014112
M138L138LctCctT4949B.1.177.730.027746
M138L138LctCctT4545AY.1160.012905
M138L138LctCctT4141B.1.5740.088172
M138L138LctCctT3939AY.710.018527
M138L138LctCctT3838B.1.5260.000893
M138L138LctCctT3434AY.50.000702
M138L138LctCctT3434B.1.1.2650.107256
M138L138LctCctT3333B.1.5760.029918
M138L138LctCctT3232B.1.4290.000753
M138L138LctCctT3131AY.46.60.002238
M138L138LctCctT3131AY.9.20.001139
M138L138LctCctT3030B.1.1.720.909091
M138L138LctCctT3030B.1.4000.01287
M138L138LctCctT2929AY.330.001937
M138L138LctCctT2727AY.75.10.004868
M138L138LctCctT2626AY.9.10.002177
M138L138LctCctT2424B.1.4270.001212
M138L138LctCctT2323A.10.006483
M138L138LctCctT1919B.1.1.280.005913
M138L138LctCctT1919B.1.5960.001656
M138L138LctCctT1515AY.470.000467
M138L138LctCctT1515P.1.10.004765
M138L138LctCctT1314AY.260.000368
M138L138LctCctA114AY.260.000028
M138L138LctCctT1414AY.4.20.000304
M138L138LctCctT1414B.1.1.5190.000556
M138L138LctCctT1113AY.1190.000388
M138L138LctCctA113AY.1190.000035
M138L138LctCctG113AY.1190.000035
M138L138LctCctT1313AY.920.003735
M138L138LctCctT1313B.1.1.390.006626
M138L138LctCctT1313B.1.2580.000865
M138L138LctCctT1313B.1.5900.059091
M138L138LctCctT1313C.36.30.007374
M138L138LctCctT1212AY.1170.001014
M138L138LctCctT1212AY.530.00345
M138L138LctCctT1112B0.001406
M138L138LctCctA112B0.000128
M138L138LctCctT1212B.1.4430.056075
M138L138LctCctT1012B.1.5250.001132
M138L138LctCctG212B.1.5250.000226
M138L138LctCctT1111AY.1000.000506
M138L138LctCctT1011AY.290.000158
M138L138LctCctA111AY.290.000016
M138L138LctCctT1111AY.5.30.003711
M138L138LctCctT811AY.840.0035
M138L138LctCctA311AY.840.001312
M138L138LctCctT1010AY.450.001217
M138L138LctCctT1010B.1.36.180.004202
M138L138LctCctT1010P.1.140.000478
M138L138LctCctT99AY.1060.003014
M138L138LctCctT99AY.230.000628
M138L138LctCctT99AY.680.002464
M138L138LctCctT99AY.700.001877
M138L138LctCctT99AY.750.000504
M138L138LctCctT99B.1.3110.002471
M138L138LctCctT88AY.1130.001139
M138L138LctCctT88AY.3.10.000682
M138L138LctCctT88AY.620.003486
M138L138LctCctT88AY.670.003714
M138L138LctCctT88AY.980.000632
M138L138LctCctT88B.1.1.4340.002788
M138L138LctCctT47AY.360.000593
M138L138LctCctA37AY.360.000445
M138L138LctCctT77B.1.1.3180.002112
M138L138LctCctT77B.1.1.630.002701
M138L138LctCctT77B.1.617.10.000903
M138L138LctCctT77P.1.160.002619
M138L138LctCctT66AY.1110.001099
M138L138LctCctT66AY.39.10.000238
M138L138LctCctT66AY.410.001764
M138L138LctCctT66AY.540.000572
M138L138LctCctT66AY.60.000247
M138L138LctCctT66AY.690.00112
M138L138LctCctT66B.1.1.2980.005172
M138L138LctCctT66B.1.177.570.001686
M138L138LctCctT66B.1.177.810.001136
M138L138LctCctT66B.1.2210.000426
M138L138LctCctT66B.1.2430.000418
M138L138LctCctT66B.1.360.000875
M138L138LctCctT66B.1.6370.000438
M138L138LctCctT66Q.10.000758
M138L138LctCctT66R.10.00054
M138L138LctCctT55AY.160.001898
M138L138LctCctT55AY.4.2.10.000745
M138L138LctCctT55B.1.1.4090.014164
M138L138LctCctT55B.1.258.170.00052
M138L138LctCctT55B.1.5610.001985
M138L138LctCctT55C.370.00058
M138L138LctCctT44AY.240.001724
M138L138LctCctT34AY.270.000194
M138L138LctCctA14AY.270.000065
M138L138LctCctA24AY.34.10.00102
M138L138LctCctT24AY.34.10.00102
M138L138LctCctT44AY.380.001997
M138L138LctCctT44AY.510.003636
M138L138LctCctT44B.1.2790.002054
M138L138LctCctT44B.1.5170.001708
