CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = E : Mut = S3S

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
E3S3SsyntcAtcT239970.40585826251-26253
E3S3SsyntcAtcC239920.38493726251-26253
E3S3SsyntcAtcG239500.20920526251-26253

Details of the mutation S3S within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
E3S3StcAtcT97239All0.000019
E3S3StcAtcC92239All0.000018
E3S3StcAtcG50239All0.00001
E3S3StcAtcC5162B.1.617.20.000192
E3S3StcAtcT1062B.1.617.20.000038
E3S3StcAtcG162B.1.617.20.000004
E3S3StcAtcT1123B.1.1.70.00001
E3S3StcAtcG623B.1.1.70.000005
E3S3StcAtcC623B.1.1.70.000005
E3S3StcAtcG1317AY.40.00002
E3S3StcAtcT317AY.40.000005
E3S3StcAtcC117AY.40.000002
E3S3StcAtcT1515B.1.1770.000198
E3S3StcAtcC711AY.50.000145
E3S3StcAtcT411AY.50.000083
E3S3StcAtcT810AY.250.000048
E3S3StcAtcG210AY.250.000012
E3S3StcAtcC59AY.1030.000031
E3S3StcAtcG39AY.1030.000019
E3S3StcAtcT19AY.1030.000006
E3S3StcAtcT67AY.440.000037
E3S3StcAtcG17AY.440.000006
E3S3StcAtcT47B.1.10.000073
E3S3StcAtcG27B.1.10.000036
E3S3StcAtcC17B.1.10.000018
E3S3StcAtcG47B.1.20.000035
E3S3StcAtcT37B.1.20.000026
E3S3StcAtcC77D.20.000525
E3S3StcAtcT66AH.10.857143
E3S3StcAtcT45AY.430.000018
E3S3StcAtcG15AY.430.000004
E3S3StcAtcC33AY.160.001139
E3S3StcAtcC23AY.390.000049
E3S3StcAtcT13AY.390.000025
E3S3StcAtcC33B.1.2350.007557
E3S3StcAtcT22AY.1170.000169
E3S3StcAtcG22AY.200.000078
E3S3StcAtcT22AY.270.000129
E3S3StcAtcT22AY.740.000231
E3S3StcAtcG12B.10.000009
E3S3StcAtcT12B.10.000009
E3S3StcAtcG22B.1.1.280.000622
E3S3StcAtcG22B.1.4270.000101
E3S3StcAtcT22P.10.000032
E3S3StcAtcC11AY.1000.000046
E3S3StcAtcT11AY.1020.000027
E3S3StcAtcT11AY.1130.000142
E3S3StcAtcG11AY.1190.000035
E3S3StcAtcG11AY.1200.000037
E3S3StcAtcC11AY.1210.000135
E3S3StcAtcC11AY.140.000088
E3S3StcAtcC11AY.290.000016
E3S3StcAtcG11AY.39.10.00004
E3S3StcAtcG11AY.450.000122
E3S3StcAtcG11AY.590.00053
E3S3StcAtcC11AY.610.000105
E3S3StcAtcT11AY.720.001361
E3S3StcAtcT11AY.910.00073
E3S3StcAtcT11AY.920.000287
E3S3StcAtcT11B0.000128
E3S3StcAtcG11B.1.1.2140.000055
E3S3StcAtcG11B.1.1.2360.006897
E3S3StcAtcG11B.1.1.5190.00004
E3S3StcAtcC11B.1.1110.001175
E3S3StcAtcG11B.1.177.600.000218
E3S3StcAtcG11B.1.2430.00007
E3S3StcAtcT11B.1.3510.00003
E3S3StcAtcT11B.1.621.10.000506
E3S3StcAtcT11C.370.000116
E3S3StcAtcT11P.1.10.000318
E3S3StcAtcT11P.1.60.001946
E3S3StcAtcT11P.20.000187