CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = M : CodonNum = 93 & Codon = ctT

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
M93L93LsynctCctT195375261750.13397326799-26801

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
M93L93LctCctT26175195375All0.005006
M93L93LctCctT17575226B.1.1770.002304
M93L93LctCctT312570B.1.177.210.000229
M93L93LctCctT16576B.1.177.120.000152
M93L93LctCctT55979B.1.177.70.000824
M93L93LctCctT53565376B.1.177.860.982572
M93L93LctCctT15274B.1.177.810.000189
M93L93LctCctT64736B.1.177.40.001266
M93L93LctCctT13557B.1.177.570.000281
M93L93LctCctT33853520B.1.1.70.00303
M93L93LctCctT31833184AY.250.019145
M93L93LctCctT19771993AY.40.003077
M93L93LctCctT11875B.1.177.440.000519
M93L93LctCctT5811676B.10.005322
M93L93LctCctT11580B.1.177.150.000631
M93L93LctCctT13551355B.1.4000.581296
M93L93LctCctT41283B.1.177.730.002265
M93L93LctCctT11210B.1.177.170.000821
M93L93LctCctT2994B.1.177.60.001953
M93L93LctCctT782824B.1.617.20.002945
M93L93LctCctT1738B.1.177.320.00135
M93L93LctCctT624624B.1.160.80.804124
M93L93LctCctT585590AY.440.003561
M93L93LctCctT419484AY.1030.002602
M93L93LctCctT451454AY.430.001998
M93L93LctCctT48429B.1.177.550.111888
M93L93LctCctT230395B.1.10.004172
M93L93LctCctT393393B.1.5260.009237
M93L93LctCctT354378B.1.20.003117
M93L93LctCctT357357AY.3.10.030437
M93L93LctCctT1314Z.10.00289
M93L93LctCctT3300B.1.177.230.009709
M93L93LctCctT299299AY.50.006174
M93L93LctCctT292295P.10.0046
M93L93LctCctT288290AY.200.011193
M93L93LctCctT273273B.1.1.5190.010841
M93L93LctCctT262262B.1.6370.019145
M93L93LctCctT231232B.1.3510.006867
M93L93LctCctT22220B.1.177.20.1
M93L93LctCctT114177B.1.2210.008098
M93L93LctCctT165165B.1.160.240.730088
M93L93LctCctT79159B.1.1600.002464
M93L93LctCctT152152AY.390.003756
M93L93LctCctT150150B.1.4290.003529
M93L93LctCctT35139B.1.2580.002329
M93L93LctCctT125126AY.30.001243
M93L93LctCctT111112B.1.1.3170.045698
M93L93LctCctT15107AY.1200.000558
M93L93LctCctT100107B.1.2400.021556
M93L93LctCctT65106AY.230.004534
M93L93LctCctT104104AY.260.002944
M93L93LctCctT9292B.1.36.360.055388
M93L93LctCctT8586B.1.2430.005915
M93L93LctCctT8282AY.98.10.003971
M93L93LctCctT7777B.1.5250.008713
M93L93LctCctT7373AY.290.001151
M93L93LctCctT7272AY.1020.001909
M93L93LctCctT7272AY.470.00224
M93L93LctCctT7070B.1.36.180.029412
M93L93LctCctT6365B.1.5960.00549
M93L93LctCctT6464B.1.400.10.969697
M93L93LctCctT5656AY.1190.001977
M93L93LctCctT5656B.1.1.4290.258065
M93L93LctCctT5454B.1.3480.981818
M93L93LctCctT2954B.1.360.004231
M93L93LctCctT5051B.1.1260.063776
M93L93LctCctT4647AY.4.20.000998
M93L93LctCctT4546AY.60.001851
M93L93LctCctT4545B.1.1.3020.093361
M93L93LctCctT4444B.1.1.3430.916667
M93L93LctCctT4343AY.39.10.001703
M93L93LctCctT4142AY.670.019034
M93L93LctCctT3636AY.1000.001656
M93L93LctCctT3636AY.1180.002255
M93L93LctCctT3535C.36.30.019853
M93L93LctCctT3335D.20.002476
