CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = M : CodonNum = 3 & Codon = gGt

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
M3D3GnonsyngAtgGt43544354126529-26531

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
M3D3GgAtgGt43544354All0.000833
M3D3GgAtgGt15481548B.10.014179
M3D3GgAtgGt15331533B.1.1280.973952
M3D3GgAtgGt449449B.1.1270.986813
M3D3GgAtgGt135135B.1.617.20.000508
M3D3GgAtgGt9999B.1.1.70.000089
M3D3GgAtgGt6363AY.440.000383
M3D3GgAtgGt5353B.1.961
M3D3GgAtgGt4040B.1.2050.952381
M3D3GgAtgGt3939B.1.1400.735849
M3D3GgAtgGt3939B.1.971
M3D3GgAtgGt3535AY.40.000054
M3D3GgAtgGt2323B.1.20.000203
M3D3GgAtgGt1818B.1.10.000327
M3D3GgAtgGt1717AY.1030.000106
M3D3GgAtgGt1515B.1.1770.000198
M3D3GgAtgGt1212B.1.3970.058252
M3D3GgAtgGt1111AY.430.000049
M3D3GgAtgGt1010AY.1020.000265
M3D3GgAtgGt99AY.250.000054
M3D3GgAtgGt88B.1.177.820.003819
M3D3GgAtgGt88P.10.000126
M3D3GgAtgGt77AY.390.000173
M3D3GgAtgGt77B.1.2410.005682
M3D3GgAtgGt66AY.270.000388
M3D3GgAtgGt66AY.98.10.000291
M3D3GgAtgGt66AY.99.20.000553
M3D3GgAtgGt55AY.130.000805
M3D3GgAtgGt55AY.30.00005
M3D3GgAtgGt55AY.400.004822
M3D3GgAtgGt55AY.9.20.000184
M3D3GgAtgGt55B.1.5820.002453
M3D3GgAtgGt44AY.200.000155
M3D3GgAtgGt44AY.470.000124
M3D3GgAtgGt44AY.540.000381
M3D3GgAtgGt44AY.590.002119
M3D3GgAtgGt44B0.000511
M3D3GgAtgGt44B.1.177.160.002658
M3D3GgAtgGt44B.1.2430.000278
M3D3GgAtgGt33AY.29.10.000662
M3D3GgAtgGt33AY.340.000291
M3D3GgAtgGt33AY.350.000699
M3D3GgAtgGt33AY.670.001393
M3D3GgAtgGt33AY.680.000821
M3D3GgAtgGt33AY.9.10.000251
M3D3GgAtgGt33B.1.1.3690.001339
M3D3GgAtgGt33B.1.1600.000094
M3D3GgAtgGt33B.1.2580.0002
M3D3GgAtgGt33B.1.6230.001609
M3D3GgAtgGt33B.1.80.005917
M3D3GgAtgGt22AY.260.000057
M3D3GgAtgGt22AY.330.000134
M3D3GgAtgGt22AY.420.00008
M3D3GgAtgGt22AY.750.000112
M3D3GgAtgGt22AY.80.001212
M3D3GgAtgGt22B.1.1.100.00223
M3D3GgAtgGt22B.1.1.4660.017391
M3D3GgAtgGt22B.1.160.140.004237
M3D3GgAtgGt22B.1.177.730.001133
M3D3GgAtgGt22B.1.3510.000059
M3D3GgAtgGt22B.1.36.180.00084
M3D3GgAtgGt22B.1.3910.002255
M3D3GgAtgGt11A0.000387
M3D3GgAtgGt11A.10.000282
M3D3GgAtgGt11AY.1000.000046
M3D3GgAtgGt11AY.1070.000466
M3D3GgAtgGt11AY.1130.000142
M3D3GgAtgGt11AY.1190.000035
M3D3GgAtgGt11AY.230.00007
M3D3GgAtgGt11AY.370.000316
M3D3GgAtgGt11AY.4.2.10.000149
M3D3GgAtgGt11AY.450.000122
M3D3GgAtgGt11AY.490.003195
M3D3GgAtgGt11AY.510.000909
M3D3GgAtgGt11AY.7.20.000559
M3D3GgAtgGt11AY.710.000475
M3D3GgAtgGt11AY.740.000116
M3D3GgAtgGt11AY.90.000068
M3D3GgAtgGt11B.1.1.2140.000055
M3D3GgAtgGt11B.1.1.2220.000204
M3D3GgAtgGt11B.1.1.250.000569
M3D3GgAtgGt11B.1.1.3010.001179
M3D3GgAtgGt11B.1.1.3060.000438
M3D3GgAtgGt11B.1.1.3180.000302
M3D3GgAtgGt11B.1.1.3710.010417
M3D3GgAtgGt11B.1.1.3720.000689
M3D3GgAtgGt11B.1.1.5190.00004
M3D3GgAtgGt11B.1.1260.001276
M3D3GgAtgGt11B.1.1570.002985
M3D3GgAtgGt11B.1.177.330.001645
M3D3GgAtgGt11B.1.2400.000216
M3D3GgAtgGt11B.1.2790.000514
M3D3GgAtgGt11B.1.2980.002114
M3D3GgAtgGt11B.1.3110.000275
M3D3GgAtgGt11B.1.350.008475
M3D3GgAtgGt11B.1.36.160.001425
M3D3GgAtgGt11B.1.3930.028571
M3D3GgAtgGt11B.1.3980.002976
M3D3GgAtgGt11B.1.4290.000024
M3D3GgAtgGt11B.1.4590.004082
M3D3GgAtgGt11B.1.5170.000427
M3D3GgAtgGt11B.1.5650.00081
M3D3GgAtgGt11B.1.5950.000261
M3D3GgAtgGt11B.1.5990.00365
M3D3GgAtgGt11B.1.6010.030303
M3D3GgAtgGt11B.1.619.10.000641
M3D3GgAtgGt11B.1.6210.000089
M3D3GgAtgGt11B.350.007812
M3D3GgAtgGt11C.36.30.000567
M3D3GgAtgGt11Q.80.000165