M138L138LctCctT44B.1.5360.095238
M138L138LctCctT44B.1.5950.001044
M138L138LctCctT33AY.120.000948
M138L138LctCctT33AY.130.000483
M138L138LctCctT33AY.16.10.00141
M138L138LctCctT33AY.20.001068
M138L138LctCctT33AY.29.10.000662
M138L138LctCctT33AY.580.002722
M138L138LctCctT33AY.590.001589
M138L138LctCctT33AY.650.001599
M138L138LctCctT33AY.70.000588
M138L138LctCctT33B.1.1.1610.010601
M138L138LctCctT33B.1.1.2040.009119
M138L138LctCctT33B.1.1.2220.000612
M138L138LctCctT33B.1.1.4320.003797
M138L138LctCctT33B.1.1.5260.010638
M138L138LctCctT33B.1.177.320.004049
M138L138LctCctT33B.1.36.290.001552
M138L138LctCctT33B.1.3960.002117
M138L138LctCctT33B.1.5750.00091
M138L138LctCctT33B.1.5780.053571
M138L138LctCctT33B.1.6210.000266
M138L138LctCctT33B.260.044118
M138L138LctCctT33B.400.001093
M138L138LctCctT33P.1.100.000808
M138L138LctCctT33P.1.120.001452
M138L138LctCctT22AY.140.000176
M138L138LctCctT22AY.320.001065
M138L138LctCctA12AY.520.000814
M138L138LctCctT12AY.520.000814
M138L138LctCctT22AY.560.00321
M138L138LctCctT22AY.730.001331
M138L138LctCctA12AY.90.000068
M138L138LctCctT12AY.90.000068
M138L138LctCctT22AY.99.20.000184
M138L138LctCctT22B.1.1.10.000653
M138L138LctCctT22B.1.1.100.00223
M138L138LctCctT22B.1.1.2140.000111
M138L138LctCctT22B.1.1.370.000386
M138L138LctCctT22B.1.1.80.007168
M138L138LctCctT22B.1.177.120.000303
M138L138LctCctA12B.1.177.150.000631
M138L138LctCctT12B.1.177.150.000631
M138L138LctCctT22B.1.177.40.000422
M138L138LctCctT22B.1.177.50.002484
M138L138LctCctT22B.1.177.750.002081
M138L138LctCctT22B.1.36.190.018519
M138L138LctCctT22B.1.4040.002604
M138L138LctCctT22B.1.4280.002041
M138L138LctCctT22B.1.466.20.000782
M138L138LctCctT22B.1.5970.009259
M138L138LctCctT22C.130.051282
M138L138LctCctT22C.37.10.005236
M138L138LctCctT22D.20.00015
M138L138LctCctA11A0.000387
M138L138LctCctT11A.20.000662
M138L138LctCctT11A.2.40.003367
M138L138LctCctT11A.2.50.000499
M138L138LctCctT11A.23.10.000704
M138L138LctCctT11AA.80.022222
M138L138LctCctT11AY.1010.00049
M138L138LctCctT11AY.1080.001103
M138L138LctCctT11AY.1180.000063
M138L138LctCctT11AY.120.2.10.000498
M138L138LctCctT11AY.210.001898
M138L138LctCctT11AY.23.10.000417
M138L138LctCctT11AY.480.000465
M138L138LctCctT11AY.570.000656
M138L138LctCctT11AY.630.000387
M138L138LctCctT11AY.7.10.000113
M138L138LctCctT11AY.760.004831
M138L138LctCctT11AY.970.001701
M138L138LctCctT11B.1.1.1590.004673
M138L138LctCctT11B.1.1.1700.001247
M138L138LctCctT11B.1.1.2190.005
M138L138LctCctT11B.1.1.250.000569
M138L138LctCctT11B.1.1.3060.000438
M138L138LctCctT11B.1.1.3700.012658
M138L138LctCctT11B.1.1.400.034483
M138L138LctCctT11B.1.1.4860.001577
M138L138LctCctT11B.1.1.5120.028571
M138L138LctCctT11B.1.1.5160.066667
M138L138LctCctT11B.1.1.5240.020833
M138L138LctCctT11B.1.1.5280.004808
M138L138LctCctT11B.1.1.700.000341
M138L138LctCctT11B.1.1.740.00431
M138L138LctCctT11B.1.1080.005814
M138L138LctCctT11B.1.1570.002985
M138L138LctCctT11B.1.160.280.002924
M138L138LctCctT11B.1.160.300.002976
M138L138LctCctT11B.1.177.210.000076
M138L138LctCctT11B.1.177.510.004566
M138L138LctCctT11B.1.2060.000816
M138L138LctCctT11B.1.214.20.0006
M138L138LctCctT11B.1.220.001318
M138L138LctCctT11B.1.2340.000132
M138L138LctCctT11B.1.2370.004975
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