CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = M : CodonNum = 204

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
M204Y204YsyntaTtaC17161716127132-27134
M204Y204deldelTAT---201201127132-27134
M204Y204HnonsynTatCat9595127132-27134
M204Y204XnonsyntaTtaA3333127132-27134
M204Y204FnonsyntAttTt2525127132-27134
M204Y204del2delTAt--t19180.94736827132-27134
M204Y204del2deltATt--1910.052631627132-27134
M204Y204del1deltaTta-1111127132-27134
M204Y204CnonsyntAttGt99127132-27134
M204Y204LnonsynTATCTA320.66666727132-27134
M204Y204NnonsynTatAat320.66666727132-27134
M204Y204LnonsynTAtCTt310.33333327132-27134
M204Y204NnonsynTaTAaC310.33333327132-27134
M204Y204SnonsyntAttCt22127132-27134
M204Y204QnonsynTaTCaG22127132-27134
M204Y204DnonsynTatGat210.527132-27134
M204Y204DnonsynTaTGaC210.527132-27134

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
M204Y204YtaTtaC17161716All0.000328
M204Y204YtaTtaC927927B.1.1.3330.997847
M204Y204YtaTtaC371371B.1.1.70.000332
M204Y204delTAT---201201All0.000038
M204Y204delTAT---147147B.1.177.210.011241
M204Y204HTatCat9595All0.000018
M204Y204YtaTtaC4444B.1.5250.004979
M204Y204YtaTtaC4343B.1.3490.030736
M204Y204XtaTtaA3333All0.000006
M204Y204YtaTtaC3131AY.40.000048
M204Y204YtaTtaC3030P.10.000473
M204Y204FtAttTt2525All0.000005
M204Y204delTAT---2222B.1.1.70.00002
M204Y204del2TAt--t1819All0.000003
M204Y204del2tATt--119All0
M204Y204YtaTtaC1919B.1.10.000345
M204Y204HTatCat1717AY.40.000026
M204Y204YtaTtaC1717B.1.617.20.000064
M204Y204YtaTtaC1616AY.440.000097
M204Y204YtaTtaC1515AY.1030.000093
M204Y204YtaTtaC1414AY.260.000396
M204Y204YtaTtaC1313AY.30.000129
M204Y204YtaTtaC1313B.1.177.860.002385
M204Y204del1taTta-1111All0.000002
M204Y204YtaTtaC1111AY.250.000066
M204Y204HTatCat1010B.1.1.70.000009
M204Y204CtAttGt99All0.000002
M204Y204HTatCat99B.10.000082
M204Y204HTatCat77AY.250.000042
M204Y204HTatCat77AY.440.000043
M204Y204YtaTtaC77AY.750.000392
M204Y204FtAttTt77B.1.10.000127
M204Y204HTatCat77B.1.1600.000218
M204Y204HTatCat77B.1.617.20.000026
M204Y204FtAttTt66AY.40.000009
M204Y204YtaTtaC66AY.430.000027
M204Y204del2TAt--t66B.10.000055
M204Y204YtaTtaC66B.1.1.510.010309
M204Y204YtaTtaC66B.1.1770.000079
M204Y204YtaTtaC66B.1.20.000053
M204Y204YtaTtaC66B.1.5960.000523
M204Y204YtaTtaC55AY.1190.000177
M204Y204YtaTtaC55AY.1210.000677
M204Y204HTatCat55AY.330.000334
M204Y204YtaTtaC55AY.4.20.000108
M204Y204YtaTtaC55AY.610.000524
M204Y204delTAT---55B.10.000046
M204Y204XtaTtaA55B.10.000046
M204Y204YtaTtaC55B.1.5260.000118
M204Y204YtaTtaC44AY.1020.000106
M204Y204YtaTtaC44AY.290.000063
M204Y204CtAttGt44AY.40.000006
M204Y204YtaTtaC44AY.50.000083
M204Y204YtaTtaC44B.10.000037
M204Y204YtaTtaC44B.1.160.260.009685
M204Y204LTATCTA23All0
