CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = M : CodonNum = 31 & Codon = tgT

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
M31W31CnonsyntgGtgT3113010.96784626613-26615

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
M31W31CtgGtgT301311All0.000058
M31W31CtgGtgT6767B.1.1.431
M31W31CtgGtgT6162B.1.1.70.000055
M31W31CtgGtgT2929AY.40.000045
M31W31CtgGtgT99AY.1000.000414
M31W31CtgGtgT99B.10.000082
M31W31CtgGtgT99B.1.1600.000281
M31W31CtgGtgT88AY.1030.00005
M31W31CtgGtgT88B.1.2400.001725
M31W31CtgGtgT88B.1.617.20.00003
M31W31CtgGtgT77AY.250.000042
M31W31CtgGtgT77B.1.258.170.000728
M31W31CtgGtgT55AY.200.000194
M31W31CtgGtgT55B.1.10.000091
M31W31CtgGtgT55P.10.000079
M31W31CtgGtgT34AY.1020.00008
M31W31CtgGtgT34AY.430.000013
M31W31CtgGtgT44B.1.110.30.002874
M31W31CtgGtgT44B.1.20.000035
M31W31CtgGtgT33AY.1190.000106
M31W31CtgGtgT33AY.440.000018
M31W31CtgGtgT33B.1.1770.00004
M31W31CtgGtgT33P.1.140.000143
M31W31CtgGtgT22AY.390.000049
M31W31CtgGtgT22AY.470.000062
M31W31CtgGtgT22AY.5.20.004926
M31W31CtgGtgT22B.1.1.2140.000111
M31W31CtgGtgT22B.1.1.990.047619
M31W31CtgGtgT22B.1.5260.000047
M31W31CtgGtgT22B.1.6190.001742
M31W31CtgGtgT110.055556
M31W31CtgGtgT11AY.29.10.000221
M31W31CtgGtgT11AY.30.00001
M31W31CtgGtgT11AY.34.10.00051
M31W31CtgGtgT11AY.4.20.000022
M31W31CtgGtgT11AY.46.60.000072
M31W31CtgGtgT11AY.740.000116
M31W31CtgGtgT11AY.9.20.000037
M31W31CtgGtgT11B0.000128
M31W31CtgGtgT11B.1.1.3180.000302
M31W31CtgGtgT11B.1.1.4200.001006
M31W31CtgGtgT11B.1.177.50.001242
M31W31CtgGtgT11B.1.177.560.000668
M31W31CtgGtgT11B.1.177.730.000566
M31W31CtgGtgT11B.1.2150.009615
M31W31CtgGtgT11B.1.2340.000132
M31W31CtgGtgT11B.1.2430.00007
M31W31CtgGtgT11B.1.360.000146
M31W31CtgGtgT11B.1.4270.00005
M31W31CtgGtgT11B.1.4290.000024
M31W31CtgGtgT11B.1.4560.003268
M31W31CtgGtgT11B.1.6210.000089
M31W31CtgGtgT11D.20.000075
M31W31CtgGtgT11P.1.150.000232