M93L93LctCctT3333AY.9.20.001212
M93L93LctCctT3333B.1.1.330.013889
M93L93LctCctT3333B.1.6230.017704
M93L93LctCctT2929B.1.2340.003826
M93L93LctCctT2929B.1.4270.001464
M93L93LctCctT2828AY.330.00187
M93L93LctCctT2727AY.420.001086
M93L93LctCctT2626AY.1090.019231
M93L93LctCctT2526AY.130.004024
M93L93LctCctT2626AY.360.003854
M93L93LctCctT2626AY.4.50.002795
M93L93LctCctT2526AY.750.001401
M93L93LctCctT2526B.1.1.3850.111607
M93L93LctCctT2424AY.980.001896
M93L93LctCctT2424B.1.1.1290.220183
M93L93LctCctT2424B.1.1.2140.001331
M93L93LctCctT2324Q.30.003336
M93L93LctCctT2323B.1.9.50.130682
M93L93LctCctT1822B.1.160.160.016729
M93L93LctCctT2020AY.46.40.00329
M93L93LctCctT2020AY.740.002313
M93L93LctCctT2020B.1.1390.014663
M93L93LctCctT1919AY.540.001812
M93L93LctCctT1919B.1.6210.001682
M93L93LctCctT1919Q.80.003133
M93L93LctCctT218B.1.1.390.001019
M93L93LctCctT1717C.160.018028
M93L93LctCctT1617Q.10.002021
M93L93LctCctT1616AY.1170.001352
M93L93LctCctT1616AZ.20.013136
M93L93LctCctT616B0.000767
M93L93LctCctT1616B.1.1.3060.007014
M93L93LctCctT1116B.1.1.370.002122
M93L93LctCctT1616B.1.5640.006814
M93L93LctCctT1616B.1.5800.065041
M93L93LctCctT1515AY.450.001825
M93L93LctCctT1515B.1.4970.004721
M93L93LctCctT1414AY.920.004022
M93L93LctCctT1414AY.99.20.00129
M93L93LctCctT1414P.1.140.000669
M93L93LctCctT1313AY.1060.004354
M93L93LctCctT1012AY.270.000647
M93L93LctCctT1112AY.460.001145
M93L93LctCctT1112AY.90.000744
M93L93LctCctT1212B.1.2650.015248
M93L93LctCctT1212B.1.3960.008469
M93L93LctCctT1111AY.140.000968
M93L93LctCctT911P.20.00168
M93L93LctCctT710B.1.1.4640.010309
M93L93LctCctT1010B.1.4040.013021
M93L93LctCctT1010B.1.5610.00397
M93L93LctCctT1010P.1.150.002323
M93L93LctCctT99AY.1100.001014
M93L93LctCctT99AY.1140.00208
M93L93LctCctT99B.1.1.3480.007166
M93L93LctCctT29B.1.1.700.000682
M93L93LctCctT99B.1.2790.004622
M93L93LctCctT99B.1.36.10.010262
M93L93LctCctT59B.1.5090.004329
M93L93LctCctT89B.1.5750.002427
M93L93LctCctT89B.1.5950.002088
M93L93LctCctT99C.140.038961
M93L93LctCctT78A.2.50.003493
M93L93LctCctT88B.1.1.4340.002788
M93L93LctCctT88B.1.2060.006525
M93L93LctCctT38B.1.258.110.001189
M93L93LctCctT68B.1.258.170.000624
M93L93LctCctT88B.1.258.30.0134
M93L93LctCctT78B.1.6090.003356
M93L93LctCctT88B.4.10.150943
M93L93LctCctT88P.1.100.002156
M93L93LctCctT88R.10.00072
M93L93LctCctT270.111111
M93L93LctCctT77AY.1050.004502
M93L93LctCctT77AY.610.000733
M93L93LctCctT77B.1.1.2280.021341
M93L93LctCctT77B.1.36.290.003621
M93L93LctCctT27B.1.36.390.004435
M93L93LctCctT56AD.20.001095
M93L93LctCctT66B.1.1.2840.000644
M93L93LctCctT66B.1.1.3180.001811
M93L93LctCctT16B.1.416.10.001563
M93L93LctCctT66C.10.014354
M93L93LctCctT66C.370.000696
M93L93LctCctT55AY.1110.000916
M93L93LctCctT55AY.340.000485
M93L93LctCctT45B.1.1.10.001307
M93L93LctCctT15B.1.1.1700.001247
M93L93LctCctT55B.1.1.2220.00102
M93L93LctCctT55B.1.1.280.001556
M93L93LctCctT55B.1.1.3160.004625