M204Y204NTatAat23All0
M204Y204LTAtCTt13All0
M204Y204NTaTAaC13All0
M204Y204YtaTtaC33AY.1000.000138
M204Y204YtaTtaC33AY.1180.000188
M204Y204YtaTtaC33AY.330.0002
M204Y204delTAT---33AY.430.000013
M204Y204YtaTtaC33B.1.1.5190.000119
M204Y204XtaTtaA33B.1.20.000026
M204Y204XtaTtaA33B.1.617.20.000011
M204Y204QTaTCaG22All0
M204Y204StAttCt22All0
M204Y204DTaTGaC12All0
M204Y204DTatGat12All0
M204Y204HTatCat22AY.1200.000074
M204Y204XtaTtaA22AY.270.000129
M204Y204HTatCat22AY.290.000032
M204Y204HTatCat22AY.30.00002
M204Y204delTAT---22AY.390.000049
M204Y204YtaTtaC22AY.390.000049
M204Y204XtaTtaA22AY.40.000003
M204Y204del2TAt--t22AY.40.000003
M204Y204delTAT---22AY.40.000003
M204Y204YtaTtaC22AY.470.000062
M204Y204YtaTtaC22AY.530.000575
M204Y204YtaTtaC22AY.90.000135
M204Y204YtaTtaC22AY.920.000575
M204Y204XtaTtaA22B.1.10.000036
M204Y204QTaTCaG22B.1.1.280.000622
M204Y204del2TAt--t22B.1.1.70.000002
M204Y204XtaTtaA22B.1.1.70.000002
M204Y204FtAttTt22B.1.1.70.000002
M204Y204del2TAt--t22B.1.1770.000026
M204Y204delTAT---22B.1.20.000018
M204Y204XtaTtaA22B.1.2210.000142
M204Y204YtaTtaC22B.1.2580.000133
M204Y204delTAT---22B.1.3510.000059
M204Y204YtaTtaC22B.1.4000.000858
M204Y204delTAT---22B.1.4290.000047
M204Y204YtaTtaC22B.1.438.10.000215
M204Y204CtAttGt22B.1.617.20.000008
M204Y204delTAT---22B.1.617.20.000008
M204Y204YtaTtaC22Q.10.000253
M204Y204HTatCat110.055556
M204Y204FtAttTt110.055556
M204Y204LTAtCTt110.055556
M204Y204delTAT---11A0.000387
M204Y204YtaTtaC11A.120.166667
M204Y204YtaTtaC11AD.20.000219
M204Y204XtaTtaA11AU.10.001266
M204Y204delTAT---11AU.30.00211
M204Y204delTAT---11AY.1000.000046
M204Y204del1taTta-11AY.1000.000046
M204Y204FtAttTt11AY.1020.000027
M204Y204delTAT---11AY.1020.000027
M204Y204del2TAt--t11AY.1030.000006
M204Y204StAttCt11AY.1030.000006
M204Y204HTatCat11AY.1060.000335
M204Y204YtaTtaC11AY.1080.001103
M204Y204YtaTtaC11AY.1110.000183
M204Y204XtaTtaA11AY.1140.000231
M204Y204HTatCat11AY.1170.000085
M204Y204del1taTta-11AY.1190.000035
M204Y204delTAT---11AY.1200.000037
M204Y204HTatCat11AY.130.000161
M204Y204YtaTtaC11AY.140.000088
M204Y204YtaTtaC11AY.200.000039
M204Y204HTatCat11AY.200.000039
M204Y204HTatCat11AY.230.00007
M204Y204XtaTtaA11AY.230.00007
M204Y204YtaTtaC11AY.23.10.000417
M204Y204StAttCt11AY.250.000006
M204Y204XtaTtaA11AY.250.000006
M204Y204delTAT---11AY.250.000006
M204Y204del1taTta-11AY.260.000028
M204Y204XtaTtaA11AY.30.00001
M204Y204DTaTGaC11AY.30.00001
M204Y204XtaTtaA11AY.3.10.000085
M204Y204FtAttTt11AY.330.000067
M204Y204del1taTta-11AY.340.000097
M204Y204YtaTtaC11AY.350.000233
M204Y204YtaTtaC11AY.370.000316
M204Y204XtaTtaA11AY.390.000025
M204Y204CtAttGt11AY.4.2.10.000149
M204Y204YtaTtaC11AY.400.000964
M204Y204HTatCat11AY.420.00004
M204Y204YtaTtaC11AY.420.00004
