CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = E : CodonNum = 74 & Codon = ctA

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
E74L74LsynctGctA211222330.011031226464-26466

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
E74L74LctGctA23321122All0.000045
E74L74LctGctA1413206B.1.1.70.000013
E74L74LctGctA31369B.1.10.000054
E74L74LctGctA161234AY.1030.000099
E74L74LctGctA231007AY.40.000036
E74L74LctGctA10306B.1.617.20.000038
E74L74LctGctA8186AY.440.000049
E74L74LctGctA2164B.1.20.000018
E74L74LctGctA6154B.10.000055
E74L74LctGctA2153AY.430.000009
E74L74LctGctA8126AY.250.000048
E74L74LctGctA494AY.30.00004
E74L74LctGctA293P.10.000032
E74L74LctGctA6075AY.260.001699
E74L74LctGctA269AY.1190.000071
E74L74LctGctA247AY.290.000032
E74L74LctGctA144AY.320.000532
E74L74LctGctA139AY.390.000025
E74L74LctGctA236AY.1020.000053
E74L74LctGctA2930AY.270.001877
E74L74LctGctA118B.1.258.170.000104
E74L74LctGctA117B.1.5260.000024
E74L74LctGctA215AY.4.20.000043
E74L74LctGctA115P.1.140.000048
E74L74LctGctA114AY.470.000031
E74L74LctGctA112B0.000128
E74L74LctGctA111AY.9.20.000037
E74L74LctGctA17AY.1200.000037
E74L74LctGctA26A0.000774
E74L74LctGctA26AY.380.000999
E74L74LctGctA16AY.4.50.000107
E74L74LctGctA15AY.610.000105
E74L74LctGctA140.055556
E74L74LctGctA13AY.1100.000113
E74L74LctGctA33AY.630.001161
E74L74LctGctA33AY.70.000588
E74L74LctGctA13B.1.617.10.000129
E74L74LctGctA12A.10.000282
E74L74LctGctA12B.1.2340.000132
E74L74LctGctA22B.1.4040.002604
E74L74LctGctA12B.1.5170.000427
E74L74LctGctA12B.1.5960.000087
E74L74LctGctA12P.1.120.000484
E74L74LctGctA11AY.100.00053
E74L74LctGctA11AY.560.001605
E74L74LctGctA11B.1.1.1070.032258
E74L74LctGctA11B.1.1.1590.004673
E74L74LctGctA11B.1.1.280.000311
E74L74LctGctA11B.1.3330.010526
E74L74LctGctA11B.1.3960.000706