M93L93LctCctT55B.1.1.4870.027933
M93L93LctCctT55B.1.5580.022831
M93L93LctCctT45B.1.617.10.000516
M93L93LctCctT44AY.100.00212
M93L93LctCctT44AY.1210.000541
M93L93LctCctT44AY.16.10.00188
M93L93LctCctT44AY.300.001583
M93L93LctCctT44AY.4.2.10.000596
M93L93LctCctT44AY.5.30.00135
M93L93LctCctT44AY.680.001095
M93L93LctCctT44AY.700.000834
M93L93LctCctT44AY.9.10.000335
M93L93LctCctT44B.1.1.2310.012384
M93L93LctCctT44B.1.1.3260.007042
M93L93LctCctT34B.1.1.3720.002066
M93L93LctCctT44B.1.1470.003023
M93L93LctCctT44B.1.1940.16
M93L93LctCctT14B.1.2410.000812
M93L93LctCctT44B.1.351.20.00121
M93L93LctCctT44B.1.3660.019512
M93L93LctCctT44B.1.3690.001141
M93L93LctCctT44B.1.4280.004082
M93L93LctCctT24B.1.5170.000854
M93L93LctCctT44B.1.517.10.021053
M93L93LctCctT44B.1.5680.004444
M93L93LctCctT44B.3.10.006633
M93L93LctCctT24P.1.120.000968
M93L93LctCctT44P.1.170.000647
M93L93LctCctT44P.1.70.001277
M93L93LctCctT13A0.000387
M93L93LctCctT33AY.1070.001398
M93L93LctCctT33AY.1130.000427
M93L93LctCctT33AY.46.10.00308
M93L93LctCctT33AY.46.60.000217
M93L93LctCctT33AY.5.40.00083
M93L93LctCctT33AY.530.000863
M93L93LctCctT33AY.840.001312
M93L93LctCctT33B.1.1.1760.001318
M93L93LctCctT33B.1.1.1920.006928
M93L93LctCctT33B.1.1.2070.003546
M93L93LctCctT33B.1.1.2160.002671
M93L93LctCctT33B.1.1.2250.021583
M93L93LctCctT23B.1.1.250.001137
M93L93LctCctT33B.1.1.3510.00838
M93L93LctCctT33B.1.1.3690.001339
M93L93LctCctT33B.1.1.3890.018182
M93L93LctCctT33B.1.1.500.002037
M93L93LctCctT13B.1.1.5210.005348
M93L93LctCctT33B.1.3110.000824
M93L93LctCctT33B.1.3240.004815
M93L93LctCctT33B.1.3370.01676
M93L93LctCctT33B.1.36.160.004274
M93L93LctCctT13B.1.36.170.000494
M93L93LctCctT33B.1.4130.012766
M93L93LctCctT33B.1.5490.021583
M93L93LctCctT33B.1.5650.002431
M93L93LctCctT33B.1.5820.001472
M93L93LctCctT33B.1.619.10.001924
M93L93LctCctT33B.1.621.10.001517
M93L93LctCctT33C.360.002732
M93L93LctCctT33N.50.0053
M93L93LctCctT33P.1.130.002695
M93L93LctCctT33Q.40.001364
M93L93LctCctT12A.210.00277
M93L93LctCctT22A.30.004193
M93L93LctCctT22AY.1010.000981
M93L93LctCctT22AY.1160.000574
M93L93LctCctT22AY.116.10.000623
M93L93LctCctT22AY.20.000712
M93L93LctCctT22AY.240.000862
M93L93LctCctT22AY.29.10.000441
M93L93LctCctT22AY.34.10.00102
M93L93LctCctT22AY.370.000632
M93L93LctCctT22AY.46.20.001271
M93L93LctCctT22AY.46.50.000397
M93L93LctCctT22AY.490.00639
M93L93LctCctT22AY.600.001876
M93L93LctCctT22AY.650.001066
M93L93LctCctT22AY.75.10.000361
M93L93LctCctT22AY.880.001768
M93L93LctCctT22AY.910.001461
M93L93LctCctT22B.1.1.1600.047619
M93L93LctCctT12B.1.1.1890.001513
M93L93LctCctT22B.1.1.2630.003115
M93L93LctCctT22B.1.1.2740.010101
M93L93LctCctT22B.1.1.2850.013072
M93L93LctCctT22B.1.1.2910.001485
M93L93LctCctT22B.1.1.4060.012987
M93L93LctCctT22B.1.1.4330.002849
M93L93LctCctT22B.1.1.4350.068966
M93L93LctCctT22B.1.1.5070.017391
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