M204Y204DTatGat11AY.430.000004
M204Y204CtAttGt11AY.430.000004
M204Y204HTatCat11AY.430.000004
M204Y204CtAttGt11AY.440.000006
M204Y204FtAttTt11AY.440.000006
M204Y204XtaTtaA11AY.440.000006
M204Y204delTAT---11AY.46.40.000165
M204Y204HTatCat11AY.46.60.000072
M204Y204del1taTta-11AY.470.000031
M204Y204delTAT---11AY.470.000031
M204Y204del2TAt--t11AY.470.000031
M204Y204HTatCat11AY.480.000465
M204Y204HTatCat11AY.50.000021
M204Y204delTAT---11AY.520.000814
M204Y204YtaTtaC11AY.60.000041
M204Y204XtaTtaA11AY.620.000436
M204Y204YtaTtaC11AY.670.000464
M204Y204YtaTtaC11AY.70.000196
M204Y204LTATCTA11AY.710.000475
M204Y204HTatCat11AY.710.000475
M204Y204YtaTtaC11AY.740.000116
M204Y204delTAT---11AY.99.20.000092
M204Y204HTatCat11AY.99.20.000092
M204Y204del1taTta-11B0.000128
M204Y204HTatCat11B0.000128
M204Y204NTatAat11B.10.000009
M204Y204del1taTta-11B.10.000009
M204Y204del1taTta-11B.1.10.000018
M204Y204del2TAt--t11B.1.10.000018
M204Y204HTatCat11B.1.10.000018
M204Y204HTatCat11B.1.1.1230.017857
M204Y204YtaTtaC11B.1.1.2070.001182
M204Y204YtaTtaC11B.1.1.2260.005814
M204Y204del2tATt--11B.1.1.250.000569
M204Y204YtaTtaC11B.1.1.2630.001558
M204Y204YtaTtaC11B.1.1.280.000311
M204Y204YtaTtaC11B.1.1.2860.002899
M204Y204YtaTtaC11B.1.1.3170.000412
M204Y204YtaTtaC11B.1.1.3180.000302
M204Y204NTatAat11B.1.1.4090.002833
M204Y204XtaTtaA11B.1.1600.000031
M204Y204YtaTtaC11B.1.1600.000031
M204Y204YtaTtaC11B.1.160.150.00495
M204Y204YtaTtaC11B.1.1730.026316
M204Y204HTatCat11B.1.1770.000013
M204Y204FtAttTt11B.1.1770.000013
M204Y204YtaTtaC11B.1.177.210.000076
M204Y204NTaTAaC11B.1.177.210.000076
M204Y204FtAttTt11B.1.177.210.000076
M204Y204del1taTta-11B.1.177.70.000165
M204Y204FtAttTt11B.1.20.000009
M204Y204del1taTta-11B.1.20.000009
M204Y204HTatCat11B.1.20.000009
M204Y204FtAttTt11B.1.2320.000537
M204Y204YtaTtaC11B.1.2320.000537
M204Y204delTAT---11B.1.2340.000132
M204Y204YtaTtaC11B.1.2340.000132
M204Y204del1taTta-11B.1.2580.000067
M204Y204delTAT---11B.1.258.110.000396
M204Y204XtaTtaA11B.1.258.170.000104
M204Y204YtaTtaC11B.1.351.20.000303
M204Y204YtaTtaC11B.1.360.000146
M204Y204YtaTtaC11B.1.36.290.000517
M204Y204YtaTtaC11B.1.3750.00082
M204Y204del2TAt--t11B.1.4500.011364
M204Y204YtaTtaC11B.1.5880.00091
M204Y204del2TAt--t11B.1.5960.000087
M204Y204FtAttTt11B.1.617.10.000129
M204Y204del2TAt--t11B.1.617.20.000004
M204Y204FtAttTt11B.1.617.20.000004
M204Y204LTATCTA11B.1.617.20.000004
M204Y204YtaTtaC11B.1.6210.000089
M204Y204YtaTtaC11B.1.6280.000352
M204Y204HTatCat11B.1.6340.003425
M204Y204YtaTtaC11B.550.00295
M204Y204YtaTtaC11C.370.000116
M204Y204YtaTtaC11D.20.000075
M204Y204YtaTtaC11N.30.005814
M204Y204XtaTtaA11P.10.000016
M204Y204HTatCat11P.10.000016
M204Y204YtaTtaC11P.1.120.000484